PROSITE entry PS50531

ID   HTH_IS21; MATRIX.
AC   PS50531;
DT   01-DEC-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   IS21 transposase-type HTH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=59;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4935000; R2=0.0175000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3070.9484863; R2=3.5579400; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=658; H_SCORE=5412; N_SCORE=14.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=544; H_SCORE=5006; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-27,4,20,-19,-17,-5,-16,-3,-12,-6,-6,1,4,-8,-3,-4,-17,-25,-11,11;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-7,-24,-7,-8,-8,-23,-12,3,-12,13,7,-9,-20,-9,-9,-15,-6,-1,-25,-7,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-25,-22,-17,16,-15,-5,-11,-13,-7,-6,-13,-24,-16,-8,-10,-9,-9,9,17,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-12,-24,-14,-5,-4,-21,1,-8,5,-8,2,-11,-19,-3,2,-11,-8,-5,-10,12,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-14,-27,-17,-2,-9,-26,-12,5,-1,1,10,-11,-15,0,-3,-13,-10,-1,-20,-5,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-10,-23,-23,-26,-20,-6,-30,-20,16,-7,5,7,-17,-24,-13,7,-14,-7,19,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-8,-30,-9,-1,-19,-19,6,-20,14,-16,-1,-3,-12,8,22,-12,-12,-19,-12,-4,2;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-28,-7,6,-18,-10,-10,-11,-8,-9,-2,-9,-14,4,-10,-7,-11,-14,-9,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-17,-21,-21,-17,4,-24,-2,10,-18,20,16,-15,-26,-13,-14,-18,-8,5,-17,8,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-25,-13,-5,0,-23,5,-13,-1,-2,-2,-5,-22,-2,15,-12,-8,-13,-17,3,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-1,-18,-3,5,-24,-15,-2,-25,14,-24,-12,5,-14,12,21,6,0,-19,-28,-13,7;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,3,-27,5,8,-26,-15,-4,-17,7,-16,-3,0,-12,15,5,-4,-5,-17,-25,-12,11;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-29,-7,-9,-28,31,-6,-34,1,-27,-14,0,-17,-6,-1,-3,-16,-26,-21,-19,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-23,-14,-29,-20,4,-24,-15,13,-19,19,18,-21,-24,-15,-15,-17,-8,9,-18,1,-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,4,-15,1,-2,-15,-4,-4,-18,-6,-27,-17,14,-14,-1,-6,26,12,-14,-32,-9,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-21,-24,-23,-16,-4,-28,-15,13,-11,9,7,-18,-17,-13,-12,-15,-7,11,-21,0,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-21,-10,-4,-17,-16,-1,-15,3,-14,-7,-2,-17,3,18,4,1,-8,-27,-10,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-2,12,-26,18,28,-32,-14,-1,-26,4,-21,-15,3,-7,20,-3,4,-6,-24,-28,-17,24;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-18,-37,-28,-1,-36,-29,39,-28,17,15,-21,-22,-21,-28,-18,-9,27,-23,-4,-28;
MA   /M: SY='A'; M=43,-10,-7,-19,-11,-21,3,-20,-13,-11,-12,-11,-9,-12,-11,-20,10,0,-3,-22,-21,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-6,-27,-7,2,-23,-20,-6,-26,25,-21,-10,-1,-10,9,40,-5,-1,-18,-22,-11,3;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-2,-29,2,22,-23,-19,6,-27,14,-20,-12,0,-12,17,26,-3,-9,-24,-22,-8,17;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-18,-17,-22,-16,-1,-26,-19,10,-20,20,10,-16,-21,-13,-16,-8,12,8,-24,-5,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-3,-29,-6,-14,-29,53,-14,-36,-13,-29,-18,7,-19,-12,-14,1,-17,-30,-22,-27,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-3,-30,-25,1,-30,-23,19,-24,21,15,-25,-28,-21,-21,-17,-4,21,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='S'; M=4,12,-12,14,2,-23,-5,-7,-23,-8,-26,-20,10,-12,-3,-11,20,7,-15,-35,-16,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-11,-27,-11,1,-12,-22,-6,-20,18,-12,-7,-6,-19,3,41,-11,-9,-12,-20,-8,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-13,13,-25,4,0,-21,-10,3,-25,13,-26,-15,26,-14,4,29,2,-4,-24,-30,-16,0;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-29,-15,-32,-29,-1,-31,-30,33,-22,11,11,-27,-27,-27,-22,-11,-2,43,-27,-8,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-28,1,4,-19,-18,-1,-26,21,-21,-12,0,-16,6,33,-6,-8,-19,-18,-2,2;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-1,-29,-2,6,-26,-19,-5,-29,40,-27,-11,4,-14,9,41,-9,-9,-21,-21,-11,6;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-22,-32,-22,-21,25,-24,12,-4,-12,-4,-3,-22,-30,-12,-12,-22,-13,-13,43,68,-20;
