PROSITE logo

PROSITE entry PS50171

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   ZF_MATRIN; MATRIX.
AC   PS50171;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger matrin-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=33;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=30;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5940000; R2=0.0123623; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1566.0997314; R2=1.6650832; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=559; H_SCORE=2497; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=397; H_SCORE=2227; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-22,-27,-26,-21,37,-30,-1,2,-12,2,1,-18,-27,-18,-11,-19,-10,-4,13,46,-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-12,-27,-15,-10,25,-25,5,-8,-8,-5,-5,-7,-25,-11,-2,-14,-9,-13,7,38,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-13,11,-32,22,25,-33,-17,-7,-30,12,-27,-20,1,15,6,0,-4,-10,-28,-30,-20,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-27,-27,-31,-24,20,-33,-10,21,-23,19,11,-22,-27,-18,-20,-22,-10,9,0,30,-24;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-20,6,0,-22,-1,-1,-23,-5,-21,-15,5,-14,-2,-7,13,1,-16,-33,-15,-2;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-2,-2,-10,-11,-10,-18,-12,-10,-11,-3,-7,4,-21,-10,-5,1,10,-8,-32,-13,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-26,-30,-30,-22,34,-27,-10,-5,-14,1,-3,-23,-28,-21,-12,-24,-14,-10,38,37,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-21,-22,-24,-20,14,-29,0,9,-20,13,7,-18,-26,-16,-16,-16,-3,5,-8,23,-20;
MA   /M: SY='T'; M=0,-1,-17,-8,-8,-7,-15,-6,-12,-3,-14,-10,2,-15,-6,-6,9,17,-8,-17,6,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-12,16,-25,11,-1,-22,-1,22,-27,-3,-25,-14,24,-18,0,3,2,-5,-26,-32,-10,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,17,-27,23,21,-30,6,-4,-32,-2,-27,-22,12,-10,3,-8,5,-8,-28,-32,-22,12;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-4,-24,-3,6,-24,-6,-10,-26,7,-25,-16,0,-1,2,11,7,2,-19,-28,-18,2;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=1,-10,-21,-9,-2,-17,-12,-12,-13,1,-13,-9,-8,15,-3,0,-2,-4,-12,-20,-14,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=6,-12,-13,-16,-13,-7,-14,-12,0,-12,-8,1,-9,-18,-10,-13,10,10,8,-25,-4,-12;
MA   /M: SY='F'; M=2,-24,-14,-30,-24,21,-24,-23,10,-22,9,3,-21,-25,-27,-19,-9,-1,18,-15,2,-24;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-10,1,-23,4,22,-22,-15,0,-22,17,-17,-10,0,-7,16,21,-4,-8,-20,-19,-11,18; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-16,0,2,-14,-9,-1,-16,18,-15,-7,7,-9,4,22,-3,-4,-13,-14,-7,2; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=3,1,-10,-6,-7,-2,-9,-10,-10,-9,-12,-10,6,-11,-8,-9,13,16,-6,-21,-8,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-14,25,-21,-14,7,-26,-19,-12,-21,0,-7,-12,-27,-21,-19,-10,-3,-7,-27,-8,-16;
