PROSITE entry PS50820

ID   LCCL; MATRIX.
AC   PS50820;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   LCCL domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=96;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=91;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5650000; R2=0.0141046; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7062.4882812; R2=7.1358380; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=669; H_SCORE=11836; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=421; H_SCORE=10067; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,-14,-24,-14,-12,-8,-12,2,-10,2,19,-14,-14,-6,-16,-2,-4,4,-20,-12,-10;
MA   /M: SY='T'; M=0,-6,-19,-7,-4,-19,-14,-17,-16,-10,-22,-16,-3,21,-7,-13,17,23,-12,-33,-19,-7;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,2,-27,-7,-1,-22,-20,-2,1,-5,-11,0,11,-16,18,-5,-3,-7,-12,-26,-10,7;
MA   /M: SY='A'; M=23,-12,-10,-16,-12,-14,-8,-20,-2,-13,-11,-8,-9,-16,-12,-17,14,6,11,-29,-17,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-9,-22,-17,-14,-10,-26,10,3,-16,-3,2,-4,-16,-8,-14,-1,12,1,-27,2,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-13,2,73,2,-14,-26,-24,-21,-33,-21,-23,-23,-7,-31,-21,-24,-7,-10,-16,-47,-27,-17;
MA   /M: SY='F'; M=-17,2,-26,3,-3,12,-21,-11,-21,4,-14,-12,-3,-18,-13,-1,-11,-10,-15,-13,3,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-16,-7,-1,-19,-20,-11,-13,-4,-13,-7,0,-10,12,-4,14,31,-9,-27,-10,6;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,59,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-21,-12,-14,-18,23,-11,-17,-14,-16,2,-2,-17,-8,-14,7,-5,-13,-26,-18,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,0,-23,-6,-5,-11,-18,-8,-7,2,2,-1,7,-21,-5,0,-12,-7,-11,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-20,28,-30,42,7,-18,-16,6,-27,-3,-21,-21,7,-16,-3,-10,-6,-10,-24,-18,12,1;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-22,-19,-24,-17,0,-24,-19,15,-24,21,9,-17,-22,-14,-19,-8,-2,9,-26,-6,-17;
MA   /M: SY='C'; M=-17,-19,15,-25,-18,12,-26,-15,-21,-6,-11,-10,-12,-29,-17,14,-13,-10,-11,-19,-3,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-3,-30,-3,1,-30,8,-13,-33,28,-30,-13,0,-13,1,14,-7,-13,-23,-20,-16,1;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-18,-3,-6,-15,13,26,-21,-9,-15,-6,3,-12,-2,-6,-3,-12,-18,-15,-2,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='N'; M=0,13,-9,6,0,-12,0,0,-12,-3,-18,-12,22,-9,0,-3,14,6,-12,-24,-12,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-5,-21,-4,15,-12,-23,-12,-9,-8,5,-5,-9,-12,-1,-9,-4,7,-9,-27,-11,7;
MA   /M: SY='C'; M=-2,-6,22,-10,-8,-20,-16,-18,-23,-3,-23,-16,-2,-18,-8,-7,12,11,-10,-37,-19,-8;
MA   /M: SY='N'; M=9,11,-17,5,10,-22,-4,-5,-20,-3,-24,-18,18,-11,2,-7,18,4,-17,-34,-20,6;
MA   /M: SY='D'; M=-14,8,-24,16,-1,-22,-19,-9,-15,2,-15,-12,-1,-19,-7,9,-6,-7,-2,-31,-14,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-18,-16,-18,-18,2,-21,-10,6,-14,-5,-2,-15,-24,-15,-14,3,4,14,-16,12,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-20,-15,-6,-10,-24,-12,-1,-13,12,5,-12,-18,5,-8,-6,9,-4,-23,-6,0;
