PROSITE entry PS50192
View entry in NiceSite formatView entry in raw text format (no links)
ID T_SNARE; MATRIX. AC PS50192; DT 01-APR-2002 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE t-SNARE coiled-coil homology domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63; TOPOLOGY=LINEAR; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8449000; R2=0.0289058; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1075.6915283; R2=0.6478149; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=231; H_SCORE=1225; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; H_SCORE=1181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MM=5; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-5; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='D'; M=-12,-1,-25,7,-11,-20,-18,-2,-19,-8,-12,-10,-5,-15,-5,-8,-8,-10,-17,-26,-9,-2; MA /M: SY='A'; M=1,-10,-23,-12,-9,-20,-13,-10,-14,-9,-17,-11,-8,-10,-3,-14,1,-5,-14,-25,-14,-6; MA /M: SY='M'; M=-15,-19,-21,-19,-18,-7,-26,-10,1,-17,1,4,-20,-17,-12,-15,-12,-5,-4,-19,2,-13; MA /M: SY='E'; M=-11,-10,-28,-9,2,-16,-25,-12,-8,-10,-11,-8,-16,-15,-6,-13,-11,-8,-4,-26,-14,-3; MA /M: SY='Q'; M=-16,-4,-27,2,0,-27,-18,-2,-22,-3,-18,-12,-2,-13,10,2,-3,-8,-23,-28,-13,8; MA /M: SY='E'; M=-8,0,-27,8,20,-31,-15,-5,-28,0,-24,-19,-5,-6,6,-8,1,-7,-26,-30,-18,15; MA /M: SY='R'; M=-18,-7,-26,-9,-4,-21,-16,-6,-18,4,-30,-10,3,-17,7,21,0,-6,-17,-29,-17,0; MA /M: SY='D'; M=-12,0,-25,12,-11,-19,-19,6,-19,-14,-11,-12,-7,-15,-11,-16,-9,-13,-15,-28,-7,-5; MA /M: SY='E'; M=-13,-1,-29,5,8,-29,-13,-5,-29,4,-25,-16,-6,-11,5,3,-3,-10,-25,-27,-16,7; MA /M: SY='E'; M=-8,1,-22,1,-2,-24,-9,-3,-22,-6,-23,-15,3,-11,-1,-9,5,-2,-23,-30,-16,2; MA /M: SY='L'; M=-9,-23,-23,-27,-21,-1,-27,-22,8,-27,13,7,-25,-22,-17,-23,-14,1,8,-23,-9,-20; MA /M: SY='E'; M=-14,-8,-26,-2,-1,-24,-13,-8,-20,-5,-16,-10,-8,-12,-4,-2,-6,-8,-18,-27,-15,0; MA /M: SY='Q'; M=-7,-8,-26,-8,-6,-26,-12,-6,-21,-1,-18,-9,-5,-14,3,1,-3,-5,-20,-25,-14,-1; MA /M: SY='I'; M=-16,-28,-23,-32,-26,0,-30,-25,24,-26,10,15,-24,-24,-21,-21,-20,-7,17,-26,-9,-24; MA /M: SY='E'; M=-5,-8,-23,-2,-8,-21,-10,-2,-21,-11,-15,-13,-5,-12,-7,-10,-1,-8,-18,-28,-15,-1; MA /M: SY='R'; M=-7,-7,-24,-8,-9,-24,-6,-8,-25,0,-24,-13,-4,-13,-2,2,4,-1,-20,-27,-16,-5; MA /M: SY='S'; M=-7,-12,-21,-13,-22,-17,-10,-12,-10,-12,-14,-7,-8,-15,-13,-12,2,0,-8,-28,-12,-15; MA /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-32,-25,-3,-30,-26,20,-30,9,8,-26,-22,-19,-28,-16,-7,16,-23,-9,-25; MA /M: SY='Q'; M=-8,-17,-24,-15,-14,-21,-6,-12,-17,-9,-14,-9,-10,-15,-5,-4,-4,-6,-15,-24,-14,-7; MA /M: SY='E'; M=-10,2,-26,8,10,-27,-17,-5,-25,-2,-21,-17,-1,-10,-2,-4,-2,-5,-22,-30,-17,5; MA /M: SY='L'; M=-13,-27,-21,-28,-21,2,-26,-22,12,-25,12,8,-24,-25,-18,-18,-19,-9,7,-25,-9,-19; MA /M: SY='K'; M=-12,-5,-27,-2,-14,-25,-12,6,-28,10,-26,-13,1,-14,-3,11,-6,-12,-22,-25,-11,-3; MA /M: SY='N'; M=-12,1,-22,2,-6,-26,-7,-4,-24,-8,-24,-16,0,-14,-5,-10,1,-6,-21,-31,-16,-5; MA /M: SY='M'; M=-9,-30,-22,-34,-35,-1,-26,-18,22,-28,19,24,-28,-21,-21,-26,-19,-10,12,-21,-3,-26; MA /M: SY='F'; M=2,-15,-22,-21,-17,11,2,-19,-24,-23,-20,-19,-11,-19,-20,-21,0,-6,-15,-13,-9,-17; MA /M: SY='M'; M=-12,-23,-23,-23,-22,-12,-21,-5,0,-18,4,6,-15,-20,-6,-12,-13,-8,-5,-24,-5,-11; MA /M: SY='D'; M=-16,10,-29,20,5,-31,-15,-3,-31,-1,-25,-19,0,-11,1,-2,-4,-8,-26,-30,-16,4; MA /M: SY='M'; M=-17,-24,-22,-30,-24,1,-27,-20,16,-23,6,18,-21,-22,-17,-17,-17,-2,10,-25,-8,-20; MA /M: SY='G'; M=5,-14,-23,-11,-26,-23,17,-11,-24,-21,-17,-13,-9,-16,-16,-21,-2,-13,-18,-23,-20,-15; MA /M: SY='B'; M=-11,-4,-25,-2,-8,-21,-13,0,-18,-9,-17,-8,-6,-15,-7,-11,-2,-5,-14,-29,-12,-8; MA /M: SY='E'; M=-12,-13,-25,-9,2,-16,-21,-3,-10,-10,-2,4,-17,-12,-1,-10,-11,-13,-14,-25,-10,4; MA /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-30,-25,3,-30,-27,14,-30,16,4,-31,-27,-24,-25,-19,-4,19,-23,-9,-25; MA /M: SY='E'; M=-15,-2,-26,7,6,-26,-17,-6,-22,-4,-19,-16,-5,-11,-2,-6,-4,-8,-19,-30,-15,5; MA /M: SY='E'; M=-8,-1,-20,4,4,-26,-13,-3,-25,-9,-21,-17,-3,-11,-4,-12,2,-3,-21,-32,-16,1; MA /M: SY='Q'; M=-19,0,-31,2,16,-41,-19,6,-25,7,-37,-8,0,-10,53,9,-1,-12,-33,-24,-17,36; MA /M: SY='G'; M=-4,3,-24,5,-21,-27,18,-7,-31,-14,-30,-21,10,-15,-13,-14,5,-10,-26,-30,-23,-10; MA /M: SY='E'; M=-12,-3,-28,2,16,-26,-20,-7,-24,0,-21,-16,-8,-4,3,-5,-1,-5,-22,-29,-17,10; MA /M: