PROSITE logo

PROSITE entry PS50914

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   BON; MATRIX.
AC   PS50914;
DT   01-AUG-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   BON domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3639259; R2=0.0226507; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=316; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=174; N_SCORE=6.3; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-10,16,-24,18,3,-20,-11,-5,-18,-6,-13,-11,10,-13,-2,-9,-2,-4,-17,-31,-14,0;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-26,31,8,-30,-9,-1,-27,-2,-22,-19,7,-10,-2,-6,0,-8,-19,-33,-16,2;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-19,-5,2,-18,-13,-11,-9,-7,-11,-9,-4,-11,-4,-11,4,2,-5,-28,-15,-2;
MA   /M: M=-5,-8,-22,-9,-7,-12,-19,-8,-5,-4,-5,-2,-8,-19,-5,0,-7,-4,-1,-18,-6,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-23,-21,-28,-20,-3,-29,-23,22,-21,17,11,-20,-22,-14,-18,-13,-2,18,-23,-5,-19;
MA   /M: SY='E'; M=0,-2,-22,-3,12,-19,-17,-10,-17,4,-13,-9,-3,-10,3,5,2,5,-11,-26,-14,6;
MA   /M: SY='E'; M=0,2,-23,2,7,-24,-3,-3,-24,-1,-20,-14,1,-12,4,-2,4,0,-19,-25,-13,5;
MA   /M: SY='K'; M=-6,4,-24,5,7,-25,-14,-8,-22,8,-21,-13,2,-6,5,8,1,0,-16,-27,-15,5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-22,-16,-26,-21,-3,-25,-24,21,-21,9,8,-19,-22,-20,-22,-10,-5,22,-25,-8,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-6,-24,-9,2,-17,-17,-9,-15,9,-10,-5,-3,-15,3,10,-6,-5,-12,-22,-10,2;
MA   /M: SY='S'; M=5,4,-20,5,4,-21,-7,-5,-21,-3,-17,-14,1,-12,-3,-5,6,0,-14,-28,-15,0;
MA   /M: SY='A'; M=6,-9,-17,-10,4,-12,-18,-12,-9,-6,0,-4,-11,-15,-2,-10,-6,-4,-7,-22,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-22,-23,-24,-14,3,-28,-13,13,-19,22,11,-19,-24,-12,-12,-19,-8,7,-20,1,-15;
MA   /M: SY='A'; M=5,-4,-21,-7,-6,-18,-11,-13,-10,-2,-9,-7,-3,-16,-5,-1,-1,-4,-5,-25,-14,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-12,-25,-16,-10,-11,-12,-11,-9,-2,-10,-4,-7,-19,-3,1,-7,-8,-8,-8,-4,-7;
MA   /M: SY='N'; M=-4,6,-23,2,1,-20,-12,-4,-17,3,-15,-10,10,-16,5,4,0,-3,-16,-26,-11,2;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-3,-24,-3,1,-21,-15,-10,-18,4,-17,-11,-1,0,0,6,1,0,-14,-28,-16,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-7,-26,-7,-4,-16,3,-12,-19,-8,-16,-11,-5,-17,-5,-7,-4,-10,-15,-10,-12,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-19,-20,-22,-13,-3,-24,-18,6,-16,11,4,-17,-15,-11,-12,-10,-1,5,-22,-7,-13;
MA   /I: I=-11; MD=-23;
MA   /M: SY='D'; M=-5,6,-24,9,5,-24,-6,-7,-20,0,-19,-14,3,-5,-3,-6,-1,-6,-16,-27,-16,0; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=4,3,-21,2,-3,-17,-5,-12,-18,-9,-16,-13,1,-4,-7,-13,4,1,-14,-22,-15,-5; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-23;
