PROSITE logo

PROSITE entry PS00238

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   OPSIN; PATTERN.
AC   PS00238;
DT   01-APR-1990 CREATED; 01-DEC-2004 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Visual pigments (opsins) retinal binding site.
PA   [LIVMFWAC]-[PSGAC]-x-{G}-x-[SAC]-K-[STALIMR]-[GSACPNV]-[STACP]-x(2)-
PA   [DENF]-[AP]-x(2)-[IY].
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=231(230); /POSITIVE=219(218); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=12(12);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=2;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /SITE=7,retinal;
CC   /VERSION=1;
DR   Q9W6A9   , OP1S1_DANRE, T; Q9W6A8    , OP1S2_DANRE, T; 
DR Q9H1Y3 , OPN3_HUMAN , T; Q9WUK7 , OPN3_MOUSE , T;
DR Q2KNE5 , OPN4A_DANRE, T; Q804X9 , OPN4A_GADMO, T;
DR Q804Q2 , OPN4B_GADMO, T; O57422 , OPN4B_XENLA, T;
DR Q1JPS6 , OPN4L_DANRE, T; Q5YKK9 , OPN4_FELCA , T;
DR Q9UHM6 , OPN4_HUMAN , T; Q9QXZ9 , OPN4_MOUSE , T;
DR Q5XXP2 , OPN4_PHOSU , T; Q4U4D2 , OPN4_PODSI , T;
DR Q8R456 , OPN4_RAT , T; Q6XL69 , OPN4_RUTRU , T;
DR Q6U736 , OPN5_HUMAN , T; Q6VZZ7 , OPN5_MOUSE , T;
DR P22269 , OPS1_CALVI , T; P06002 , OPS1_DROME , T;
DR P28678 , OPS1_DROPS , T; O02464 , OPS1_MANSE , T;
DR Q94741 , OPS1_SCHGR , T; P08099 , OPS2_DROME , T;
DR P28679 , OPS2_DROPS , T; Q26495 , OPS2_SCHGR , T;
DR P04950 , OPS3_DROME , T; P28680 , OPS3_DROPS , T;
DR P08255 , OPS4_DROME , T; P29404 , OPS4_DROPS , T;
DR P17646 , OPS4_DROVI , T; P91657 , OPS5_DROME , T;
DR O01668 , OPS6_DROME , T; P51471 , OPSB_ANOCA , T;
DR P90680 , OPSB_APIME , T; P51490 , OPSB_BOVIN , T;
DR P32310 , OPSB_CARAU , T; P28682 , OPSB_CHICK , T;
DR O13227 , OPSB_CONCO , T; P35357 , OPSB_GEKGE , T;
DR P03999 , OPSB_HUMAN , T; P51491 , OPSB_MOUSE , T;
DR P87365 , OPSB_ORYLA , T; P60573 , OPSB_PANPA , T;
DR P60015 , OPSB_PANTR , T; P51472 , OPSB_PSAFA , T;
DR Q63652 , OPSB_RAT , T; O13092 , OPSB_SAIBB , T;
DR Q25157 , OPSC1_HEMSA, T; Q25158 , OPSC2_HEMSA, T;
DR Q95YI3 , OPSCE_BOMMO, T; Q90214 , OPSD1_ANGAN, T;
DR O15973 , OPSD1_MIZYE, T; Q90215 , OPSD2_ANGAN, T;
DR O15974 , OPSD2_MIZYE, T; O42294 , OPSD_ABYKO , T;
DR P52202 , OPSD_ALLMI , T; Q17094 , OPSD_ALLSU , T;
DR Q90245 , OPSD_AMBTI , T; P41591 , OPSD_ANOCA , T;
DR Q17053 , OPSD_APIME , T; P51470 , OPSD_AQUCT , T;
DR Q9YGZ1 , OPSD_ATHBO , T; O42300 , OPSD_BATMU , T;
DR O42301 , OPSD_BATNI , T; P02699 , OPSD_BOVIN , T;
DR P56514 , OPSD_BUFBU , T; Q6W3E1 , OPSD_CALPD , T;