SY='M'; M=-12,-20,-23,-23,-23,-12,-23,-8,4,-13,1,14,-18,-19,-3,-10,-12,-8,-2,-21,-4,-10; MA /M: SY='L'; M=-13,-31,-26,-33,-26,3,-33,-26,21,-32,22,11,-31,-26,-22,-27,-24,-9,17,-22,-7,-25; MA /M: SY='D'; M=-18,23,-25,32,-1,-28,-12,-3,-31,-9,-26,-25,14,-12,-8,-13,1,-3,-27,-35,-17,-1; MA /M: SY='R'; M=-14,-2,-27,0,-8,-26,-11,-4,-27,3,-23,-15,2,-16,-3,13,-4,-7,-22,-27,-15,-6; MA /M: SY='I'; M=-19,-30,-28,-37,-30,3,-35,-27,34,-28,6,18,-22,-22,-21,-25,-22,-11,19,-22,-5,-27; MA /M: SY='E'; M=-9,6,-25,18,5,-27,-12,-6,-28,-8,-21,-20,-3,-8,-5,-14,0,-6,-22,-31,-19,7; MA /M: SY='E'; M=-9,0,-25,2,-1,-20,-13,0,-23,-6,-22,-16,-3,-13,-5,-10,1,-4,-20,-25,-7,-3; MA /M: SY='N'; M=-11,11,-22,5,-11,-22,-2,1,-23,-7,-26,-18,20,-16,-9,-8,4,-5,-26,-33,-17,-7; MA /M: SY='V'; M=-8,-26,-16,-29,-24,3,-25,-24,7,-26,5,4,-28,-26,-22,-23,-15,-4,16,-22,-9,-23; MA /M: SY='D'; M=-17,9,-28,22,10,-29,-13,-1,-28,-10,-21,-20,-1,-9,-3,-13,-3,-9,-26,-32,-15,6; MA /M: SY='N'; M=-13,5,-24,5,-9,-24,-10,6,-24,-8,-24,-14,9,-15,-3,-7,3,-2,-24,-31,-11,-5; MA /M: SY='T'; M=-2,-11,-18,-18,-17,-12,-15,-20,-1,-16,-17,-5,-5,-17,-15,-16,1,7,1,-30,-17,-16; MA /M: SY='D'; M=-9,-3,-23,3,-15,-19,-16,-2,-19,-10,-18,-12,-4,-14,-8,-11,-1,-4,-14,-29,-12,-4; MA /M: M=-10,-10,-24,-7,-15,-14,-15,-13,-10,-16,-8,-8,-13,-18,-17,-16,-7,-5,-6,-27,-12,-16; MA /M: SY='N'; M=-16,1,-26,1,-14,-16,-16,2,-20,-3,-19,-13,2,-17,-7,2,-6,-9,-20,-22,-2,-8; MA /M: SY='I'; M=-10,-25,-22,-28,-24,-1,-28,-24,14,-27,11,7,-26,-24,-20,-23,-15,-3,16,-25,-10,-23; MA /M: SY='E'; M=-12,-2,-27,3,1,-29,-14,-3,-28,6,-25,-16,-1,-10,5,4,-3,-7,-25,-27,-14,6; MA /M: SY='Q'; M=-8,-11,-25,-11,-12,-23,-12,-9,-15,-5,-16,-6,-9,-16,-6,-5,-6,-6,-12,-26,-13,-8; MA /M: SY='A'; M=13,-10,-17,-15,-12,-22,2,-21,-17,-11,-30,-16,-7,-13,-11,-14,7,1,-7,-27,-24,-10; MA /M: SY='N'; M=-9,-2,-21,0,-19,-16,-15,0,-16,-10,-17,-9,2,-16,-9,-7,0,-5,-13,-30,-12,-7; MA /M: SY='R'; M=-12,-7,-29,-5,-6,-25,-7,-5,-29,7,-26,-15,-7,-14,-3,8,-4,-10,-23,-24,-12,-4; MA /M: SY='R'; M=-17,0,-28,2,1,-27,-16,3,-28,11,-26,-15,3,-13,5,16,-5,-11,-27,-27,-13,5; MA /M: SY='L'; M=-8,-26,-22,-29,-22,4,-26,-22,9,-28,15,7,-28,-25,-20,-23,-18,-4,11,-21,-8,-21; MA /M: SY='K'; M=-8,-12,-22,-11,-12,-18,-15,-9,-19,-1,-16,-10,-6,-14,-8,2,-2,1,-15,-25,-12,-7; MA /M: SY='K'; M=-12,-11,-29,-8,-2,-27,-18,-8,-26,14,-23,-12,-11,-11,-1,9,-8,-7,-20,-19,-11,0; MA /M: SY='L'; M=1,-22,-18,-26,-20,-3,-18,-19,5,-20,-3,4,-20,-21,-17,-18,-11,-7,5,-21,-8,-18; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=226(201); /POSITIVE=214(189); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=12(12); NR /FALSE_NEG=6; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20_shuffled; CC /AUTHOR=K_Hofmann; CC /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=t-SNARE coiled-coil homology; CC /VERSION=6; DR Q8IZP0 , ABI1_HUMAN , T; Q8CBW3 , ABI1_MOUSE , T;
DR Q9QZM5 , ABI1_RAT , T; Q9NYB9 , ABI2_HUMAN , T;
DR P62484 , ABI2_MOUSE , T; G5EEN8 , AEX4_CAEEL , T;
DR Q9M2J9 , BET11_ARATH, T; Q94CG2 , BET12_ARATH, T;
DR Q3MHP8 , BET1L_BOVIN, T; Q68EL3 , BET1L_DANRE, T;
DR Q9NYM9 , BET1L_HUMAN, T; O35153 , BET1L_MOUSE, T;
DR Q5RBX2 , BET1L_PONAB, T; O35152 , BET1L_RAT , T;
DR O15155 , BET1_HUMAN , T; O35623 , BET1_MOUSE , T;
DR Q62896 , BET1_RAT , T; O13932 , BET1_SCHPO , T;
DR P22804 , BET1_YEAST , T; Q8VXX9 , BETL1_ARATH, T;
DR Q8L9S0 , BETL2_ARATH, T; O14222 , FSV1_SCHPO , T;
DR Q944A9 , NPS11_ARATH, T; Q9LNH6 , NPS12_ARATH, T;
DR Q9LRP1 , NPS13_ARATH, T; O94651 , PEP12_SCHPO, T;
DR P32854 , PEP12_YEAST, T; Q9USH7 , PSY1_SCHPO , T;
DR Q59XP0 , SEC9_CANAL , T; Q6FY22 , SEC9_CANGA , T;
DR Q6BKU3 , SEC9_DEBHA , T; Q752V4 , SEC9_EREGS , T;
DR Q6CSD1 , SEC9_KLULA , T; O74786 , SEC9_SCHPO , T;
DR Q6C5G0 , SEC9_YARLI , T; P40357 , SEC9_YEAST , T;
DR O13644 , SED5_SCHPO , T; Q01590 , SED5_YEAST , T;
DR P43682 , SFT1_YEAST , T; P36977 , SN25A_CARAU, T;
DR Q5TZ66 , SN25A_DANRE, T; P36978 , SN25B_CARAU, T;
DR Q6PC54 , SN25B_DANRE, T; P83351 , SNA29_CAEEL, T;
DR O00161 , SNP23_HUMAN, T; O09044 , SNP23_MOUSE, T;
DR O70377 , SNP23_RAT , T; Q17QQ3 , SNP25_BOVIN, T;
DR P60878 , SNP25_CHICK, T; P36975 , SNP25_DROME, T;
DR P60880 , SNP25_HUMAN, T; P60877 , SNP25_MACMU, T;
DR P60879 , SNP25_MOUSE, T; Q5R1X1 , SNP25_PANTR, T;
DR Q5NVG5 , SNP25_PONAB, T; P60881 , SNP25_RAT , T;
DR P36976 , SNP25_TORMA, T; Q9SD96 , SNP29_ARATH, T;
