PROSITE logo

PROSITE entry PS51061

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   R3H; MATRIX.
AC   PS51061;
DT   01-JAN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   R3H domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0811083; R2=0.0214359; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2745.0908203; R2=3.1363637; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=277; H_SCORE=3614; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; H_SCORE=3247; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B0=-250; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-9,1,-26,2,9,-22,-16,-6,-19,10,-16,-10,1,-12,5,13,-3,-6,-15,-26,-14,6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-1,-27,0,3,-20,-16,-5,-17,9,-13,-5,-1,-13,2,11,-8,-9,-14,-24,-11,1;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-12,-24,-15,-7,4,-21,-11,-13,-1,-8,-5,-7,-19,-6,11,-7,-2,-10,-10,-1,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-18,-17,-8,-10,-24,-14,1,-6,3,2,-12,-20,-6,-2,-11,-5,1,-23,-7,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-1,-24,1,10,-18,-19,-7,-11,-2,-5,-6,-4,-14,1,-4,-5,-6,-11,-26,-11,4;
MA   /M: SY='E'; M=-7,4,-25,6,12,-23,-15,-2,-23,8,-19,-12,2,-11,9,6,1,-1,-19,-23,-10,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-21,-28,-21,8,-29,-19,19,-22,24,16,-23,-25,-18,-18,-20,-8,14,-16,2,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-25,0,21,-20,-22,-7,-14,5,-13,-10,-5,-10,7,3,-3,-6,-13,-25,-11,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-25,3,14,-25,-16,-4,-20,11,-18,-10,3,-11,13,8,1,-3,-18,-26,-14,13;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-9,-21,-8,0,-11,-23,-10,-3,-6,3,2,-11,-18,-3,-4,-11,-8,-4,-24,-7,-2;
MA   /M: SY='I'; M=6,-22,-19,-27,-20,-3,-20,-21,14,-19,13,9,-18,-21,-16,-18,-11,-5,13,-21,-7,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-6,-25,-6,5,-15,-21,-7,-6,-3,-3,-3,-6,-16,2,-3,-8,-7,-6,-24,-8,2;
MA   /M: SY='D'; M=-5,10,-25,12,11,-26,-13,-4,-25,12,-21,-14,6,-12,5,10,0,-5,-19,-28,-15,8;
MA   /M: SY='F'; M=-7,-26,-19,-33,-24,34,-26,-20,9,-25,16,6,-21,-26,-27,-20,-17,-7,7,-5,12,-24;
MA   /M: SY='V'; M=9,-20,-19,-25,-15,-4,-21,-19,10,-14,7,5,-17,-19,-14,-14,-8,-5,11,-19,-6,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,4,-25,4,9,-24,-14,-1,-19,6,-17,-10,3,-13,10,3,-1,-7,-17,-24,-11,8;
MA   /M: SY='D'; M=-5,7,-23,8,5,-25,-10,-6,-22,5,-22,-14,7,-13,5,5,7,0,-16,-30,-16,4;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-18,-5,-4,-15,-16,-15,-6,-6,-13,-9,-5,-9,-9,-11,2,0,2,-30,-15,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,0,-23,-1,4,-19,-16,-8,-13,2,-10,-6,1,-13,2,1,-2,-3,-12,-27,-13,2;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-26,2,12,-25,-14,-2,-21,9,-20,-10,4,-6,12,8,1,-5,-20,-26,-14,11;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-2,-18,-4,1,-21,-10,-8,-18,-2,-18,-11,0,-11,5,-2,10,9,-13,-28,-13,2;
MA   /M: M=-6,-8,-21,-9,-8,-13,0,-10,-15,-6,-13,-8,-4,-19,-7,-6,-3,-8,-11,-21,-8,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-24,-5,7,-14,-21,-7,-15,7,-9,-5,-6,-14,5,7,-8,-7,-13,-20,-7,5;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-9,-24,-8,1,-8,-20,-8,-13,-4,-10,-8,-8,-2,-4,-4,-4,-3,-12,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-23,-21,-12,12,-26,-11,1,-13,2,0,-16,-13,-15,-11,-13,-8,1,-14,4,-13;
