PROSITE logo

PROSITE entry PS51100

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   PTS_EIIB_TYPE_3; MATRIX.
AC   PS51100;
DT   01-APR-2005 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   PTS_EIIB type-3 domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0987334; R2=0.0149791; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7160.5034180; R2=5.0758986; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=561; H_SCORE=10008; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=294; H_SCORE=8653; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-25,2,13,-21,-17,-4,-14,10,-10,6,-5,-10,6,1,-7,-9,-13,-25,-12,10;
MA   /M: SY='M'; M=-9,-12,-25,-16,-6,-15,-25,-13,1,6,-1,8,-10,-16,3,0,-10,-2,-2,-21,-6,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-10,4,-24,-1,2,-22,-17,5,-24,21,-23,-10,9,-14,4,18,-1,3,-18,-26,-8,2;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-28,-22,-32,-28,-2,-24,-28,30,-25,15,12,-23,-25,-24,-24,-16,-7,29,-24,-7,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-21,-28,-23,4,-20,-14,18,-20,19,21,-23,-26,-16,-18,-19,-9,14,-16,5,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-20,-32,-25,5,-32,-25,29,-27,33,17,-28,-28,-23,-22,-23,-7,25,-23,-3,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-2,-32,-25,19,-30,-23,12,-28,25,9,-27,-31,-28,-21,-21,-8,14,-19,1,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=26,-6,-12,-11,-8,-20,6,-17,-17,-11,-19,-14,-1,-11,-8,-16,20,9,-7,-28,-20,-8;
MA   /M: SY='G'; M=13,-15,-25,-18,-18,-19,29,-21,-23,-18,-15,-13,-10,-19,-17,-20,-4,-14,-17,-3,-18,-17;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,61,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,5,-15,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='M'; M=4,-17,-20,-25,-20,4,5,-13,-6,-17,-1,12,-13,-20,-15,-17,-8,-10,-4,-14,-6,-17;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-9,-15,-15,-10,-21,-15,5,-10,-5,-10,31,34,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-11,-15,-15,-10,-19,-15,5,-10,-5,-10,29,36,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='S'; M=13,-3,-14,-5,-6,-22,15,-13,-23,-12,-28,-19,5,-12,-6,-13,27,9,-13,-33,-22,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-23,-21,-26,-15,-1,-26,-16,15,-21,29,18,-22,-23,-7,-16,-20,-9,6,-20,-3,-12;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-18,20,-28,47,25,-29,-29,-18,-19,-29,-10,10,-20,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=29,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,7,-14,-2,-2,-18,-18,-18,-20,2,0,21,-24,-16,-18;
MA   /M: SY='N'; M=-4,14,-20,6,3,-23,-9,-2,-21,9,-27,-15,23,-13,8,4,12,6,-20,-32,-16,6;
MA   /M: SY='K'; M=4,5,-23,-2,2,-24,-11,-7,-23,22,-24,-12,10,-13,3,16,-1,-5,-17,-24,-15,2;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-19,-31,-23,1,-26,-13,26,-17,22,39,-23,-23,-12,-16,-19,-8,21,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-11,3,-23,-3,-2,-20,-16,-3,-17,12,-19,-9,12,-18,6,24,-1,0,-13,-27,-13,1;
MA   /M: SY='K'; M=4,-3,-25,-4,13,-25,-17,-12,-18,20,-19,-10,-4,-9,5,6,-4,-8,-13,-22,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=19,-3,-19,-5,9,-26,2,-11,-20,-4,-18,-13,-3,-9,5,-11,9,-4,-15,-24,-20,7;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-3,11,-22,7,11,-14,-13,-6,-21,2,-19,-15,12,-12,-1,-4,3,1,-18,-27,-13,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,2,-23,1,12,-20,-17,-7,-19,10,-14,-11,4,-12,4,9,1,1,-16,-28,-13,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-7,-27,-6,8,-9,-24,3,-13,1,-7,-4,-8,-16,12,4,-7,-3,-16,-10,12,8;