MA   /M: SY='C'; M=9,-17,79,-27,-24,-20,-21,-27,-24,-24,-17,-17,-17,-31,-24,-27,-4,-7,-7,-41,-27,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='A'; M=40,-10,-14,-18,-12,-22,15,-20,-16,-12,-14,-12,-8,-12,-12,-20,8,-4,-6,-20,-22,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-4,-16,-28,56,-14,-36,-16,-30,-20,12,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-26,-28,-22,-12,-6,-26,-20,4,-22,18,4,-26,19,-16,-20,-22,-10,-6,-24,-12,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-10,-20,-16,-14,2,-22,-12,9,-22,28,9,-5,-27,-14,-14,-19,-7,-1,-26,-6,-14;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-1,-34,-1,7,-19,-14,-9,-22,-5,-26,-20,3,17,-3,-10,-8,-11,-30,2,-13,1;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-7,-27,-8,10,3,-23,-7,-19,9,-13,-7,-6,-14,6,4,-9,-10,-18,-13,1,10;
MA   /M: SY='A'; M=22,-18,-14,-28,-18,21,-12,-20,-6,-18,-2,-6,-14,-18,-22,-20,-2,-4,0,-8,0,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-1,-26,2,18,-16,-18,-1,-22,13,-21,-13,-2,-11,7,4,2,-4,-19,-18,2,11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-18,-19,-23,-18,38,-21,-8,-6,-19,-5,-6,-11,-24,-21,-15,-1,-1,-5,-2,25,-18;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-3,18,-16,15,1,-21,-8,-7,-21,-6,-24,-19,19,-12,-3,-8,20,19,-15,-37,-17,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-17,-27,-19,-16,-9,-9,16,-1,-22,6,6,-9,-23,-11,-16,-16,-15,-6,-23,0,-16;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-24,-23,-28,-27,13,0,-24,3,-25,-1,0,-16,-25,-28,-22,-12,-11,7,-14,-3,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=11,-4,-22,-6,13,-23,-12,-8,-22,8,-16,-13,-4,-10,5,14,1,-6,-15,-23,-17,7;
MA   /M: SY='S'; M=1,16,-16,22,6,-26,-3,-7,-26,-7,-30,-23,13,-10,0,-10,27,11,-16,-40,-20,3;
MA   /M: SY='S'; M=4,-12,-12,-12,-10,-10,-12,-16,-2,-16,-6,-6,-6,-18,-10,-14,16,10,7,-34,-14,-10;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='S'; M=4,-6,-19,-3,0,-23,-6,-13,-20,-10,-30,-20,1,22,-3,-13,24,11,-16,-37,-23,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,28,18,-25,-25,-22,-25,-21,-8,28,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-9,-13,-27,-16,-14,-18,16,-8,-18,-3,-11,8,-6,-20,-5,8,-9,-14,-15,-20,-15,-11;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=34,-10,-16,-17,-13,-23,22,-20,-19,-13,-16,-13,-7,-13,-13,-20,7,-6,-9,-20,-23,-13;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=2,-13,-24,-16,-9,-6,-16,-1,-15,6,-11,-7,-9,-20,-2,19,-6,-7,-11,-6,12,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-7,27,-19,24,4,-24,-7,-3,-24,-4,-26,-21,27,-13,-2,-7,15,11,-20,-38,-18,1;
MA   /M: SY='B'; M=-10,30,-20,25,2,-22,-9,-2,-22,-3,-24,-20,30,-14,-3,-6,10,13,-21,-37,-17,0;
MA   /M: SY='R'; M=3,-14,-19,-16,-8,-11,-15,-12,-8,-5,2,-3,-9,-19,-5,7,-2,-2,-5,-24,-11,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-15,-25,-14,-1,-20,-19,-11,-7,-9,-1,-1,-15,5,9,-11,-9,-8,-13,-22,-13,3;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-11,10,-24,15,6,-26,-11,-3,-30,9,-26,-19,9,-14,4,22,9,-1,-20,-32,-16,3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-14,-18,-16,-13,-4,-25,-9,3,-9,-4,0,-14,-21,-3,-9,-2,10,8,-15,9,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-12,-22,-17,-11,-12,-22,-15,1,-5,-8,-3,-4,-16,-5,6,3,8,2,-26,-9,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-1,-17,-7,-8,-8,-12,-8,-4,-15,2,-4,8,-21,-8,-11,3,2,-7,-32,-12,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-34,-7,-2,-30,5,-17,-29,6,-30,-17,-8,28,-6,-4,-7,-13,-27,-24,-24,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