MA   /M: SY='A'; M=3,-7,-21,-11,-8,-8,-10,-12,-9,-11,-9,-8,-3,-11,-7,-12,0,-1,-8,-20,-7,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-3,8,-25,8,2,-26,-1,-1,-25,0,-23,-15,9,-8,1,-2,3,-6,-21,-29,-17,1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-28,-24,-34,-27,1,-34,-25,37,-26,19,18,-22,-23,-19,-25,-17,-6,27,-21,0,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-9,8,-24,7,7,-24,-12,5,-24,9,-23,-13,12,-13,8,10,4,0,-20,-30,-12,7;
MA   /M: SY='V'; M=1,-29,-12,-30,-29,-1,-30,-29,29,-20,10,10,-28,-28,-28,-21,-10,0,46,-29,-10,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-22,4,10,-22,-14,-9,-15,-3,-15,-10,-1,-11,5,-6,5,2,-11,-29,-15,7;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-15,-20,-17,-4,-17,-20,7,-16,-1,-1,-14,-21,-18,-17,0,4,17,-24,-6,-18;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-23,3,6,-15,-18,-2,-14,-4,-12,-9,-2,-14,2,-5,1,0,-11,-24,-4,3;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-7,12,-26,10,5,-27,4,-1,-28,2,-27,-18,17,-8,2,0,4,-6,-26,-30,-19,3;
MA   /M: SY='G'; M=-7,3,-28,4,-6,-29,28,-7,-34,-5,-28,-18,8,-17,-5,0,2,-12,-27,-26,-22,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-9,-23,-11,-5,-17,-17,-4,-6,-2,-10,-3,-5,-18,-1,3,-5,-4,-1,-26,-9,-5;
MA   /M: SY='V'; M=7,-27,-12,-29,-27,-3,-26,-28,25,-19,9,8,-26,-26,-26,-21,-8,-1,40,-27,-11,-27;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-19,-19,-16,-4,-27,-15,9,-12,6,3,-13,-20,-14,-11,-7,9,10,-22,0,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-30,-21,7,-30,-22,22,-28,42,18,-29,-29,-21,-21,-26,-8,16,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-6,-17,-10,-6,-7,-11,-9,-13,-10,-13,-9,-1,-14,-8,-10,10,14,-7,-22,-8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-6,-22,-8,0,-12,-21,-9,-8,-3,-9,-6,-6,-15,-1,-2,-2,4,-6,-18,-4,-1;
MA   /M: SY='V'; M=19,-21,-12,-26,-21,-9,-19,-25,15,-16,2,3,-21,-21,-19,-20,-3,-1,27,-25,-13,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-1,2,-25,3,4,-24,-11,-8,-21,0,-21,-14,2,3,3,-1,2,-3,-18,-27,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-6,16,-20,13,1,-21,-10,-6,-20,-3,-23,-18,18,-11,-2,-4,13,11,-17,-31,-16,-1;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-25,0,14,-24,-15,-7,-16,-3,-13,-10,-7,0,10,-8,-1,-6,-16,-25,-15,11;
MA   /M: SY='E'; M=2,-1,-21,0,8,-20,-12,-5,-14,-3,-11,-8,-3,-13,5,-5,1,-5,-11,-26,-13,6;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-21,2,13,-20,-16,-8,-11,-4,-7,-5,-7,-8,3,-9,-2,-4,-8,-25,-14,8; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=2,-14,-23,-17,-9,-15,-15,-15,-7,5,-7,-3,-10,-18,-6,9,-7,-7,-1,-21,-11,-9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-27,9,24,-28,-13,-5,-25,6,-20,-15,1,-3,12,3,1,-5,-23,-28,-17,17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-13,-23,-16,-6,-13,-19,-10,-9,8,-4,1,-10,-18,-2,11,-9,-7,-4,-21,-8,-5;
MA   /M: SY='A'; M=27,-17,-16,-26,-17,-10,-14,-23,8,-17,2,0,-14,-15,-14,-22,-1,-2,9,-20,-12,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-24,-6,5,-17,-11,-8,-10,-3,-11,-6,-3,-14,-1,-3,-2,-5,-9,-25,-12,1;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-2,-24,1,10,-23,-15,-8,-19,7,-15,-10,-3,-11,6,9,-1,-6,-13,-26,-15,7;