MA   /M: SY='S'; M=2,-4,-19,-8,-5,-20,-7,-10,-13,2,-18,-9,1,-17,0,3,6,-1,-6,-28,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-25,-1,2,-28,34,-13,-33,-11,-28,-20,2,-13,-7,-13,10,-8,-25,-27,-25,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-9,-28,-9,3,-17,-21,-12,-20,18,-14,-8,-8,-15,2,16,-11,-5,-16,-3,-5,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-29,-5,0,-22,-18,-6,-19,18,-22,-10,7,-4,3,26,-7,-8,-18,-25,-13,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-27,-11,-2,-16,-22,-8,-11,17,-11,-2,-8,-15,5,7,-11,-9,-10,-14,2,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,3,-28,5,15,-23,-20,13,-23,9,-19,-9,1,-12,19,9,-3,-5,-23,-20,0,16;
MA   /M: SY='N'; M=-10,19,-24,7,-4,-21,0,10,-18,0,-25,-13,34,-19,-2,-1,2,-6,-24,-33,-14,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-16,-21,-13,-2,-26,-18,11,-17,17,12,-20,-22,-14,-15,-10,5,14,-26,-7,-13;
MA   /M: SY='R'; M=7,-5,-22,-6,7,-23,-12,-9,-23,16,-20,-12,-2,-12,4,19,2,-4,-14,-23,-15,4;
MA   /M: SY='K'; M=-14,0,3,1,-1,-25,-21,-10,-28,16,-22,-10,-2,-19,-1,16,-9,-10,-17,-30,-15,-2;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=84(83); /POSITIVE=84(83); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=50; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=Matrin-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9FG01   , ATO_ARATH  , T; Q9ULV3    , CIZ1_HUMAN , T; 
DR P43243 , MATR3_HUMAN, T; Q8K310 , MATR3_MOUSE, T;
DR P43244 , MATR3_RAT , T; O46106 , NOI_DROME , T;
DR P19736 , PRP9_YEAST , T; Q5T481 , RBM20_HUMAN, T;
DR Q3UQS8 , RBM20_MOUSE, T; P0DW16 , RBM20_PIG , T;
DR E9PT37 , RBM20_RAT , T; E3LAN7 , RU1C1_PUCGT, T;
DR C5XZK6 , RU1C1_SORBI, T; E3KIY6 , RU1C2_PUCGT, T;
DR C5XYW4 , RU1C2_SORBI, T; Q16IW3 , RU1C_AEDAE , T;
DR C0NN85 , RU1C_AJECG , T; E3X5D6 , RU1C_ANODA , T;
DR Q7PXU6 , RU1C_ANOGA , T; Q56XE4 , RU1C_ARATH , T;
DR Q4WQM6 , RU1C_ASPFU , T; F4NYQ2 , RU1C_BATDJ , T;
DR Q32PA0 , RU1C_BOVIN , T; C3Z1P5 , RU1C_BRAFL , T;
DR A8XW44 , RU1C_CAEBR , T; P90815 , RU1C_CAEEL , T;
DR Q59P44 , RU1C_CANAL , T; C4YIU5 , RU1C_CANAW , T;
DR E2RGI3 , RU1C_CANLF , T; E1C6F0 , RU1C_CHICK , T;
DR Q1RLC9 , RU1C_CIOIN , T; A8NYM5 , RU1C_COPC7 , T;
DR Q5KC16 , RU1C_CRYNJ , T; Q8JGS0 , RU1C_DANRE , T;
DR Q54YA5 , RU1C_DICDI , T; Q9VE17 , RU1C_DROME , T;
DR Q298E0 , RU1C_DROPS , T; Q5BBX9 , RU1C_EMENI , T;
DR C7YRT4 , RU1C_FUSV7 , T; D3B3B7 , RU1C_HETP5 , T;
DR P09234 , RU1C_HUMAN , T; B7Q2M2 , RU1C_IXOSC , T;
DR F6TFD9 , RU1C_MACMU , T; F7ARS3 , RU1C_MONDO , T;
