PROSITE entry PS50967
View entry in NiceSite formatView entry in raw text format (no links)
ID HRDC; MATRIX. AC PS50967; DT 01-MAR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE HRDC domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9155555; R2=0.0241654; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=252; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=149; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='B'; M=-7,3,-22,3,1,-20,-12,-5,-17,-2,-16,-11,3,-11,-1,-1,2,-1,-13,-29,-13,-1; MA /M: SY='P'; M=-7,1,-26,5,9,-25,-14,-4,-21,-2,-22,-15,1,10,2,-5,1,-5,-21,-31,-18,4; MA /M: SY='Q'; M=-5,-6,-23,-7,1,-15,-19,-3,-10,-2,-7,-2,-5,-13,2,1,-4,-3,-9,-24,-8,0; MA /M: SY='Q'; M=-7,5,-22,5,8,-22,-15,5,-18,-2,-15,-8,3,-14,11,-2,-2,-8,-19,-26,-9,9; MA /M: SY='Q'; M=-9,-8,-24,-8,1,-14,-19,-8,-8,-5,0,0,-8,-12,3,-1,-9,-6,-10,-24,-10,1; MA /M: SY='A'; M=4,0,-22,-1,4,-22,-9,-9,-17,0,-15,-9,-1,-10,1,-2,0,-4,-12,-25,-15,2; MA /M: SY='L'; M=-2,-25,-4,-28,-22,0,-27,-22,12,-22,19,8,-23,-27,-20,-17,-15,-5,15,-24,-6,-22; MA /M: SY='F'; M=-7,-24,-22,-28,-20,21,-26,-13,6,-20,15,5,-21,-26,-20,-14,-18,-8,4,-2,16,-20; MA /M: SY='E'; M=-9,-1,-27,1,14,-24,-15,-4,-24,14,-19,-11,-1,-12,11,14,-3,-7,-20,-21,-11,11; MA /M: SY='E'; M=-1,-2,-23,-2,5,-18,-15,-2,-16,3,-13,-8,-1,-13,2,4,-3,-7,-13,-25,-11,2; MA /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-31,-21,22,-28,42,19,-28,-28,-20,-20,-27,-9,13,-20,0,-20; MA /M: SY='R'; M=-9,-14,-20,-15,-8,-6,-21,-8,-13,0,-7,-5,-12,-21,-5,9,-12,-8,-10,-4,1,-8; MA /M: SY='E'; M=0,1,-21,1,8,-22,-16,-5,-18,5,-15,-10,-1,-13,5,3,-1,-5,-14,-25,-12,6; MA /M: SY='W'; M=-10,-29,-32,-30,-21,6,-23,-23,-3,-19,5,-4,-29,-26,-17,-18,-26,-15,-9,53,12,-17; MA /M: SY='R'; M=-17,-11,-23,-12,-2,-18,-20,-3,-28,24,-19,-10,-2,-20,6,58,-9,-9,-18,-21,-10,-2; MA /M: SY='D'; M=-10,8,-26,13,13,-23,-18,-5,-22,9,-16,-12,0,-13,4,7,-4,-6,-17,-26,-11,8; MA /M: SY='E'; M=-6,1,-23,0,11,-20,-14,-5,-19,6,-16,-10,3,-13,5,6,2,-1,-15,-27,-13,8; MA /M: SY='I'; M=-7,-18,-24,-20,-10,-5,-28,-15,13,-15,13,9,-16,-20,-6,-13,-15,-7,6,-21,-3,-10; MA /M: SY='A'; M=37,-10,-9,-18,-9,-17,0,-18,-11,-11,-11,-8,-8,-12,-10,-18,10,1,-2,-22,-18,-9; MA /M: SY='R'; M=-7,-1,-25,-1,6,-23,-16,-4,-23,14,-18,-10,2,-14,11,26,-2,-4,-18,-24,-13,6; MA /M: SY='E'; M=-3,1,-25,1,15,-24,-14,-6,-19,9,-17,-10,1,-10,9,7,0,-5,-17,-26,-15,11; MA /M: SY='R'; M=-10,-4,-22,-4,6,-14,-20,0,-16,3,-10,-6,-3,-17,5,11,-7,-8,-14,-22,-5,3; MA /M: SY='D'; M=-11,27,-26,32,7,-30,5,-4,-31,-4,-28,-23,19,-13,-4,-9,3,-8,-25,-35,-21,1; MA /M: SY='V'; M=-8,-15,-18,-15,-3,-11,-26,-13,6,-10,4,4,-15,-17,-7,-10,-10,-6,8,-27,-10,-6; MA /M: SY='P'; M=7,-10,-22,-9,-4,-20,-11,-14,-15,-10,-19,-12,-7,21,-7,-14,8,3,-13,-30,-20,-7; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='P'; M=-5,-17,-28,-14,-7,-17,-20,-14,-10,-7,-13,-8,-15,27,-9,-6,-8,-4,-12,-25,-15,-11; MA /M: SY='Y'; M=-10,-6,-25,-8,-9,0,-8,7,-18,-5,-16,-9,1,-20,-6,0,-3,-6,-17,-10,13,-9; MA /M: SY='Y'; M=-8,-15,-21,-19,-13,1,-22,-8,-2,-7,-6,0,-11,-17,-8,-4,-7,-4,-1,-11,5,-12; MA /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-28,5,-34,-27,35,-25,16,15,-24,-22,-24,-24,-17,-6,32,-21,-2,-28; MA /M: SY='F'; M=-10,-27,-18,-33,-24,30,-28,-18,12,-25,23,15,-23,-25,-24,-19,-21,-9,9,-11,8,-23; MA /M: SY='S'; M=-1,-3,-22,-4,-1,-23,-6,-5,-22,-3,-25,-15,3,6,-1,-4,11,6,-18,-31,-17,-2; MA /M: SY='D'; M=-14,32,-27,36,16,-30,-12,0,-26,1,-24,-21,22,-12,3,-5,2,-5,-25,-36,-18,9; MA /M: SY='E'; M=0,2,-22,1,9,-24,-13,2,-21,4,-20,-11,2,-10,9,0,6,1,-16,-28,-12,8; MA /M: SY='T'; M=4,-7,-14,-14,-11,-13,-13,-13,-3,-11,-5,0,-5,-16,-7,-12,4,11,1,-27,-12,-9; MA /M: SY='L'; M=-9,-29,-22,-32,-23,8,-32,-21,27,-28,36,21,-26,-26,-19,-22,-25,-9,16,-19,2,-22; MA /M: SY='R'; M=-7,-12,-25,-14,-8,-11,-21,-12,-5,1,-3,0,-11,-19,-6,4,-12,-9,-3,-16,-6,-8; MA /M: SY='E'; M=0,7,-21,11,22,-27,-12,-6,-24,3,-21,-17,2,-7,8,-3,6,-2,-20,-30,-18,15; MA /M: SY='M'; M=-7,-26,-22,-33,-24,4,-28,-17,28,-22,25,30,-23,-23,-15,-20,-20,-9,18,-20,-1,-20; MA /M: SY='A'; M=31,-13,-8,-20,-13,-15,-8,-20,-3,-14,-5,-6,-12,-15,-13,-19,7,1,6,-25,-17,-13; MA /M: SY='E'; M=-3,-1,-24,-2,10,-21,-18,-8,-15,7,-13,-8,-1,-12,6,7,-2,-2,-13,-25,-13,7; MA /M: SY='R'; M=-4,-7,-22,-10,-4,-12,-19,-7,-8,2,-8,-3,-3,-17,0,3,-4,-3,-7,-21,-4,-3; MA /M: SY='M'; M=-11,-15,-23,-18,-11,-5,-20,-10,-2,-7,6,8,-13,-20,-3,-2,-15,-8,-5,-11,-2,-7; MA /M: SY='P'; M=-9,-19,-37,-10,-1,-28,-19,-19,-19,-10,-28,-19,-18,80,-10,-19,-7,-7,-28,-30,-29,-10; MA /M: SY='R'; M=-4,-3,-22,-5,-1,-19,-16,-9,-14,5,-13,-6,-3,-12,2,7,0,4,-9,-26,-11,-1; MA /M: SY='B'; M=-4,16,-18,14,3,-22,-7,-6,-22,-4,-23,-18,16,-12,-3,-6,16,14,-16,-35,-17,0; MA /M: SY='L'; M=-2,-13,-21,-14,-7,-8,-21,-15,-1,-8,4,2,-14,-11,-10,-9,-10,-4,0,-23,-9,-9; MA /M: SY='E'; M=1,7,-22,8,13,-26,-9,-6,-22,2,-21,-15,5,-10,6,-4,7,-1,-18,-29,-17,9; MA /M: SY='E'; M=0,10,-25,13,17,-29,-7,-6,-25,4,-21,-16,4,-9,6,-3,3,-6,-20,-28,-18,12; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-17,-31,-23,14,-27,-19,18,-26,33,20,-26,-28,-21,-19,-24,-9,12,-18,1,-21; MA /M: M=-3,-10,-18,-12,-2,-12,-18,-11,-9,-1,-2,-3,-9,-18,-5,-1,-9,-7,-8,-20,-8,-4; MA /M: SY='S'; M=7,2,-19,-2,2,-22,-7,-8,-19,4,-19,-11,5,-12,2,2,8,3,-14,-27,-16,2; MA /M: SY='I'; M=-8,-25,-14,-31,-24,-1,-30,-23,26,-25,20,15,-21,-25,-18,-23,-19,-9,19,-24,-5,-23; MA /M: M=-9,-4,-15,-4,-5,-17,-14,-10,-16,-5,-15,-11,-2,-4,-5,-4,-3,-4,-15,-28,-13,-6; MA /M: SY='G'; M=-5,-4,-27,-4,-11,-23,25,-13,-24,-12,-19,-13,1,-17,-12,-13,-1,-10,-19,-24,-19,-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='V'; M=-6,-20,-22,-21,-16,-2,-23,-20,9,-15,2,5,-18,-8,-16,-16,-10,-5,11,-20,-7,-17; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='G'; M=-3,-3,-21,-6,-9,-17,14,-11,-18,-10,-15,-10,3,-14,-10,-11,2,-3,-14,-24,-17,-10; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='E'; M=-2,-2,-25,0,10,-24,-9,-5,-21,0,-20,-13,-1,2,3,-3,3,-3,-18,-28,-17,5; MA /M: SY='R'; M=-9,-2,-28,0,2,-21,-13,-2,-21,4,-20,-12,-1,-5,3,7,-4,-8,-19,-19,-9,1; MA /M: SY='K'; M=-8,-5,-26,-8,1,-13,-15,-8,-19,16,-17,-7,-2,-15,1,11,-8,-8,-14,-18,-6,0; MA /M: SY='V'; M=-1,-23,-20,-26,-19,-1,-23,-20,13,-17,12,6,-20,-22,-16,-13,-13,-5,14,-19,-3,-19; MA /M: SY='E'; M=-6,4,-25,4,14,-24,-16,-3,-22,10,-19,-13,5,-12,8,11,1,-4,-18,-28,-14,10; MA /M: SY='R'; M=-7,-4,-24,-5,5,-24,-17,2,-21,15,-19,-6,-1,-14,13,19,-4,-7,-16,-24,-10,7; MA /M: SY='Y'; M=-16,-10,-26,-13,-12,15,-24,19,-8,-10,-5,-3,-6,-25,-6,-6,-12,-8,-14,3,40,-11; MA /M: SY='G'; M=1,-13,-25,-15,-19,-17,35,-20,-22,-19,-16,-12,-5,-19,-19,-19,-2,-11,-15,-20,-19,-19; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='E'; M=-5,5,-25,7,11,-24,-13,-2,-21,3,-18,-12,2,-4,3,0,0,-4,-18,-28,-15,6; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='E'; M=-9,2,-25,4,7,-16,-15,-5,-19,5,-13,-9,-2,-12,1,4,-5,-5,-16,-22,-7,3; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-36,-27,25,-32,-24,21,-27,17,10,-23,-24,-25,-22,-21,-10,14,-3,9,-26; MA /M: SY='L'; M=-7,-23,-21,-26,-18,3,-26,-15,15,-23,25,13,-21,-25,-16,-19,-20,-9,8,-18,-1,-18; MA /M: SY='E'; M=3,2,-23,2,10,-25,-11,-6,-21,4,-19,-13,0,-5,7,-1,3,-3,-18,-26,-15,8; MA /M: SY='V'; M=1,-18,-14,-22,-13,-7,-24,-18,11,-16,9,6,-16,-20,-13,-17,-8,0,12,-25,-9,-14; MA /M: SY='I'; M=-8,-29,-17,-35,-28,5,-34,-27,33,-27,19,16,-23,-25,-23,-25,-18,-6,28,-22,-2,-28; MA /M: SY='R'; M=-3,-3,-22,-4,4,-22,-15,-8,-18,9,-16,-8,-2,-14,6,13,-1,-4,-13,-25,-14,4; MA /M: SY='D'; M=-6,10,-23,12,8,-27,-13,0,-26,9,-23,-15,7,-11,8,9,2,-3,-21,-29,-14,7; MA /M: SY='Y'; M=5,-15,-20,-19,-12,6,-16,-4,-6,-13,-4,-5,-12,-18,-11,-14,-4,-3,-5,-8,10,-12; MA /M: M=-3,-12,-15,-14,-7,-14,-15,-14,-10,-4,-7,-5,-9,-16,-6,-1,-6,-6,-7,-18,-10,-8; MA /M: SY='E'; M=-3,1,-25,1,6,-23,-10,-7,-20,6,-19,-11,0,-9,4,1,-1,-6,-16,-24,-13,4; MA /M: SY='E'; M=-5,-2,-24,-2,8,-16,-12,-8,-15,-3,-12,-9,-2,-14,1,-5,-1,-4,-13,-22,-10,4; MA /M: M=-7,-6,-22,-7,-4,-14,-15,-8,-12,-5,-12,-8,-4,-2,-5,-8,-5,-4,-13,-23,-7,-6; MA /M: SY='D'; M=-3,4,-25,6,6,-24,-9,-8,-22,1,-19,-15,4,-1,0,-1,1,-4,-19,-29,-18,2; MA /M: SY='E'; M=-2,-4,-24,-5,5,-16,-16,-9,-8,-8,-7,-7,-2,-7,-2,-10,-3,-4,-10,-27,-13,0; MA /M: SY='E'; M=-3,-1,-23,-2,6,-17,-15,-6,-14,0,-11,-5,-2,-9,3,-4,-2,-2,-13,-24,-10,4; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=53(53); /POSITIVE=53(53); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HRDC; CC /VERSION=3; DR O18017 , BLM_CAEEL , T; Q9I920 , BLM_CHICK , T;
DR Q9VGI8 , BLM_DROME , T; P54132 , BLM_HUMAN , T;
DR O88700 , BLM_MOUSE , T; Q9DEY9 , BLM_XENLA , T;
DR G5EBX6 , EXOSX_CAEEL, T; Q9VFF3 , EXOSX_DROME, T;
DR Q01780 , EXOSX_HUMAN, T; P56960 , EXOSX_MOUSE, T;
DR D4A1X2 , EXOSX_RAT , T; Q09811 , HUS2_SCHPO , T;
DR Q9FT73 , RECQ2_ARATH, T; O34748 , RECQ_BACSU , T;
DR P15043 , RECQ_ECOLI , T; P71359 , RECQ_HAEIN , T;
DR Q9CL21 , RECQ_PASMU , T; P40724 , RECQ_SALTY , T;
DR A5G127 , RND_ACICJ , T; Q6G329 , RND_BARHE , T;
DR C9XUE4 , RND_CROTZ , T; Q6AJF4 , RND_DESPS , T;
DR P09155 , RND_ECOLI , T; A9H9B7 , RND_GLUDA , T;
DR Q0BVP4 , RND_GRABC , T; P44442 , RND_HAEIN , T;
DR Q28RA7 , RND_JANSC , T; B8EN54 , RND_METSB , T;
DR C6C608 , RND_MUSP7 , T; Q1QLI8 , RND_NITHX , T;
DR A7HYE5 , RND_PARL1 , T; A6V8R6 , RND_PSEA7 , T;
DR A1SVE6 , RND_PSYIN , T; A8GFH0 , RND_SERP5 , T;
DR A0KXU5 , RND_SHESA , T; D4Z694 , RND_SPHIU , T;
DR Q5GZ75 , RND_XANOR , T; Q5NPM2 , RND_ZYMMO , T;
DR Q0WVE8 , RP6L1_ARATH, T; A9LLI7 , RP6L2_ARATH, T;
DR Q8L840 , RQL4A_ARATH, T; Q9FT70 , RQL4B_ARATH, T;
DR Q10146 , RRP6_SCHPO , T; Q12149 , RRP6_YEAST , T;
DR P35187 , SGS1_YEAST , T; P64321 , UVRD2_MYCBO, T;
DR P53528 , UVRD2_MYCLE, T; P9WMP8 , UVRD2_MYCTO, T;
DR P9WMP9 , UVRD2_MYCTU, T; Q19546 , WRN_CAEEL , T;
DR Q14191 , WRN_HUMAN , T; O09053 , WRN_MOUSE , T;
DR O93530 , WRN_XENLA , T;
DR A9LLI8 , RP6L3_ARATH, N;
3D 1D8B; 1WUD; 1YT3; 2CPR; 2DGZ; 2E1E; 2E1F; 2HBJ; 2HBK; 2HBL; 2HBM; 2KV2; 3D 2RRD; 3SAF; 3SAG; 3SAH; 4CDG; 4CGZ; 4O3M; 4OO1; 5C0W; 5C0X; 5C0Y; 5K36; 3D 5VZJ; 6D6Q; 6D6R; 6FSZ; 6FT6; 6LQS; 7AUC; 7AUD; 7D4I; 7MQA; PR PRU00328; DO PDOC50967; //