MA   /M: SY='L'; M=0,-27,-18,-29,-20,4,-26,-21,17,-26,37,15,-27,-27,-19,-20,-22,-8,12,-21,-4,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-12,5,-27,5,7,-25,-16,2,-25,18,-22,-11,7,-15,10,27,-4,-8,-20,-26,-12,6;
MA   /M: SY='A'; M=17,-7,-16,-11,-10,-14,0,-11,-12,-11,-13,-5,-5,-14,-8,-15,8,2,-7,-20,-8,-9;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-3,-28,2,-3,-17,-3,-14,-25,-5,-24,-18,-3,13,-9,-8,0,-5,-22,-26,-17,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-21,-2,9,-16,-9,-9,-19,-1,-16,-13,3,-12,-1,0,5,3,-13,-27,-15,4;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-12,-28,-9,2,-11,-17,-15,-15,-9,-16,-12,-13,22,-8,-15,-6,-8,-17,-17,-14,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-4,-28,0,17,-25,-20,-9,-18,3,-18,-12,-6,16,7,-4,-3,-2,-20,-28,-18,11;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21;
MA   /M: SY='P'; M=3,-7,-23,-5,11,-22,-14,-9,-17,0,-14,-11,-8,12,4,-2,-1,-6,-17,-23,-17,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-9,-27,-7,2,-16,-19,0,-18,12,-17,-5,-6,4,3,13,-9,-9,-16,-20,-8,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-11,-18,-12,-7,-4,-15,-4,-8,3,-6,-2,-8,-10,-3,10,-7,-5,-6,-10,3,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-4,-16,-4,2,-4,-13,1,-10,10,-9,-5,-3,-9,2,9,-5,-2,-9,-4,9,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-7,-28,-6,2,-26,-13,-9,-22,16,-22,-10,-3,1,7,14,-4,-7,-18,-24,-15,3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-5,-26,-4,-1,-22,-18,-5,-22,9,-21,-12,-3,5,0,16,-1,2,-16,-27,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-6,-24,-4,4,-25,-18,-9,-24,13,-20,-12,-6,3,4,19,-7,-9,-19,-25,-16,1;
MA   /M: SY='Q'; M=0,1,-25,-2,4,-22,-10,7,-20,0,-19,-10,4,-9,8,1,0,-7,-19,-23,-8,4;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-12,-27,-11,-5,-17,-15,-11,-15,11,-16,-7,-8,-6,-3,14,-6,-7,-9,-21,-9,-6;
MA   /M: SY='A'; M=1,-13,-22,-15,-5,-10,-18,-14,-7,-4,-7,0,-12,0,-5,-6,-5,-3,-5,-22,-11,-6;
MA   /M: SY='S'; M=3,-5,-17,-7,-6,-18,-3,-12,-14,-8,-19,-13,3,-10,-6,-5,16,6,-7,-33,-18,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-13,-24,-14,-4,-14,-25,-15,-3,11,0,4,-13,-18,-3,4,-15,-8,1,-22,-7,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-20,-31,-22,6,-30,-19,24,-26,38,25,-27,-27,-18,-20,-25,-9,16,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,37,-28,49,16,-35,-5,-1,-35,2,-30,-26,20,-11,0,-7,3,-7,-28,-37,-20,8;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-36,-6,6,-26,-20,-15,-21,-2,-26,-17,-15,58,-5,-12,-8,-7,-26,-26,-20,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-25,-25,-28,-25,40,-30,0,6,-18,5,2,-21,-30,-22,-15,-19,-9,1,15,51,-25;
MA   /M: SY='H'; M=-7,-4,-27,-3,5,-18,-19,11,-20,11,-14,-3,-3,-15,7,10,-8,-10,-17,-18,2,4;
MA   /M: SY='D'; M=-9,18,-30,30,23,-32,-14,-5,-28,0,-23,-20,3,10,3,-10,-2,-9,-26,-33,-21,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-27,-20,-15,9,-27,3,0,-7,-1,1,-15,-24,-7,-4,-15,-6,-4,6,30,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-23,-34,-25,5,-34,-25,32,-29,34,19,-26,-26,-21,-24,-24,-9,22,-21,-1,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-25,6,12,-23,-15,-5,-21,4,-13,-11,-1,-13,7,10,-2,-7,-17,-26,-14,8;
MA   /M: SY='Q'; M=5,-4,-22,-7,3,-26,-2,-7,-20,2,-19,-6,-2,-12,13,0,5,-3,-17,-23,-16,8;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-17,-30,-20,-12,-8,-19,-12,-17,2,-10,-6,-12,-22,-4,19,-16,-10,-16,21,0,-9;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-25,-31,-22,6,-28,-21,14,-23,29,13,-29,-28,-19,-15,-28,-12,7,6,3,-20;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=9(9); /POSITIVE=9(9); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=S_Spirin;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH IS21-type;
CC   /VERSION=5;
DR   P15025   , ISTA_PSEAI , T; P16944    , ISTA_SHISO , T; 
DR   Q99335   , T232_BACTB , T; Q45119    , TNPA_BACFG , T; 
DR   Q64NF0   , TNPA_BACFR , T; Q45618    , TRA6_GEOSE , T; 
DR   P0A134   , TRA6_PSEAI , T; P0A135    , TRA6_SHIFL , T; 
DR   Q46087   , TRAT_AMIAI , T; 
3D   8B4H; 
PR   PRU00615; 
DO   PDOC50531;
//