DR Q0II86 , SNP29_BOVIN, T; O95721 , SNP29_HUMAN, T;
DR Q9ERB0 , SNP29_MOUSE, T; Q5R5K4 , SNP29_PONAB, T;
DR Q9Z2P6 , SNP29_RAT , T; Q9LMG8 , SNP30_ARATH, T;
DR Q0E1I7 , SNP32_ORYSJ, T; Q9S7P9 , SNP33_ARATH, T;
DR A6QP11 , SNP47_BOVIN, T; Q0P4A7 , SNP47_DANRE, T;
DR Q5SQN1 , SNP47_HUMAN, T; Q8R570 , SNP47_MOUSE, T;
DR Q6P6S0 , SNP47_RAT , T; Q04359 , SPO20_YEAST, T;
DR P32867 , SSO1_YEAST , T; Q59YF0 , SSO2_CANAL , T;
DR P39926 , SSO2_YEAST , T; O60499 , STX10_HUMAN, T;
DR O75558 , STX11_HUMAN, T; Q9D3G5 , STX11_MOUSE, T;
DR Q86Y82 , STX12_HUMAN, T; Q9ER00 , STX12_MOUSE, T;
DR Q5RBW6 , STX12_PONAB, T; G3V7P1 , STX12_RAT , T;
DR O14662 , STX16_HUMAN, T; Q8BVI5 , STX16_MOUSE, T;
DR Q5E9Y2 , STX17_BOVIN, T; P56962 , STX17_HUMAN, T;
DR Q9D0I4 , STX17_MOUSE, T; Q9Z158 , STX17_RAT , T;
DR Q0VCI2 , STX19_BOVIN, T; Q8N4C7 , STX19_HUMAN, T;
DR Q8R1Q0 , STX19_MOUSE, T; Q5RAL4 , STX19_PONAB, T;
DR Q5TX47 , STX1A_ANOGA, T; P32850 , STX1A_BOVIN, T;
DR A8WVD0 , STX1A_CAEBR, T; O16000 , STX1A_CAEEL, T;
DR Q24547 , STX1A_DROME, T; Q16623 , STX1A_HUMAN, T;
DR O35526 , STX1A_MOUSE, T; Q5R4L2 , STX1A_PONAB, T;
DR P32851 , STX1A_RAT , T; P61267 , STX1B_BOVIN, T;
DR P61266 , STX1B_HUMAN, T; P61264 , STX1B_MOUSE, T;
DR P61265 , STX1B_RAT , T; P61268 , STX1B_SHEEP, T;
DR Q20574 , STX2_CAEEL , T; P32856 , STX2_HUMAN , T;
DR Q00262 , STX2_MOUSE , T; P50279 , STX2_RAT , T;
DR Q20024 , STX3_CAEEL , T; Q13277 , STX3_HUMAN , T;
DR Q64704 , STX3_MOUSE , T; Q08849 , STX3_RAT , T;
DR Q3SWZ3 , STX4_BOVIN , T; P91409 , STX4_CAEEL , T;
DR Q7KVY7 , STX4_DROME , T; Q12846 , STX4_HUMAN , T;
DR P70452 , STX4_MOUSE , T; Q08850 , STX4_RAT , T;
DR Q08DB5 , STX5_BOVIN , T; Q20797 , STX5_CAEEL , T;
DR Q24509 , STX5_DROME , T; Q13190 , STX5_HUMAN , T;
DR Q8K1E0 , STX5_MOUSE , T; Q08851 , STX5_RAT , T;
DR P83528 , STX6_CAEEL , T; Q5ZL19 , STX6_CHICK , T;
DR O43752 , STX6_HUMAN , T; Q9JKK1 , STX6_MOUSE , T;
DR Q5R6Q2 , STX6_PONAB , T; Q63635 , STX6_RAT , T;
DR Q54JY7 , STX7A_DICDI, T; Q54X86 , STX7B_DICDI, T;
DR Q3ZBT5 , STX7_BOVIN , T; O15400 , STX7_HUMAN , T;
DR O70439 , STX7_MOUSE , T; Q5R602 , STX7_PONAB , T;
DR O70257 , STX7_RAT , T; Q553P5 , STX8A_DICDI, T;