DR Q17292 , OPSD_CAMAT , T; O18312 , OPSD_CAMHU , T;
DR O18315 , OPSD_CAMMA , T; O16018 , OPSD_CAMSC , T;
DR P32308 , OPSD_CANLF , T; P32309 , OPSD_CARAU , T;
DR Q17296 , OPSD_CATBO , T; Q9YGZ6 , OPSD_CHEAU , T;
DR Q9YGZ8 , OPSD_CHELB , T; Q9YGZ7 , OPSD_CHESA , T;
DR P22328 , OPSD_CHICK , T; O42327 , OPSD_COMDY , T;
DR Q90305 , OPSD_CORAU , T; O42307 , OPSD_COTBO , T;
DR O42328 , OPSD_COTGR , T; O42330 , OPSD_COTIN , T;
DR P28681 , OPSD_CRIGR , T; P51488 , OPSD_CYPCA , T;
DR P35359 , OPSD_DANRE , T; O62791 , OPSD_DELDE , T;
DR Q9YGZ4 , OPSD_DICLA , T; Q9YH05 , OPSD_DIPAN , T;
DR Q9YH04 , OPSD_DIPVU , T; P09241 , OPSD_ENTDO , T;
DR O16019 , OPSD_FAXVI , T; Q95KU1 , OPSD_FELCA , T;
DR O93441 , OPSD_GALML , T; P79756 , OPSD_GAMAF , T;
DR O62792 , OPSD_GLOME , T; Q9YGZ2 , OPSD_GOBNI , T;
DR P08100 , OPSD_HUMAN , T; O42268 , OPSD_ICTPU , T;
DR O16017 , OPSD_LACLU , T; Q90373 , OPSD_LEOKE , T;
DR P22671 , OPSD_LETCA , T; P79863 , OPSD_LEUER , T;
DR O42427 , OPSD_LIMBE , T; O42431 , OPSD_LIMPA , T;
DR Q9YH00 , OPSD_LITMO , T; P31355 , OPSD_LITPI , T;
DR P24603 , OPSD_LOLFO , T; Q68J47 , OPSD_LOXAF , T;
DR Q28886 , OPSD_MACFA , T; O62793 , OPSD_MESBI , T;
DR P15409 , OPSD_MOUSE , T; Q9YGZ9 , OPSD_MUGCE , T;
DR Q9YH01 , OPSD_MULSU , T; P79798 , OPSD_MYRBE , T;
DR P79807 , OPSD_MYRVI , T; P79808 , OPSD_NEOAR , T;
DR P79809 , OPSD_NEOAU , T; P79812 , OPSD_NEOSA , T;
DR O18481 , OPSD_ORCAU , T; P87369 , OPSD_ORYLA , T;
DR Q769E8 , OPSD_OTOCR , T; O62795 , OPSD_PAGGO , T;
DR O42452 , OPSD_PARKN , T; Q98980 , OPSD_PETMA , T;
DR O62794 , OPSD_PHOVI , T; O18766 , OPSD_PIG , T;
DR P79848 , OPSD_POERE , T; P35403 , OPSD_POMMI , T;
DR P35356 , OPSD_PROCL , T; O42451 , OPSD_PROJE , T;
DR O16020 , OPSD_PROML , T; O18485 , OPSD_PROOR , T;
DR O18486 , OPSD_PROSE , T; P41590 , OPSD_PSAFA , T;
DR P49912 , OPSD_RABIT , T; P56516 , OPSD_RANTE , T;
DR P51489 , OPSD_RAT , T; P56515 , OPSD_RHIMB , T;
DR Q9YGZ3 , OPSD_SALPV , T; P79898 , OPSD_SARDI , T;
DR P79901 , OPSD_SARMI , T; Q9YGZ0 , OPSD_SARPI , T;
DR P79902 , OPSD_SARPU , T; Q9YH03 , OPSD_SARSL , T;
DR P79903 , OPSD_SARSP , T; P79911 , OPSD_SARTI , T;
DR P79914 , OPSD_SARXA , T; O93459 , OPSD_SCYCA , T;
DR O16005 , OPSD_SEPOF , T; P02700 , OPSD_SHEEP , T;
DR Q8HY69 , OPSD_SMICR , T; Q9YGZ5 , OPSD_SOLSO , T;
DR Q9YH02 , OPSD_SPAAU , T; P35362 , OPSD_SPHSP , T;
DR O42466 , OPSD_TAUBU , T; Q9DGG4 , OPSD_TETNG , T;
DR P31356 , OPSD_TODPA , T; O62796 , OPSD_TRIMA , T;