MA   /I: I=-6; MD=-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-20,-2,5,-11,-16,-1,-13,0,-11,-7,-3,-4,2,-3,-2,-3,-11,-19,-6,3; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-12;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-10,-11,-11,-8,1,-13,-6,4,-11,10,6,-9,-10,-7,-8,-8,-1,1,-12,-1,-8; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-14,-33,-7,2,-26,-16,-16,-20,-9,-27,-18,-13,60,-7,-17,-2,-5,-25,-30,-26,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-19,-11,-25,-17,-3,-21,-8,7,-14,14,27,-17,-21,-7,-9,-16,-7,3,-23,-4,-12;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,-16,3,-2,-19,-8,-7,-19,-5,-24,-17,16,-4,-3,-5,16,14,-16,-35,-18,-4;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-22,-4,-1,-23,-5,-12,-20,-1,-25,-16,2,7,-2,-4,11,3,-16,-31,-20,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-10,-25,-12,-7,11,-21,3,-10,-9,-8,-6,-7,-18,-8,-7,-8,-7,-11,-6,20,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-11,3,-28,8,24,-23,-20,7,-20,3,-14,-9,-2,-11,16,-2,-5,-10,-21,-22,-7,19;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-10,-25,-12,-3,-16,-18,-7,-15,16,-9,1,-7,-17,3,21,-10,-7,-11,-20,-7,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-25,-21,-30,-21,5,-29,-19,21,-22,21,15,-22,-24,-16,-18,-17,-6,16,-20,-1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-25,-20,-30,-23,-3,-30,-24,27,-22,14,12,-21,-23,-16,-21,-12,-4,25,-24,-6,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-2,-29,-2,-1,-17,-20,89,-28,-9,-19,-1,7,-20,8,0,-10,-19,-28,-26,21,-1;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-24,2,10,-22,-17,-5,-19,4,-14,-8,0,-12,10,8,1,2,-16,-26,-12,9;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-27,-16,-31,-24,6,-30,-23,23,-25,27,15,-26,-27,-21,-21,-19,-5,20,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='A'; M=24,-13,-4,-20,-14,-14,-11,-19,-3,-14,-5,-5,-11,-17,-12,-19,4,0,5,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-26,4,16,-25,-11,-1,-24,5,-21,-14,5,-11,12,3,1,-7,-23,-19,-14,14;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-1,-25,-2,-2,-10,-20,4,-12,2,-12,-6,0,-18,-2,1,-8,-7,-11,-17,4,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-13,-25,-15,-9,13,-22,8,-7,-11,-2,1,-11,-18,-9,-9,-12,-9,-10,-5,23,-10;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-5,2,-28,2,-7,-29,35,-8,-35,-8,-28,-18,8,-17,-8,-7,1,-14,-28,-25,-23,-8;
MA   /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-18,-28,-22,5,-29,-16,21,-25,29,17,-25,-27,-19,-20,-21,-8,17,-22,-1,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-8,1,-23,2,7,-19,-18,-6,-15,5,-16,-10,1,-14,3,5,0,0,-11,-26,-10,4;
MA   /M: SY='S'; M=0,0,-16,-1,0,-19,-8,11,-21,-9,-22,-13,7,-12,1,-7,20,14,-14,-34,-9,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-22,-3,3,-9,-18,-2,-15,1,-14,-9,-1,-16,-2,1,-3,-3,-11,-21,-2,0;
MA   /M: SY='S'; M=7,-7,-12,-8,-7,-14,-3,-14,-11,-13,-19,-13,1,-15,-7,-13,25,13,-1,-35,-16,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-3,-23,-3,8,-9,-18,-3,-14,-4,-11,-8,-4,-15,1,-6,-2,-3,-11,-21,-3,4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-28,3,-9,-30,40,-14,-36,-11,-28,-20,4,-16,-10,-12,1,-13,-27,-24,-25,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-25,12,18,-25,-15,-5,-22,4,-20,-14,3,-5,6,1,1,-3,-18,-30,-16,12;
