PROSITE logo

PROSITE entry PS01117

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   HTH_MARR_1; PATTERN.
AC   PS01117;
DT   01-NOV-1995 CREATED; 01-APR-2006 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   MarR-type HTH domain signature.
PA   [STNAQ]-[LIAMV]-x(0,1)-[RNGSYKE]-x(4,5)-[LM]-[EIVLA]-x(2)-[GESD]-
PA   [LFYWHA]-[LIVC]-x(7)-[DNS]-[RKQG]-[RK]-x(6)-[TS]-x(2)-[GAS].
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=123(123); /POSITIVE=123(123); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=68; /PARTIAL=0;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /VERSION=2;
DR   O07458   , BADR_RHOPA , T; P96440    , EXPG_RHIME , T; 
DR P0DPR8 , FARR_NEIGO , T; O33817 , HCRR_THAAR , T;
DR Q9F8R8 , HOSA_ECO11 , T; P69782 , HOSA_ECO27 , T;
DR Q7ABA6 , HOSA_ECO57 , T; Q93CC3 , HOSA_ECOLX , T;
DR P62573 , HPCR_ECOLX , T; P62574 , HPCR_SHIFL , T;
DR C3P2U9 , HPR_BACAA , T; C3LCW8 , HPR_BACAC , T;
DR A0RAQ6 , HPR_BACAH , T; Q81JG1 , HPR_BACAN , T;
DR B7JCX5 , HPR_BACC0 , T; Q73CB7 , HPR_BACC1 , T;
DR B7IKC1 , HPR_BACC2 , T; C1EKG1 , HPR_BACC3 , T;
DR B7HG19 , HPR_BACC4 , T; B7HZH8 , HPR_BACC7 , T;
DR A7GLZ1 , HPR_BACCN , T; B9IT66 , HPR_BACCQ , T;
DR Q813W6 , HPR_BACCR , T; Q63EV6 , HPR_BACCZ , T;
DR Q6HMB8 , HPR_BACHK , T; Q65LS8 , HPR_BACLD , T;
DR A9VI69 , HPR_BACMK , T; A8FBL1 , HPR_BACP2 , T;
DR P11065 , HPR_BACSU , T; A7Z311 , HPR_BACVZ , T;
DR B1YK88 , HPR_EXIS2 , T; Q5L293 , HPR_GEOKA , T;
DR C5D6L6 , HPR_GEOSW , T; A4IKT9 , HPR_GEOTN , T;
DR Q9KDM7 , HPR_HALH5 , T; B1HVK6 , HPR_LYSSC , T;
DR Q5WHU1 , HPR_SHOC1 , T; P67748 , HTMR_MYCBO , T;
DR P9WME8 , HTMR_MYCTO , T; P9WME9 , HTMR_MYCTU , T;
DR P27245 , MARR_ECOLI , T; P0A2T5 , MARR_SALTI , T;
DR P0A2T4 , MARR_SALTY , T; Q2G0B1 , MGRA_STAA8 , T;
DR Q5HHY2 , MGRA_STAAC , T; Q99VT5 , MGRA_STAAM , T;
DR Q7A6X2 , MGRA_STAAN , T; Q6GIV6 , MGRA_STAAR , T;
DR Q6GBE4 , MGRA_STAAS , T; P0C1S0 , MGRA_STAAU , T;
DR Q7A1J9 , MGRA_STAAW , T; O31672 , MHQR_BACSU , T;
DR P0ACS1 , MPRA_ECO57 , T; P0ACS0 , MPRA_ECOL6 , T;
DR P0ACR9 , MPRA_ECOLI , T; P42193 , PAPX_ECOLX , T;
DR P40762 , PCHR_BACSU , T; P42195 , PECS_DICD3 , T;
DR P31078 , PETP_RHOCB , T; P62089 , PRSX_ECOL6 , T;
DR P62088 , PRSX_ECOLX , T; Q7VR54 , SLYA_BLOFL , T;
DR Q492T9 , SLYA_BLOPB , T; A7ZMA4 , SLYA_ECO24 , T;
DR P0A4U5 , SLYA_ECO27 , T; B7M9Z6 , SLYA_ECO45 , T;
DR B7L5J5 , SLYA_ECO55 , T; P0A8W3 , SLYA_ECO57 , T;
DR B5Z476 , SLYA_ECO5E , T; B7NTZ0 , SLYA_ECO7I , T;
DR B7MVC0 , SLYA_ECO81 , T; B7M0J9 , SLYA_ECO8A , T;
DR C4ZYA5 , SLYA_ECOBW , T; B1XFV4 , SLYA_ECODH , T;
DR A8A0I5 , SLYA_ECOHS , T; P0A4U4 , SLYA_ECOL6 , T;
DR P0A8W2 , SLYA_ECOLI , T; B7NB96 , SLYA_ECOLU , T;
DR B1LEP4 , SLYA_ECOSM , T; C5BE36 , SLYA_EDWI9 , T;
DR Q9F6B2 , SLYA_EDWTA , T; B5XWN4 , SLYA_KLEP3 , T;
DR Q6D5V7 , SLYA_PECAS , T; Q9RB09 , SLYA_PECCC , T;
DR C6DK30 , SLYA_PECCP , T; P61090 , SLYA_SALCH , T;
DR Q5PH01 , SLYA_SALPA , T; C0Q5T8 , SLYA_SALPC , T;