MA   /M: SY='V'; M=7,-22,-12,-26,-21,-4,-23,-23,15,-21,14,6,-21,-23,-19,-21,-11,-5,18,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='A'; M=28,-15,-2,-23,-16,-14,-12,-23,-1,-14,-4,-5,-15,-17,-16,-20,4,3,11,-25,-17,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-5,-26,-5,6,-21,-8,-9,-23,6,-19,-13,-2,-14,4,9,-1,-4,-19,-13,-12,4;
MA   /M: SY='N'; M=1,6,-21,2,3,-23,-1,-6,-21,2,-23,-15,13,-13,3,1,9,0,-18,-29,-18,2;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-16,-27,-21,1,-28,-24,20,-20,12,8,-21,-24,-20,-19,-9,1,26,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-2,-26,0,4,-25,-8,-12,-20,4,-22,-14,-2,4,-1,-2,1,-4,-17,-27,-18,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-3,-28,-3,-14,-28,50,-16,-36,-15,-28,-19,3,-18,-15,-17,1,-16,-27,-21,-24,-15;
MA   /M: SY='V'; M=2,-25,-15,-26,-26,-6,-13,-27,16,-18,2,4,-22,-26,-25,-18,-7,-3,31,-27,-13,-26;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-23,-5,6,-22,-10,-11,-20,10,-18,-11,-3,-12,3,7,0,-4,-13,-20,-14,4;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-23,1,10,-25,-7,-9,-22,3,-21,-14,2,-4,5,-2,7,1,-19,-28,-18,7;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-28,-13,-30,-28,0,-31,-29,30,-21,12,11,-27,-28,-27,-21,-11,1,43,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='D'; M=-9,2,-22,3,-1,-15,-20,-7,-8,-2,-11,-8,-2,-17,-6,-4,-4,-1,-2,-26,-6,-4;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='N'; M=-9,25,-15,19,0,-23,-5,-1,-22,-2,-24,-18,31,-19,-4,-3,5,-3,-21,-37,-19,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-25,0,5,-18,-10,5,-20,2,-16,-10,5,-16,4,4,-4,-9,-18,-23,-7,4;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-21,-32,-24,6,-30,-21,26,-25,26,19,-24,-25,-19,-22,-20,-8,19,-18,1,-23;
MA   /M: SY='T'; M=-6,-3,-16,-6,-2,-16,-19,-11,-15,3,-14,-9,-1,-15,1,5,5,11,-8,-27,-11,-2;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,-15,-26,-21,-4,-20,-23,16,-20,9,6,-21,-24,-19,-20,-11,-4,22,-23,-6,-21;
MA   /M: SY='A'; M=8,-7,-18,-11,-4,-16,-10,-12,-9,-7,-8,-6,-4,-11,-4,-6,2,0,-6,-26,-15,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,1,-24,3,5,-27,-2,-10,-24,-2,-24,-16,1,4,2,-7,7,-1,-20,-28,-20,2;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=23(13); /POSITIVE=23(13); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=4; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=BON;
CC   /VERSION=4;
DR   P64598   , DOLP_ECO57 , T; P64597    , DOLP_ECOL6 , T; 
DR P64596 , DOLP_ECOLI , T; P45301 , DOLP_HAEIN , T;
DR Q7CPQ6 , DOLP_SALTY , T; P46028 , HLY2_ACTPL , T;
DR P0ADE7 , KBP_ECOL6 , T; P0ADE6 , KBP_ECOLI , T;
DR P0AFH9 , OSMY_ECOL6 , T; P0AFH8 , OSMY_ECOLI , T;
DR P55702 , Y4XJ_SINFN , T; Q9RVY3 , Y888_DEIRA , T;
DR P35664 , YGS2_ANACE , T;
DR P65594 , ARFA_MYCBO , N; A1KH31 , ARFA_MYCBP , N;
DR P9WIU4 , ARFA_MYCTO , N; P9WIU5 , ARFA_MYCTU , N;
3D 2KGS; 2KSM; 2L26; 7A2D; 7PVC; 7VCM; PR PRU00229; DO PDOC50914; //