-13,-27,-16,-20,-22,45,-14,-23,-17,-16,2,-6,-20,-14,-17,-6,-17,-19,-20,-22,-17;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-24,-23,-14,-12,-29,-16,14,-7,1,7,-15,-21,-1,2,-11,-7,13,-23,-7,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-8,-36,2,24,-30,-20,-12,-24,-2,-26,-20,-12,54,2,-12,-6,-10,-30,-30,-26,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,2,-23,-9,-15,24,-18,5,-8,-12,-9,-8,12,-26,-14,-9,-8,-6,-15,-4,25,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-18,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-9,-22,-4,11,-20,-19,-14,-9,-6,-16,-12,-10,7,-4,-12,4,-1,-3,-32,-19,2;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-16,-4,1,-23,-6,-12,-21,7,-26,-15,3,-10,1,-1,20,8,-11,-31,-17,1;
MA   /M: SY='S'; M=6,-12,-10,-12,-12,-12,-12,-18,0,-14,-14,-8,-6,-18,-12,-14,20,12,14,-36,-16,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-14,1,-27,5,3,-20,-21,16,-14,-9,0,0,-3,-18,12,-6,-11,-12,-17,-26,-3,7;
MA   /M: SY='A'; M=33,-7,-16,-14,-4,-23,-6,-17,-16,7,-16,-10,-7,-10,-4,-6,4,-3,-6,-20,-17,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-3,6,-27,-1,-14,-27,48,-11,-34,-14,-30,-20,19,-20,-14,-14,3,-14,-30,-26,-27,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-27,3,-34,-27,35,-27,25,17,-26,-26,-23,-24,-20,-7,31,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-3,8,-28,-20,-5,-20,15,-20,-6,0,-10,24,9,4,9,-18,-23,-10,16;
MA   /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-21,-18,-7,-13,-26,-11,7,-11,9,9,-18,-22,9,-8,-12,-7,6,-23,-7,1;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-12,-22,-20,-6,-20,-18,14,-15,1,12,-17,-22,-15,-15,2,3,25,-31,-11,-17;
MA   /M: SY='G'; M=-7,-15,-26,-15,-12,-14,4,-17,-13,-5,2,-1,-12,-21,-12,-6,-15,-13,-11,-20,-12,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-8,-6,-22,-6,-6,-6,-15,33,-18,-10,-18,-8,2,-19,0,-7,7,-1,-16,-17,21,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-14,-27,-14,-4,-13,-23,-9,-14,17,-1,-1,-9,-20,1,30,-16,-10,-11,-20,-7,-4;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-31,-41,-32,-22,-4,-26,-27,2,-20,-10,-7,-28,7,-17,-23,-25,-18,-11,46,4,-20;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-13,-13,-8,-11,-9,-15,-5,-16,-1,-5,-7,-16,-8,-15,12,7,-2,-30,-14,-8;
MA   /M: SY='S'; M=12,-2,-16,-4,4,-26,-6,-6,-18,-4,-23,-12,3,-10,17,-6,21,6,-14,-29,-17,11;
MA   /M: SY='S'; M=7,-9,-10,-9,-9,-14,-9,-16,-4,-13,-17,-11,-3,-16,-9,-13,24,14,9,-37,-17,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=29(22); /POSITIVE=29(22); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LCCL;
CC   /VERSION=5;
DR   P28175   , CFC_TACTR  , T; Q5EA64    , COCH_BOVIN , T; 
DR   P84552   , COCH_CAVPO , T; O42163    , COCH_CHICK , T; 
DR   O43405   , COCH_HUMAN , T; Q62507    , COCH_MOUSE , T; 
DR   Q98ST5   , CRLD1_CHICK, T; Q9H336    , CRLD1_HUMAN, T; 
DR   Q8CGD2   , CRLD1_MOUSE, T; A6QLZ7    , CRLD2_BOVIN, T; 
DR   Q9H0B8   , CRLD2_HUMAN, T; Q8BZQ2    , CRLD2_MOUSE, T; 
DR   Q4V9Y5   , CRLD2_XENTR, T; Q8N8Z6    , DCBD1_HUMAN, T; 
DR   Q9D4J3   , DCBD1_MOUSE, T; Q96PD2    , DCBD2_HUMAN, T; 
DR   Q91ZV3   , DCBD2_MOUSE, T; Q91ZV2    , DCBD2_RAT  , T; 
DR   Q26422   , LFC_CARRO  , T; Q95LI2    , VITRN_BOVIN, T; 
DR   Q6UXI7   , VITRN_HUMAN, T; Q8VHI5    , VITRN_MOUSE, T; 
3D   1JBI; 
PR   PRU00123; 
DO   PDOC50820;
//