DR O62798 , OPSD_TURTR , T; P29403 , OPSD_XENLA , T;
DR O42604 , OPSD_ZEUFA , T; Q9YGY9 , OPSD_ZOSOP , T;
DR P32311 , OPSG1_CARAU, T; Q9W6A5 , OPSG1_DANRE, T;
DR P22330 , OPSG1_PSAFA, T; P32312 , OPSG2_CARAU, T;
DR Q8AYM8 , OPSG2_DANRE, T; P0DN77 , OPSG2_HUMAN, T;
DR P22331 , OPSG2_PSAFA, T; Q8AYM7 , OPSG3_DANRE, T;
DR P0DN78 , OPSG3_HUMAN, T; P51474 , OPSG3_PSAFA, T;
DR Q9W6A6 , OPSG4_DANRE, T; Q9R024 , OPSG_CAVPO , T;
DR P28683 , OPSG_CHICK , T; P35358 , OPSG_GEKGE , T;
DR P04001 , OPSG_HUMAN , T; O35599 , OPSG_MOUSE , T;
DR P87366 , OPSG_ORYLA , T; O18910 , OPSG_RABIT , T;
DR O35476 , OPSG_RAT , T; O35478 , OPSG_SCICA , T;
DR P34989 , OPSL_CALJA , T; P35360 , OPSL_LIMPO , T;
DR P35361 , OPSO_LIMPO , T; Q7T3Q7 , OPSO_RUTRU , T;
DR O13018 , OPSO_SALSA , T; P51475 , OPSP_CHICK , T;
DR P51476 , OPSP_COLLI , T; O42266 , OPSP_ICTPU , T;
DR O42490 , OPSP_PETMA , T; Q9W6A7 , OPSR1_DANRE, T;
DR Q8AYN0 , OPSR2_DANRE, T; P41592 , OPSR_ANOCA , T;
DR Q9BGI7 , OPSR_BOVIN , T; O18914 , OPSR_CANLF , T;
DR Q95170 , OPSR_CAPHI , T; P32313 , OPSR_CARAU , T;
DR P22329 , OPSR_CHICK , T; O18913 , OPSR_FELCA , T;
DR O18912 , OPSR_HORSE , T; P04000 , OPSR_HUMAN , T;
DR P87367 , OPSR_ORYLA , T; P22332 , OPSR_PSAFA , T;
DR O12948 , OPSR_XENLA , T; O61303 , OPSUV_APIME, T;
DR Q90309 , OPSUV_CARAU, T; O57605 , OPSUV_MELUD, T;
DR P28684 , OPSV_CHICK , T; P87368 , OPSV_ORYLA , T;
DR P51473 , OPSV_XENLA , T; O14718 , OPSX_HUMAN , T;
DR O35214 , OPSX_MOUSE , T; P23820 , REIS_TODPA , T;
DR P47803 , RGR_BOVIN , T; P47804 , RGR_HUMAN , T;
DR P17645 , OPS3_DROVI , P; O18911 , OPSG_ODOVI , P;
DR Q4R1I4 , OPN4_BRABE , N; Q9Z2B3 , RGR_MOUSE , N;
DR A1W917 , EFTS_ACISJ , F; Q6UWM5 , GPRL1_HUMAN, F;
DR Q5ZYD0 , ICMS_LEGPH , F; Q9CL24 , OADB_PASMU , F;
DR P0DOK1 , POLSF_CHIKS, F; Q5WQY5 , POLS_CHIKN , F;
DR Q8JUX5 , POLS_CHIKS , F; P22056 , POLS_ONNVG , F;
DR O90371 , POLS_ONNVI , F; O90369 , POLS_ONNVS , F;
DR P0C211 , POL_HTL1L , F; Q99NF8 , RBP17_MOUSE, F;
3D 1F88; 1GZM; 1HZX; 1JFP; 1L9H; 1LN6; 1U19; 2G87; 2HPY; 2I35; 2I36; 2I37; 3D 2J4Y; 2PED; 2X72; 2Z73; 2ZIY; 3AYM; 3AYN; 3C9L; 3C9M; 3CAP; 3DQB; 3OAX; 3D 3PQR; 3PXO; 4A4M; 4BEY; 4BEZ; 4J4Q; 4PXF; 4WW3; 4X1H; 4ZWJ; 5DGY; 5DYS; 3D 5EN0; 5TE3; 5TE5; 5W0P; 5WKT; 6CMO; 6FK6; 6FK7; 6FK8; 6FK9; 6FKA; 6FKB; 3D 6FKC; 6FKD; 6FUF; 6NWE; 6OFJ; 6OY9; 6OYA; 6PEL; 6PGS; 6PH7; 6QNO; 7MT8; 3D 7MT9; 7MTA; 7MTB; 7ZBC; 7ZBE; 8A6C; 8A6D; 8A6E; 8FCZ; 8FD0; 8FD1; DO PDOC00211; //