MA   /M: SY='G'; M=-6,5,-29,10,15,-30,16,-7,-33,-3,-25,-19,3,-9,1,-8,1,-12,-28,-27,-22,8;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-5,-31,0,6,-26,-13,-11,-22,-1,-23,-16,-6,27,-3,-7,-5,-7,-23,-26,-19,0;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-24,8,7,-19,-13,5,-20,3,-19,-12,10,-15,4,0,1,-5,-19,-25,-6,5;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-10,-16,-11,-4,-20,-21,-6,-25,21,-19,-10,-2,-21,4,47,-8,-8,-14,-24,-12,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-25,-12,-7,-7,-22,11,-13,3,-12,-4,-3,-21,1,16,-8,-8,-10,-16,9,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-20,-31,-26,3,-32,-24,29,-24,21,15,-25,-24,-22,-22,-17,-4,27,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-19,-16,-22,-20,-2,-25,-17,12,-12,3,5,-16,-25,-17,-7,-8,-1,21,-25,-5,-19;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-26,-20,-31,-25,1,-31,-25,27,-18,14,13,-23,-24,-21,-18,-15,-5,28,-22,-3,-24;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-8,-17,-11,-6,-5,-18,-9,-11,-4,-11,-8,-5,-15,-6,-4,4,8,-7,-19,2,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-8,-27,-8,0,-19,-17,-7,-19,11,-18,-9,-5,4,0,7,-6,-7,-17,-22,-10,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-23,-3,2,-20,-17,-9,-17,9,-19,-10,-1,-7,0,7,-1,-2,-11,-27,-14,0;
MA   /M: SY='R'; M=-8,2,-21,2,2,-22,-12,-5,-21,6,-20,-12,3,-10,1,7,-1,-3,-16,-28,-14,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=52(52); /POSITIVE=52(52); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=11; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=V_Lesaux;
CC   /TAXO-RANGE=??EPV; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=R3H;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9UBL0   , ARP21_HUMAN, T; Q9DCB4    , ARP21_MOUSE, T; 
DR Q09868 , CIP2_SCHPO , T; Q8MSX1 , ENC_DROME , T;
DR O74853 , FAP1H_SCHPO, T; P53971 , FAP1_YEAST , T;
DR F4INY4 , HVT1_ARATH , T; Q01620 , KHPB_BACSU , T;
DR D0VX24 , KHPB_CLOSY , T; Q9RCA6 , KHPB_HALH5 , T;
DR F9ULM5 , KHPB_LACPL , T; A0A0H2ZPS7, KHPB_STRP2 , T;
DR Q8CY87 , KHPB_STRR6 , T; A6QLA0 , NFX1_BOVIN , T;
DR Q18034 , NFX1_CAEEL , T; Q12986 , NFX1_HUMAN , T;
DR B1AY10 , NFX1_MOUSE , T; F4IDQ6 , NIH_ARATH , T;
DR O15226 , NKRF_HUMAN , T; Q8BY02 , NKRF_MOUSE , T;
DR P69341 , PARN_BOVIN , T; Q7ZU92 , PARN_DANRE , T;
DR O95453 , PARN_HUMAN , T; Q8VDG3 , PARN_MOUSE , T;
DR Q5RC51 , PARN_PONAB , T; Q90ZA1 , PARN_XENLA , T;
DR Q9Y3T6 , R3HC1_HUMAN, T; Q8BSI6 , R3HC1_MOUSE, T;
DR Q15032 , R3HD1_HUMAN, T; A0JNC2 , R3HD2_BOVIN, T;
DR Q9Y2K5 , R3HD2_HUMAN, T; Q80TM6 , R3HD2_MOUSE, T;
DR Q2KIL7 , R3HD4_BOVIN, T; Q96D70 , R3HD4_HUMAN, T;
DR Q4VBF2 , R3HD4_MOUSE, T; Q05672 , RBS1_YEAST , T;
DR P38935 , SMBP2_HUMAN, T; Q60560 , SMBP2_MESAU, T;
DR P40694 , SMBP2_MOUSE, T; Q9EQN5 , SMBP2_RAT , T;
DR Q7SYJ9 , SPAG7_DANRE, T; O75391 , SPAG7_HUMAN, T;
DR Q7TNE3 , SPAG7_MOUSE, T; A5DEF8 , SQS1_PICGU , T;
DR Q875B6 , SQS1_PODAS , T; P40798 , STC_DROME , T;
DR P51281 , YCF45_PORPU, T; O74363 , YND2_SCHPO , T;
DR Q5UQM4 , YR431_MIMIV, T; Q9H6S0 , YTDC2_HUMAN, T;
DR B2RR83 , YTDC2_MOUSE, T; Q5R746 , YTDC2_PONAB, T;
DR Q9SY59 , NFXL1_ARATH, N; Q59UG4 , SQS1_CANAL , N;
DR Q6FP19 , SQS1_CANGA , N; Q6BYP9 , SQS1_DEBHA , N;
DR Q75E62 , SQS1_EREGS , N; Q6CQ59 , SQS1_KLULA , N;
DR A5DSB5 , SQS1_LODEL , N; A7TQN2 , SQS1_VANPO , N;
DR Q6C233 , SQS1_YARLI , N; A6ZRL6 , SQS1_YEAS7 , N;
DR P53866 , SQS1_YEAST , N;
3D 1MSZ; 1UG8; 1WHR; 2A1R; 2A1S; 2CPM; 2LRR; 3D45; 3GKU; PR PRU00382; DO PDOC51061; //