PROSITE entry PS51011
View entry in NiceSite formatView entry in raw text format (no links)
ID ARID; MATRIX. AC PS51011; DT 01-AUG-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE ARID domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=93; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=88; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4749351; R2=0.0184610; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5986.1000977; R2=4.7271385; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=381; H_SCORE=7787; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=219; H_SCORE=7021; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='T'; M=-5,-6,-20,-8,-4,-12,-17,-11,-11,-6,-13,-8,-5,-10,-6,-6,0,2,-8,-16,-8,-5; MA /M: SY='R'; M=-4,-4,-21,-4,6,-24,-9,-9,-24,7,-20,-14,-1,-3,2,11,-2,-7,-20,-26,-18,2; MA /M: SY='E'; M=-4,4,-26,8,17,-24,-17,-8,-20,4,-19,-14,-2,-2,6,-4,0,-6,-17,-28,-16,11; MA /M: SY='R'; M=-11,-4,-27,-5,3,-18,-17,-4,-19,15,-19,-8,1,-11,6,18,-4,-7,-17,-21,-6,3; MA /M: SY='E'; M=-4,-4,-23,-2,5,-17,-18,-5,-12,-1,-7,-5,-6,-12,1,-2,-4,-5,-10,-25,-9,2; MA /M: SY='N'; M=-3,4,-22,2,5,-17,-10,-4,-15,-3,-10,-9,6,-15,-1,-5,-1,-5,-15,-28,-13,2; MA /M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-33,-23,54,-29,-15,-2,-21,6,-1,-20,-28,-28,-14,-20,-11,-4,15,29,-23; MA /M: SY='L'; M=-12,-20,-19,-21,-18,5,-27,-14,10,-21,20,13,-21,-26,-15,-16,-21,-10,6,-12,3,-17; MA /M: SY='D'; M=-6,11,-22,16,15,-28,-15,-6,-25,10,-22,-16,4,-11,5,4,1,-6,-18,-30,-16,10; MA /M: SY='Q'; M=-5,1,-20,1,5,-20,-16,-5,-20,4,-17,-10,0,-14,10,6,1,-4,-17,-24,-10,7; MA /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-29,-21,8,-30,-18,20,-25,33,15,-25,-28,-19,-16,-25,-9,12,-16,4,-21; MA /M: SY='Y'; M=-6,-12,-25,-13,-2,-7,-22,-6,-6,-1,-3,1,-11,-15,0,1,-9,-7,-8,-14,4,-3; MA /M: SY='K'; M=-1,-3,-24,-4,7,-22,-15,-8,-19,14,-19,-7,-1,-9,6,9,-1,-4,-14,-24,-13,6; MA /M: SY='F'; M=-15,-23,-22,-30,-23,54,-27,-7,-2,-23,6,-1,-15,-28,-28,-16,-17,-10,-4,6,30,-23; MA /M: SY='H'; M=-13,-13,-11,-17,-13,-4,-22,13,-7,-14,0,10,-11,-21,-7,-11,-16,-12,-10,-13,4,-11; MA /M: SY='E'; M=-7,2,-23,5,19,-25,-16,-3,-24,8,-19,-12,0,-8,10,5,-2,-8,-22,-23,-14,14; MA /M: SY='E'; M=-8,0,-26,1,10,-20,-18,-1,-17,5,-13,-8,-1,-13,9,6,-2,-5,-16,-24,-8,8; MA /M: SY='R'; M=-13,-5,-25,-6,2,-21,-18,2,-19,11,-15,-5,0,-15,13,24,-6,-8,-18,-23,-8,5; MA /M: SY='G'; M=-1,-6,-25,-8,-15,-25,44,-13,-34,-14,-28,-18,3,-17,-15,-14,1,-15,-27,-20,-24,-15; MA /M: SY='T'; M=-6,-4,-17,-10,-8,-8,-19,-9,-5,-7,-6,0,-1,-16,-7,-6,2,11,-3,-27,-7,-8; MA /M: SY='P'; M=-4,-7,-27,-5,0,-21,-16,-14,-17,-4,-20,-14,-6,24,-6,-9,0,3,-17,-27,-17,-5; MA /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-27,-18,11,-28,-18,12,-18,17,11,-20,-21,-17,-12,-18,-7,8,-16,2,-18; MA /I: I=-8; MD=-17; MA /M: SY='E'; M=-6,3,-19,2,4,-14,-14,-4,-10,-3,-9,-7,4,-8,2,-5,-1,0,-12,-22,-7,2; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='K'; M=-9,-4,-27,-4,5,-22,-18,-1,-20,14,-21,-8,-2,-2,4,12,-5,-7,-17,-25,-11,3; MA /M: SY='I'; M=-4,-16,-23,-17,-14,-10,-22,-18,8,-16,1,0,-13,-6,-12,-16,-10,-7,4,-24,-9,-15; MA /M: SY='P'; M=-7,-17,-35,-10,-3,-24,-19,-19,-16,-11,-24,-15,-17,67,-11,-19,-9,-9,-22,-29,-26,-11; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='V'; M=-5,-14,-21,-17,-11,-5,-23,-10,4,-9,0,3,-11,-20,-9,-10,-7,-3,6,-20,-2,-11; MA /M: SY='I'; M=-8,-27,-23,-33,-26,3,-29,-25,28,-23,15,15,-22,-21,-21,-20,-17,-8,24,-21,-3,-26; MA /M: SY='G'; M=-4,3,-26,5,2,-24,17,-9,-29,-9,-24,-18,4,-12,-3,-12,3,-9,-24,-24,-18,-1; MA /M: SY='G'; M=-6,-3,-27,-6,-9,-19,19,-8,-28,0,-23,-14,6,-19,-8,4,-2,-10,-23,-21,-14,-9; MA /M: SY='R'; M=-12,-4,-23,-5,4,-24,-20,-6,-23,23,-21,-7,-1,-10,10,26,-6,-5,-18,-23,-12,6; MA /M: SY='P'; M=-8,-1,-27,1,5,-23,-17,-9,-15,-1,-19,-12,-1,7,0,-3,-1,-2,-15,-29,-16,1; MA /M: SY='L'; M=-7,-29,-19,-31,-24,4,-31,-24,27,-26,31,17,-27,-27,-22,-21,-21,-6,24,-23,-3,-24; MA /M: SY='D'; M=-17,42,-28,51,13,-34,-7,1,-33,-1,-28,-26,26,-10,0,-8,2,-8,-29,-38,-20,7; MA /M: SY='L'; M=-11,-28,-15,-29,-19,9,-29,-19,15,-26,42,17,-28,-29,-19,-17,-28,-10,7,-20,-1,-19; MA /M: SY='Y'; M=-15,-22,-25,-24,-19,25,-26,8,-5,-18,2,0,-18,-21,-16,-14,-19,-12,-10,13,36,-19; MA /M: SY='R'; M=-10,0,-22,-2,3,-21,-16,-4,-22,16,-20,-9,3,-16,7,20,-3,-5,-17,-24,-10,3; MA /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-18,9,-29,-19,18,-28,43,18,-27,-28,-19,-19,-28,-10,8,-20,0,-18; MA /M: SY='Y'; M=-18,-19,-27,-23,-17,31,-26,3,-6,-11,-2,-2,-14,-26,-15,-6,-17,-10,-10,15,39,-17; MA /M: SY='R'; M=-10,-6,-24,-8,-2,-17,-19,-4,-12,11,-11,-2,-1,-18,3,19,-7,-7,-8,-24,-9,-1; MA /M: SY='L'; M=2,-13,-10,-16,-5,-9,-19,-14,-2,-14,3,-2,-11,-18,-9,-15,-5,-3,-1,-25,-10,-8; MA /M: SY='V'; M=-1,-28,-13,-30,-28,-1,-30,-28,29,-19,10,11,-27,-28,-26,-18,-11,-1,43,-28,-9,-28; MA /M: SY='Q'; M=-4,-4,-21,-7,-2,-18,-19,-5,-7,-1,-11,-2,-2,-16,7,-2,1,3,-5,-25,-8,2; MA /M: SY='E'; M=-4,1,-25,2,17,-25,-14,1,-24,13,-21,-12,2,-10,10,11,2,-5,-20,-27,-13,13; MA /M: SY='R'; M=-12,-13,-25,-14,-3,-4,-22,-1,-10,1,0,1,-9,-20,-2,12,-12,-9,-9,-20,-2,-4; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=0,-9,-29,-9,-17,-29,60,-17,-37,-18,-29,-19,-1,-16,-18,-19,0,-17,-28,-21,-28,-18; MA /M: SY='G'; M=1,-8,-28,-9,-19,-29,63,-19,-38,-19,-29,-20,2,-19,-19,-19,2,-16,-28,-21,-29,-19; MA /M: SY='Y'; M=-11,-21,-19,-26,-20,25,-24,-6,0,-19,6,2,-17,-27,-18,-16,-16,-9,-4,4,26,-19; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-8,12,-25,16,15,-24,-13,-2,-22,2,-18,-14,6,-12,5,-2,-1,-7,-19,-29,-14,10; MA /M: SY='Q'; M=-3,1,-20,-2,8,-24,-17,-6,-17,9,-18,-9,3,-13,11,5,1,-1,-14,-27,-14,9; MA /M: SY='V'; M=-2,-27,-15,-29,-26,-2,-27,-28,28,-21,10,9,-25,-26,-25,-21,-10,-2,38,-28,-9,-27; MA /M: SY='T'; M=-3,-1,1,-7,-9,-14,-18,-15,-10,-13,-10,-9,0,-18,-11,-14,7,14,-4,-34,-14,-10; MA /M: SY='K'; M=-4,2,-25,1,7,-25,-7,-6,-24,13,-23,-12,5,-13,6,13,2,-4,-19,-26,-16,6; MA /I: I=-11; MD=-23; MA /M: SY='N'; M=-7,7,-22,7,3,-22,-7,-6,-21,3,-19,-13,8,-14,0,2,2,-2,-16,-29,-15,1; D=-11; MA /I: I=-11; MD=-23; MA /M: SY='K'; M=-7,4,-26,2,8,-26,-13,-2,-27,23,-24,-12,7,-13,9,23,-4,-8,-21,-24,-13,7; D=-11; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='K'; M=-10,-11,-25,-11,-3,-15,-20,-11,-9,8,-7,-1,-10,-18,2,7,-11,-8,-7,-15,-6,-1; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='W'; M=-19,-38,-48,-38,-28,8,-21,-29,-18,-18,-18,-18,-38,-29,-19,-19,-38,-28,-27,137,27,-19; MA /M: SY='K'; M=-2,-1,-24,-2,1,-24,-9,-7,-24,14,-22,-12,2,-11,1,14,1,-4,-16,-25,-14,0; MA /M: SY='E'; M=-12,6,-29,8,20,-28,-17,1,-25,15,-21,-11,4,-9,18,12,-4,-9,-24,-25,-13,19; MA /M: SY='V'; M=-4,-29,-19,-34,-28,1,-33,-28,35,-25,19,16,-26,-26,-24,-24,-16,-5,36,-25,-5,-28; MA /M: SY='A'; M=14,-13,-13,-20,-16,-6,-6,-14,-6,-14,-7,-6,-11,-18,-14,-18,1,1,-2,-14,0,-16; MA /M: SY='E'; M=-6,1,-24,3,13,-25,-14,-5,-19,5,-16,-7,-1,-11,12,5,0,-3,-17,-26,-14,12; MA /M: SY='E'; M=-9,3,-26,5,13,-21,-12,-5,-22,10,-18,-10,1,-12,4,9,-2,-5,-18,-25,-12,8; MA /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-30,-21,19,-27,-16,14,-25,32,19,-25,-24,-20,-18,-24,-9,6,-14,5,-20; MA /M: SY='G'; M=-5,1,-21,-3,-8,-25,24,-7,-28,-8,-25,-16,11,-19,-5,-3,3,-10,-24,-27,-21,-7; MA /M: SY='F'; M=-11,-21,-22,-25,-20,10,-23,-11,9,-21,7,4,-16,-17,-17,-19,-14,-8,3,-12,10,-20; MA /M: SY='P'; M=-5,-9,-29,-5,1,-24,-10,-11,-20,-6,-23,-15,-7,30,-5,-12,0,-4,-21,-29,-20,-4; MA /M: SY='P'; M=-3,-3,-22,-2,-1,-20,-14,-14,-17,-2,-19,-13,-4,7,-6,-6,0,0,-13,-28,-17,-5; MA /I: I=-6; MD=-12; MA /M: SY='T'; M=-3,-5,-15,-6,-4,-12,-10,-6,-13,-4,-9,-7,-3,-12,-4,-2,3,5,-8,-20,-5,-5; D=-6; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; MA /M: SY='A'; M=2,-5,-4,-9,-10,-12,-4,-11,-6,-10,-8,-3,-1,-13,-9,-12,1,-1,-4,-23,-13,-10; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='T'; M=-1,-2,-17,-5,-1,-18,-13,-11,-14,1,-18,-10,1,-7,-1,-3,11,13,-8,-28,-13,-1; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='S'; M=9,5,-11,0,-1,-22,-3,-8,-19,-7,-22,-16,10,-11,-2,-10,15,4,-14,-32,-19,-2; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='A'; M=15,-14,-17,-18,-13,-12,-7,-19,-3,-13,-5,-5,-11,-17,-13,-13,0,-3,4,-18,-13,-13; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-12; MA /M: SY='A'; M=11,-8,-19,-11,-10,-18,6,-16,-14,-12,-12,-10,-5,-14,-10,-14,7,0,-8,-25,-17,-10; MA /M: SY='Y'; M=-6,-8,-23,-12,-8,-1,-14,-3,-13,-6,-14,-9,-3,-15,-5,-7,1,2,-13,-9,7,-7; MA /M: SY='T'; M=-3,-6,-11,-9,-4,-14,-18,-6,-9,-7,-7,-5,-3,-18,-4,-7,1,5,-5,-30,-10,-5; MA /M: SY='L'; M=-7,-28,-20,-31,-23,9,-30,-23,23,-27,31,15,-25,-26,-22,-21,-21,-5,17,-20,-1,-23; MA /M: SY='R'; M=-13,-5,-25,-5,3,-22,-20,-5,-25,27,-21,-9,-2,-16,8,35,-7,-7,-17,-20,-7,3; MA /M: SY='R'; M=-3,-2,-19,-4,1,-22,-13,-8,-17,4,-16,-9,0,-14,4,5,3,2,-12,-27,-13,2; MA /M: SY='H'; M=-2,-13,-20,-16,-10,-8,-21,16,-6,-10,-5,1,-9,-18,-2,-9,-9,-10,-7,-18,8,-8; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-21,-20,30,-30,18,1,-11,0,0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-9,28,77,-20; MA /M: SY='E'; M=-11,-5,-17,-5,8,-12,-22,-4,-10,-3,-4,0,-7,-16,2,-3,-9,-7,-12,-24,-6,4; MA /M: SY='R'; M=-11,1,-27,-1,6,-25,-17,-4,-26,26,-23,-11,5,-14,10,32,-3,-5,-20,-24,-12,6; MA /M: SY='Y'; M=-11,-18,-21,-22,-19,12,-27,4,5,-16,5,3,-14,-26,-13,-14,-16,-9,-2,0,31,-19; MA /M: SY='L'; M=-9,-29,-21,-31,-21,9,-31,-22,24,-27,36,19,-27,-27,-20,-21,-25,-9,16,-20,0,-22; MA /M: SY='Y'; M=-12,-16,-23,-16,-10,7,-23,-3,0,-15,11,3,-14,-24,-11,-11,-16,-8,-5,-10,16,-12; MA /M: SY='P'; M=-6,-7,-31,-1,6,-28,-13,-10,-23,0,-26,-16,-7,35,-2,-7,-3,-7,-24,-29,-22,0; MA /M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-27,-22,44,-29,1,-2,-18,3,-1,-21,-29,-20,-14,-21,-11,-8,26,53,-21; MA /M: SY='E'; M=-10,13,-28,22,44,-29,-17,-2,-27,6,-19,-19,3,-5,13,-2,-1,-9,-25,-31,-19,28; MA /M: SY='R'; M=-10,-4,-4,-6,0,-18,-19,-7,-16,0,-12,-7,-2,-19,-1,5,-6,-6,-12,-28,-12,-2; MA /M: SY='Y'; M=-12,-14,-26,-16,-9,7,-24,1,-5,-9,-2,-2,-12,-22,-10,-6,-14,-10,-6,-3,16,-11; MA /M: M=-7,-8,-19,-9,-3,-12,-21,0,-9,-5,-5,-3,-7,-18,-2,-6,-7,-6,-9,-19,-2,-3; MA /M: SY='K'; M=-7,-3,-20,-3,1,-15,-18,-8,-16,3,-15,-9,-2,-10,-3,3,0,-1,-10,-27,-11,-2; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=73(73); /POSITIVE=73(73); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=ARID; CC /VERSION=5; DR O14497 , ARI1A_HUMAN, T; A2BH40 , ARI1A_MOUSE, T;