DR B5BKC5 , SLYA_SALPK , T; P61091 , SLYA_SALTI , T;
DR P40676 , SLYA_SALTY , T; A8GDX5 , SLYA_SERP5 , T;
DR Q9RA96 , SLYA_SERS3 , T; B2U2E2 , SLYA_SHIB3 , T;
DR P0A8W4 , SLYA_SHIFL , T; Q2NT07 , SLYA_SODGM , T;
DR Q8D2L8 , SLYA_WIGBR , T; A1JNY1 , SLYA_YERE8 , T;
DR Q9S3W0 , SLYA_YEREN , T; A7FHL4 , SLYA_YERP3 , T;
DR Q1C786 , SLYA_YERPA , T; P69988 , SLYA_YERPE , T;
DR A9QZA1 , SLYA_YERPG , T; Q1CIM0 , SLYA_YERPN , T;
DR A4TIR6 , SLYA_YERPP , T; P69989 , SLYA_YERPS , T;
DR B1JJ73 , SLYA_YERPY , T; P62087 , Y2060_STAAN, T;
DR O33060 , Y2140_MYCLE, T; Q6G757 , Y2155_STAAS, T;
DR Q8NVA6 , Y2183_STAAW, T; Q5HDU4 , Y2256_STAAC, T;
DR P62086 , Y2265_STAAM, T; Q6GEG9 , Y2349_STAAR, T;
DR P9WMF0 , Y880_MYCTO , T; P9WMF1 , Y880_MYCTU , T;
DR P67746 , Y904_MYCBO , T; O31541 , YETL_BACSU , T;
DR Q796S4 , YHJH_BACSU , T; O34949 , YKOM_BACSU , T;
DR P25150 , YWAE_BACSU , T; P42103 , YXAD_BACSU , T;
DR P37503 , YYBA_BACSU , T;
DR Q04I02 , ADCR_STRP2 , N; Q5XEA3 , ADCR_STRP6 , N;
DR B0FXI7 , IACR_PSEPU , N; P52003 , MEXR_PSEAE , N;
DR I6Y8F7 , MMPR5_MYCTU, N; Q88FY0 , NICR_PSEPK , N;
DR O34777 , OHRR_BACSU , N; Q2FEB2 , SARZ_STAA3 , N;
DR Q2FVN3 , SARZ_STAA8 , N; Q2YZ47 , SARZ_STAAB , N;
DR Q5HDG9 , SARZ_STAAC , N; Q99RP3 , SARZ_STAAM , N;
DR Q7A3V0 , SARZ_STAAN , N; Q6GE46 , SARZ_STAAR , N;
DR Q6G6T5 , SARZ_STAAS , N; Q8NV32 , SARZ_STAAW , N;
DR Q5HLK8 , SARZ_STAEQ , N; Q8CN77 , SARZ_STAES , N;
DR Q4L8Q3 , SARZ_STAHJ , N; Q49ZX3 , SARZ_STAS1 , N;
DR Q8XA02 , SGRR_ECO57 , N; A1A7B8 , SGRR_ECOK1 , N;
DR Q0TLR9 , SGRR_ECOL5 , N; Q8FL80 , SGRR_ECOL6 , N;
DR P33595 , SGRR_ECOLI , N; Q1RGC7 , SGRR_ECOUT , N;
DR Q6D0F8 , SGRR_PECAS , N; Q7N125 , SGRR_PHOLL , N;
DR Q57TF2 , SGRR_SALCH , N; Q5PDG5 , SGRR_SALPA , N;
DR Q8Z9I4 , SGRR_SALTI , N; Q8ZRV0 , SGRR_SALTY , N;
DR Q326G6 , SGRR_SHIBS , N; Q32K24 , SGRR_SHIDS , N;
DR Q0T8C8 , SGRR_SHIF8 , N; Q83SP3 , SGRR_SHIFL , N;
DR Q3Z5U2 , SGRR_SHISS , N; A1JJG7 , SGRR_YERE8 , N;
DR Q1C1Y8 , SGRR_YERPA , N; Q74Q56 , SGRR_YERPE , N;
DR Q1CMQ0 , SGRR_YERPN , N; A4TQA7 , SGRR_YERPP , N;
DR Q66EM6 , SGRR_YERPS , N; Q8KM02 , SLYA_PHOLL , N;
DR Q9F4G3 , TCAR_STAAC , N; A6QJJ8 , TCAR_STAAE , N;
DR P0DX95 , TTMR_METEP , N; A0RCV1 , Y1720_BACAH, N;
DR Q63CL4 , Y1758_BACCZ, N; Q6HK19 , Y1775_BACHK, N;
DR Q81EN2 , Y1936_BACCR, N; Q81RU6 , Y1941_BACAN, N;
DR Q739W8 , Y2019_BACC1, N; O31443 , YBFA_BACSU , N;
DR O31472 , YCGE_BACSU , N; P96625 , YDCH_BACSU , N;
DR P96705 , YDGG_BACSU , N; P96708 , YDGJ_BACSU , N;
DR O31564 , YFIV_BACSU , N; O31592 , YHBI_BACSU , N;
DR O07570 , YHJP_BACSU , N; P54182 , YPOP_BACSU , N;
DR P97247 , YSMB_BACSU , N; O32181 , YUSO_BACSU , N;
DR O34692 , YVNA_BACSU , N; P70993 , YWHA_BACSU , N;
DR P94578 , YWOH_BACSU , N; A2RNS2 , ZITR_LACLM , N;
3D 1JGS; 2BV6; 2FXA; 3DEU; 3Q5F; 3QPT; 3VB2; 3VOD; 3VOE; 4AIH; 4AIJ; 4AIK; 3D 4EM0; 4EM1; 4EM2; 4JBA; 4YIF; 5H3R; 5HSM; 5HSO; 5X7Z; 5X80; 7WZE; 8AGA; 3D 8PQ4; DO PDOC00861; //