DR Q54IX6 , STX8B_DICDI, T; Q3T075 , STX8_BOVIN , T;
DR Q9UNK0 , STX8_HUMAN , T; O88983 , STX8_MOUSE , T;
DR Q9Z2Q7 , STX8_RAT , T; P31377 , STX8_YEAST , T;
DR Q16932 , STX_APLCA , T; Q42374 , SY111_ARATH, T;
DR Q84R43 , SY111_ORYSJ, T; Q9ZPV9 , SY112_ARATH, T;
DR Q9ZSD4 , SY121_ARATH, T; Q6F3B4 , SY121_ORYSJ, T;
DR Q9SVC2 , SY122_ARATH, T; Q9ZQZ8 , SY123_ARATH, T;
DR O64791 , SY124_ARATH, T; Q9SXB0 , SY125_ARATH, T;
DR Q9SRV7 , SY131_ARATH, T; Q8VZU2 , SY132_ARATH, T;
DR Q7XIE2 , SY132_ORYSJ, T; Q39233 , SYP21_ARATH, T;
DR P93654 , SYP22_ARATH, T; O04378 , SYP23_ARATH, T;
DR Q9C615 , SYP24_ARATH, T; Q9FFK1 , SYP31_ARATH, T;
DR Q9LK09 , SYP32_ARATH, T; O65359 , SYP41_ARATH, T;
DR Q9SWH4 , SYP42_ARATH, T; Q9SUJ1 , SYP43_ARATH, T;
DR Q9SA23 , SYP51_ARATH, T; Q94KK7 , SYP52_ARATH, T;
DR Q946Y7 , SYP61_ARATH, T; Q9SF29 , SYP71_ARATH, T;
DR Q94KK6 , SYP72_ARATH, T; Q94KK5 , SYP73_ARATH, T;
DR Q9HGN3 , TLG1_SCHPO , T; Q03322 , TLG1_YEAST , T;
DR Q9P6P1 , TLG2_SCHPO , T; Q08144 , TLG2_YEAST , T;
DR Q96NA8 , TSNA1_HUMAN, T; Q9BZF9 , UACA_HUMAN , T;
DR Q8CGB3 , UACA_MOUSE , T; P41834 , UFE1_YEAST , T;
DR Q12241 , VAM3_YEAST , T; O74509 , VAM7_SCHPO , T;
DR P32912 , VAM7_YEAST , T; Q54CK6 , VTI1A_DICDI, T;
DR Q04338 , VTI1_YEAST , T; Q54MG4 , Y5975_DICDI, T;
DR Q5UR18 , YL657_MIMIV, T;
DR Q4VBI7 , STX18_DANRE, N; Q9P2W9 , STX18_HUMAN, N;
DR Q8VDS8 , STX18_MOUSE, N; Q5REB4 , STX18_PONAB, N;
DR Q68FW4 , STX18_RAT , N; O94531 , UFE1_SCHPO , N;
DR Q9I3F6 , AER_PSEAE , F; P40442 , CSS1_YEAST , F;
DR Q9I0I6 , CTPM_PSEAE , F; P15492 , HLYB_VIBCH , F;
DR Q2W4T8 , MCP25_MAGSA, F; Q9X0M7 , MCP2_THEMA , F;
DR Q9I055 , MCPN_PSEAE , F; Q9Z429 , NAHY_PSEPU , F;
DR G3XD24 , PCTA_PSEAE , F; Q9HW93 , PCTC_PSEAE , F;
DR Q882Z2 , PSCA_PSESM , F; P75282 , Y504_MYCPN , F;
3D 1FIO; 1GL2; 1HVV; 1JTH; 1KIL; 1N7S; 1NHL; 1SFC; 1URQ; 1XTG; 2M8R; 2N1T; 3D 2NPS; 3B5N; 3C98; 3HD7; 3IPD; 3J96; 3J97; 3J98; 3J99; 3P8C; 3RK2; 3RK3; 3D 3RL0; 3ZUR; 3ZUS; 4JEH; 4JEU; 4N78; 4WY4; 5CCG; 5CCH; 5CCI; 5KJ7; 5KJ8; 3D 5LG4; 5LOB; 5LOW; 5M4Y; 5W5C; 5W5D; 6IP1; 6JLH; 6MDM; 6MDN; 6MDO; 6MDP; 3D 6MTI; 6WVW; 7BV6; 7Q83; 7UDB; 7UDC; 7USC; 7USD; 7USE; 7XSJ; PR PRU00202; DO PDOC50192; //