DR Q8NFD5 , ARI1B_HUMAN, T; E9Q4N7 , ARI1B_MOUSE, T;
DR A2BEA6 , ARI3A_DANRE, T; Q99856 , ARI3A_HUMAN, T;
DR Q62431 , ARI3A_MOUSE, T; Q6GQD7 , ARI3A_XENLA, T;
DR Q5XGD9 , ARI3A_XENTR, T; Q8IVW6 , ARI3B_HUMAN, T;
DR Q9Z1N7 , ARI3B_MOUSE, T; A6NKF2 , ARI3C_HUMAN, T;
DR A6PWV5 , ARI3C_MOUSE, T; P29374 , ARI4A_HUMAN, T;
DR F8VPQ2 , ARI4A_MOUSE, T; Q4LE39 , ARI4B_HUMAN, T;
DR A2CG63 , ARI4B_MOUSE, T; Q9JKB5 , ARI4B_RAT , T;
DR Q3SWY1 , ARI5A_BOVIN, T; Q03989 , ARI5A_HUMAN, T;
DR Q3U108 , ARI5A_MOUSE, T; E1BLP6 , ARI5B_BOVIN, T;
DR E2R9X2 , ARI5B_CANLF, T; Q5ZJ69 , ARI5B_CHICK, T;
DR E7F888 , ARI5B_DANRE, T; Q14865 , ARI5B_HUMAN, T;
DR Q8BM75 , ARI5B_MOUSE, T; Q84JT7 , ARID1_ARATH, T;
DR A0A0K3AXH1, ARID1_CAEEL, T; Q9LDD4 , ARID2_ARATH, T;
DR Q68CP9 , ARID2_HUMAN, T; E9Q7E2 , ARID2_MOUSE, T;
DR Q940Y3 , ARID3_ARATH, T; Q6NQ79 , ARID4_ARATH, T;
DR Q0WNR6 , ARID5_ARATH, T; C0SUW7 , ARID6_ARATH, T;
DR O02326 , CFI1_CAEEL , T; Q4H3P5 , DRI_CIOIN , T;
DR Q24573 , DRI_DROME , T; Q8MQH7 , DRI_STRPU , T;
DR Q03214 , ECM5_YEAST , T; Q9LTT3 , HMG10_ARATH, T;
DR Q9LG02 , HMG11_ARATH, T; Q9MAT6 , HMG15_ARATH, T;
DR Q9SGS2 , HMGB9_ARATH, T; Q5F363 , JARD2_CHICK, T;
DR Q1LVC2 , JARD2_DANRE, T; Q92833 , JARD2_HUMAN, T;
DR Q62315 , JARD2_MOUSE, T; Q9US53 , JMJ2_SCHPO , T;
DR Q6IQX0 , KD5BB_DANRE, T; P29375 , KDM5A_HUMAN, T;
DR Q3UXZ9 , KDM5A_MOUSE, T; Q5F3R2 , KDM5B_CHICK, T;
DR Q9UGL1 , KDM5B_HUMAN, T; Q80Y84 , KDM5B_MOUSE, T;
DR Q38JA7 , KDM5C_CANLF, T; P41229 , KDM5C_HUMAN, T;
DR P41230 , KDM5C_MOUSE, T; A1YVX4 , KDM5C_PIG , T;
DR Q30DN6 , KDM5D_CANLF, T; Q9BY66 , KDM5D_HUMAN, T;
DR Q62240 , KDM5D_MOUSE, T; Q5XUN4 , KDM5D_PANTR, T;
DR Q61T02 , KDM5_CAEBR , T; Q23541 , KDM5_CAEEL , T;
DR Q9VMJ7 , KDM5_DROME , T; Q9HDV4 , LID2_SCHPO , T;
DR Q8IN94 , OSA_DROME , T; Q9P7W8 , RSC9_SCHPO , T;
DR O74365 , SOL1_SCHPO , T; P09547 , SWI1_YEAST , T;
DR Q09441 , SWSN7_CAEEL, T;
3D 1C20; 1IG6; 1KKX; 1KN5; 1KQQ; 1RYU; 2CXY; 2EH9; 2EQY; 2JRZ; 2JXJ; 2KK0; 3D 2LI6; 2LM1; 2OEH; 2RQ5; 2YQE; 4LJX; 5CEH; 5K4L; 5V9P; 5V9T; 6L87; 6LQF; 3D 6LTH; 6LTJ; 6UXV; 6UXW; 7C4J; 7EGM; 7EGP; 7KSO; 7V8N; 7VDV; 7Y8R; PR PRU00355; DO PDOC51011; //