PROSITE entry PS50808

ID   ZF_BED; MATRIX.
AC   PS50808;
DT   01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger BED-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=58;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=53;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3612000; R2=0.0176589; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2809.9462891; R2=2.4008265; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=433; H_SCORE=3850; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=292; H_SCORE=3511; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-27,-6,1,-18,-6,-6,-24,12,-18,-10,1,-17,4,19,-5,-9,-20,-22,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-29,3,2,-21,-12,-4,-23,14,-21,-8,-3,-8,4,7,-7,-10,-19,-17,-2,2;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-11,-24,-12,-5,-15,-19,-9,-12,1,-12,-4,-8,-2,1,7,-1,3,-9,-23,-7,-4;
MA   /M: SY='D'; M=-3,18,-19,24,14,-27,-6,-4,-27,-4,-29,-23,15,-9,3,-8,21,6,-20,-39,-20,9;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-27,1,4,-24,-18,-4,-17,7,-20,-11,-3,0,-1,2,-4,-7,-13,-27,-13,0;
MA   /M: SY='V'; M=6,-21,-20,-25,-20,-7,-16,-20,12,-17,0,4,-17,-12,-17,-20,-5,-4,14,-21,-7,-20;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-32,-40,-33,-25,10,-21,-21,-13,-18,-11,-13,-32,-27,-17,-18,-29,-19,-21,99,30,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,0,-15,1,6,-23,-11,-10,-22,2,-18,-12,0,-7,1,-3,-1,-6,-19,-30,-17,3;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-13,-26,-15,-13,9,-25,38,-7,-14,-7,1,-7,-24,-7,-9,-11,-11,-10,-8,32,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-24,-22,-28,-24,31,-14,-13,-1,-22,7,0,-19,-27,-25,-18,-16,-10,-1,0,21,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,0,-11,-14,-15,-16,-18,-9,-11,-7,-7,-9,-21,-14,-6,-4,2,0,-30,-15,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-28,3,7,-17,-8,-7,-21,-6,-15,-12,-5,-1,3,-10,-4,-7,-21,-21,-9,4;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-21,-20,-11,-4,-25,-17,7,-11,0,1,-12,-19,-8,-5,-4,0,8,-24,-6,-11;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-19,6,11,-7,-14,-4,-14,-4,-8,-10,0,-10,-2,-7,-2,-2,-13,-17,-3,5; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-17,-7,2,3,-15,-8,-14,5,-10,-7,-3,-11,-3,8,-2,-1,-10,-13,-2,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-14;
MA   /M: M=-5,0,-16,0,-1,-13,-1,-7,-11,-7,-7,-4,0,-3,-5,-8,-1,0,-11,-19,-11,-3; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,21,-18,31,17,-22,-8,-1,-22,5,-17,-16,8,-5,4,-2,-1,-6,-18,-22,-12,10; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-19,5,4,-20,19,-7,-23,-2,-17,-13,2,-8,-3,-5,-1,-10,-18,-15,-15,0; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-1,-14,0,1,-12,-14,-8,-6,3,-8,-5,-2,-8,-2,2,-1,3,-2,-17,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-5,2,-14,-1,-1,-11,-10,-5,-8,10,-9,-4,5,-10,-1,5,-4,-3,-6,-15,-7,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-7,-14,-7,-3,-10,-7,-8,-6,4,-2,0,-6,-11,-1,1,-7,-6,-4,-12,-6,-2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='G'; M=8,-3,-10,-5,-4,-13,11,-8,-13,-3,-13,-8,0,-7,-4,-6,6,-2,-8,-13,-12,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-28,-9,-5,-15,-21,5,-17,11,-16,-6,-6,-18,0,14,-12,-11,-12,-7,3,-5;
MA   /M: SY='F'; M=4,-21,-18,-26,-19,8,-19,-17,3,-18,5,3,-19,-22,-17,-17,-8,-2,5,-3,4,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-10,-27,-12,0,-4,-24,-9,-13,12,-9,-4,-8,-17,0,11,-11,-6,-11,-14,2,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-23,-7,-2,-20,-18,-3,-15,19,-18,-3,-1,-16,1,13,-5,-6,-7,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-20,-26,-22,-16,10,-22,-4,1,-11,6,3,-17,-25,-10,-6,-17,-10,-3,-2,24,-15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-3,-28,-3,0,-21,-4,28,-24,-3,-14,-5,3,-18,4,-2,-8,-15,-23,-25,-3,0;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-12,-27,-13,-5,-7,-23,-12,-13,16,-16,-6,-8,-9,-5,10,-10,-8,-9,-16,-1,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-14,-26,-14,-13,-12,-28,-20,11,-7,1,3,-14,-14,-12,-8,-14,-8,11,-25,-8,-15;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