DR Q62241 , RU1C_MOUSE , T; A7SEP9 , RU1C_NEMVE , T;
DR Q1K7T5 , RU1C_NEUCR , T; E0VI98 , RU1C_PEDHC , T;
DR D0NHA2 , RU1C_PHYIT , T; Q4YBG7 , RU1C_PLABA , T;
DR Q4XRM7 , RU1C_PLACU , T; Q8IAW3 , RU1C_PLAF7 , T;
DR B3LC82 , RU1C_PLAKH , T; A5JZQ2 , RU1C_PLAVS , T;
DR Q7RNM5 , RU1C_PLAYO , T; D3ZCL3 , RU1C_RAT , T;
DR Q9P794 , RU1C_SCHPO , T; A7EYK3 , RU1C_SCLS1 , T;
DR Q4UJ14 , RU1C_THEAN , T; Q4N6K2 , RU1C_THEPA , T;
DR D5GDH4 , RU1C_TUBMM , T; Q4P2Q5 , RU1C_USTMA , T;
DR F6HQ26 , RU1C_VITVI , T; Q03369 , RU1C_XENLA , T;
DR B0JYS7 , RU1C_XENTR , T; Q05900 , RU1C_YEAST , T;
DR O59706 , SAP61_SCHPO, T; Q9P7L8 , SAP62_SCHPO, T;
DR A5PJN8 , SF3A2_BOVIN, T; Q15428 , SF3A2_HUMAN, T;
DR Q62203 , SF3A2_MOUSE, T; Q6AXT8 , SF3A2_RAT , T;
DR Q12874 , SF3A3_HUMAN, T; Q9D554 , SF3A3_MOUSE, T;
DR Q5F457 , WBP4_CHICK , T; O75554 , WBP4_HUMAN , T;
DR Q61048 , WBP4_MOUSE , T; Q5HZF2 , WBP4_RAT , T;
DR O60138 , YNS7_SCHPO , T; Q8BZ94 , ZMAT4_MOUSE, T;
DR Q14966 , ZN638_HUMAN, T; Q61464 , ZN638_MOUSE, T;
DR Q7XA66 , ZOP1_ARATH , T;
DR Q9H3H1 , MOD5_HUMAN , N; Q80UN9 , MOD5_MOUSE , N;
DR Q9UT75 , MOD5_SCHPO , N; P07884 , MOD5_YEAST , N;
DR Q07350 , PRP11_YEAST, N; Q3ZBR0 , SCNM1_BOVIN, N;
DR Q2YDS5 , SCNM1_DANRE, N; Q9BWG6 , SCNM1_HUMAN, N;
DR Q8K136 , SCNM1_MOUSE, N; Q3KQ71 , SCNM1_XENLA, N;
DR Q54B65 , SF3A2_DICDI, N; P34670 , SNU23_CAEEL, N;
DR Q09776 , SNU23_SCHPO, N; D2HS90 , STPAP_AILME, N;
DR Q1JPD6 , STPAP_BOVIN, N; Q4KMD7 , STPAP_DANRE, N;
DR Q9H6E5 , STPAP_HUMAN, N; Q8R3F9 , STPAP_MOUSE, N;
DR Q3MHT4 , STPAP_RAT , N; A9JTS5 , STPAP_XENTR, N;
DR O64571 , UBA1C_ARATH, N; Q9V468 , Y9776_DROME, N;
DR Q96PM9 , Z385A_HUMAN, N; Q8VD12 , Z385A_MOUSE, N;
DR Q6PBT9 , Z385B_DANRE, N; Q569K4 , Z385B_HUMAN, N;
DR Q8BXJ8 , Z385B_MOUSE, N; Q66K41 , Z385C_HUMAN, N;
DR A2A5E6 , Z385C_MOUSE, N; Q9H6B1 , Z385D_HUMAN, N;
DR Q6AXX3 , Z385D_RAT , N; Q5H9K5 , ZMAT1_HUMAN, N;
DR Q3V0C1 , ZMAT1_MOUSE, N; Q28EG9 , ZMAT1_XENTR, N;
DR Q96NC0 , ZMAT2_HUMAN, N; Q9CPW7 , ZMAT2_MOUSE, N;
DR Q0IIC4 , ZMAT3_BOVIN, N; Q9HA38 , ZMAT3_HUMAN, N;
DR O54836 , ZMAT3_MOUSE, N; O08781 , ZMAT3_RAT , N;
DR Q0VD35 , ZMAT4_BOVIN, N; Q9H898 , ZMAT4_HUMAN, N;
DR Q5VUA4 , ZN318_HUMAN, N; Q99PP2 , ZN318_MOUSE, N;
DR A2RV29 , ZN346_DANRE, N; Q9UL40 , ZN346_HUMAN, N;
DR Q9R0B7 , ZN346_MOUSE, N; Q5R4W8 , ZN346_PONAB, N;
DR Q8AVN9 , ZN346_XENLA, N; B0JZ85 , ZN346_XENTR, N;
3D 1ZU1; 2MKD; 2MKN; 2VRD; 3CW1; 3EPH; 3EPJ; 3EPK; 3EPL; 4DGW; 4PJO; 5GM6; 3D 5NRL; 5O9Z; 5Z56; 5Z57; 5Z58; 5ZWM; 5ZWN; 5ZWO; 6AH0; 6AHD; 6FF4; 6FF7; 3D 6G90; 6N7P; 6N7R; 6N7X; 6QX9; 6Y50; 6Y53; 6Y5Q; 7AAV; 7ABF; 7ABG; 7ABH; 3D 7ABI; 7DVQ; 7EVO; 7ONB; 7OQB; 7OQC; 7OQE; 7Q3L; 7Q4O; 7Q4P; 7QTT; 7VPX; 3D 8CH6; 8HK1; 8IDF; PR PRU00130; DO PDOC50171; //