-16,-24,-21,-17,-5,-12,-13,7,-15,9,11,-10,-22,-12,-14,-13,-9,0,-20,-3,-15;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-16,-5,2,-25,-14,-1,-25,12,-25,-12,1,-8,6,12,6,-2,-18,-28,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-5,-17,-8,-5,-14,0,-4,-22,-5,-19,-12,3,-18,-6,0,2,-4,-17,-26,-12,-7;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-10,-22,-12,-11,-15,4,-6,-13,-12,-8,-5,-4,-17,-6,-7,-1,0,-11,-22,-11,-9; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-4,-21,-4,-5,-22,12,3,-24,-7,-22,-12,2,-7,-1,-7,7,-2,-19,-24,-13,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=-1,0,-13,-1,1,-12,2,-7,-12,-2,-10,-8,3,-8,-2,-4,5,1,-10,-17,-10,-1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=5,0,-10,-4,-5,-12,5,-7,-11,-7,-13,-6,5,-9,-4,-8,12,6,-7,-21,-12,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='T'; M=4,-11,-18,-17,-12,-13,-20,-21,0,-14,-8,-6,-8,2,-11,-17,7,20,1,-27,-13,-13;
MA   /M: SY='S'; M=1,6,-15,3,5,-17,-7,-5,-19,-6,-24,-17,13,-11,1,-7,24,15,-14,-33,-13,3;
MA   /M: SY='N'; M=-3,7,-24,0,-3,-19,-3,-3,-21,3,-24,-15,17,-5,-2,5,3,-4,-22,-26,-13,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-25,-16,5,-25,-14,12,-20,26,19,-22,-25,-9,-14,-18,-7,6,-20,-1,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-14,-26,-17,-8,-16,-24,-12,-1,9,-8,4,-8,-17,2,15,-9,-7,0,-22,-8,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-26,-11,-5,-15,-22,1,-11,8,-13,-4,-1,-17,3,16,-6,-2,-10,-19,0,-4;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-25,-16,0,-28,-12,13,-16,28,16,-22,-25,-14,-12,-23,-10,8,-21,-1,-15;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-9,-15,-10,-5,-6,-14,-11,-5,5,-2,-1,-9,-11,-4,1,-8,-2,-2,-2,-2,-4; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='R'; M=-6,3,-20,1,2,-20,-13,4,-21,8,-18,-10,5,-13,7,17,2,1,-16,-23,-9,2; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: M=-3,-13,-11,-16,-9,-11,-15,-15,-8,-2,-8,0,-12,-11,-6,-6,-7,-4,-3,-22,-11,-8; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-8,28,-12,-12,-20,-24,49,-30,-18,-20,-8,-2,-28,-6,-12,-10,-16,-22,-38,1,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-11,-27,-9,0,-21,-15,-15,-15,7,-13,-8,-11,6,-4,-1,-7,-7,-12,-25,-16,-3;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-23,1,4,-18,-15,-6,-13,2,-12,-7,8,-15,0,3,0,-1,-13,-29,-13,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-4,-25,-5,1,-9,-15,-5,-8,-6,-7,-7,-5,-17,-5,-10,-7,-8,-9,-15,5,-4;
MA   /M: M=-12,-15,-28,-13,-10,-6,-22,-14,-7,-7,-6,-6,-14,0,-11,-4,-12,-8,-8,-12,-3,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-2,3,-23,2,3,-17,-15,-11,-20,7,-19,-13,1,-7,-3,2,0,-1,-13,-25,-13,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,4,-25,5,11,-26,-9,-8,-23,6,-22,-14,3,-4,5,1,2,-4,-18,-28,-18,7;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-7,-19,-11,-16,-6,-15,-12,4,-13,-6,-3,-5,-22,-15,-15,-2,0,9,-22,0,-17;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=35(24); /POSITIVE=35(24); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=3; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=4;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=BED-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q19787   , BED3_CAEEL , T; P51558    , DPY20_CAEBR, T; 
DR   P34807   , DPY20_CAEEL, T; Q9M2N5    , DSLE_ARATH , T; 
DR   P53246   , ENV11_YEAST, T; P34478    , GEI13_CAEEL, T; 
DR   P12258   , HOBOT_DROME, T; B9FJG3    , RSLE1_ORYSJ, T; 
DR   Q6AVI0   , RSLE2_ORYSJ, T; Q75HY5    , RSLE3_ORYSJ, T; 
DR   Q0JMB2   , RSLE4_ORYSJ, T; Q9C5G0    , SUF4_ARATH , T; 
DR   Q05934   , VID22_YEAST, T; Q09663    , YS54_CAEEL , T; 
DR   O96006   , ZBED1_HUMAN, T; Q9BTP6    , ZBED2_HUMAN, T; 
DR   Q96IU2   , ZBED3_HUMAN, T; O75132    , ZBED4_HUMAN, T; 
DR   Q80WQ9   , ZBED4_MOUSE, T; A4Z943    , ZBED5_BOVIN, T; 
DR   A4Z944   , ZBED5_CANLF, T; Q49AG3    , ZBED5_HUMAN, T; 
DR   P86452   , ZBED6_HUMAN, T; D2EAC2    , ZBED6_MOUSE, T; 
DR   P34418   , MIG39_CAEEL, N; B8MV65    , TPED_TALSN , N; 
DR   Q9D0L1   , ZBED3_MOUSE, N; 
3D   2CT5; 2DJR; 
PR   PRU00027; 
DO   PDOC50808;
//