MA   /M: SY='G'; M=-4,2,-29,1,3,-29,38,-11,-35,-10,-28,-20,8,-15,-7,-12,1,-15,-30,-25,-26,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-29,-19,-33,-27,2,-32,-24,33,-24,22,21,-26,-26,-21,-22,-18,-6,31,-24,-4,-26;
MA   /M: SY='D'; M=-17,21,-33,35,16,-34,-15,-5,-33,2,-28,-24,5,15,0,-2,-4,-10,-29,-34,-21,6;
MA   /M: SY='V'; M=13,-22,17,-27,-24,-10,-21,-27,5,-19,-2,-2,-22,-26,-24,-22,-4,-2,22,-31,-17,-24;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-21,-18,-14,-11,-25,1,6,-9,-5,3,-9,-19,-9,-10,-4,0,9,-27,-3,-14;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
MA   /M: SY='V'; M=15,-23,-16,-30,-23,-7,-22,-26,22,-20,6,6,-20,-20,-20,-23,-6,-3,26,-23,-10,-23;
MA   /M: SY='E'; M=5,7,-22,7,14,-24,-2,-9,-20,-3,-18,-16,4,-11,-1,-10,3,-7,-15,-29,-20,6;
MA   /M: SY='A'; M=41,-8,-10,-15,-8,-20,0,-18,-12,-10,-15,-12,-5,-10,-8,-18,17,5,-2,-25,-20,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-20,-26,-25,-23,9,7,-19,-5,-23,-5,-4,-12,-22,-23,-21,-10,-13,-5,-8,1,-23;
MA   /M: SY='G'; M=12,-8,-20,-10,-10,-23,18,-18,-23,-13,-23,-16,-3,-1,-11,-17,11,2,-16,-26,-23,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-2,-26,0,21,-12,-20,2,-17,1,-13,-11,-6,-11,9,-5,-2,-3,-18,-13,7,14;
MA   /M: SY='G'; M=2,-12,-25,-15,-19,-17,29,-17,-19,-18,-17,-11,-5,-19,-17,-19,-1,-7,-14,-16,-12,-19;
MA   /M: SY='E'; M=5,-2,-24,-1,22,-22,-16,-10,-19,8,-11,-10,-6,-8,5,-1,-3,-7,-15,-24,-15,14;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-16,-21,-22,-16,10,-22,12,-1,-18,4,8,-10,-21,-12,-14,-11,-5,-3,-17,8,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-3,-27,-6,-3,-18,-6,-4,-25,18,-22,-11,3,-17,1,21,-6,-9,-19,-16,-3,-3;
MA   /M: SY='D'; M=-14,22,-29,33,24,-30,-17,-4,-29,9,-19,-18,6,-10,5,0,-5,-10,-24,-31,-16,15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-11,-29,-13,-3,-4,-26,-1,-4,10,-7,5,-11,-18,0,2,-15,-10,-8,-6,19,-4;
MA   /M: SY='M'; M=3,-7,-21,-12,-5,-15,-4,-9,-8,-4,-3,7,-4,-16,-4,-8,-7,-8,-8,-23,-13,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,2,-30,4,17,-31,-7,-4,-27,10,-25,-13,4,3,17,3,-2,-10,-28,-26,-18,16;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-27,18,22,-28,-17,-3,-21,1,-21,-16,6,0,9,-5,-1,-8,-20,-32,-19,15;
MA   /M: SY='Y'; M=2,-22,-2,-27,-22,11,-23,-14,3,-19,3,-1,-21,-27,-21,-19,-11,-6,8,-10,12,-22;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=2,-28,-15,-30,-25,0,-28,-26,25,-22,19,11,-27,-27,-24,-21,-14,-4,32,-25,-8,-25;
MA   /M: SY='V'; M=5,-25,-1,-30,-25,-5,-27,-27,19,-22,9,6,-23,-25,-23,-23,-11,-4,25,-27,-11,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23,6,-32,-21,28,-28,39,24,-26,-26,-18,-22,-26,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-31,-22,8,-31,-22,25,-29,42,19,-29,-29,-21,-21,-27,-9,17,-21,-1,-22;
MA   /M: SY='G'; M=18,-8,-23,-11,-8,-26,35,-18,-28,-13,-22,-16,-4,-14,-12,-18,4,-12,-19,-21,-25,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=5,-7,-21,-9,-1,-21,-11,-8,-23,14,-21,-12,-1,-14,3,26,5,-1,-13,-24,-15,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-14,-24,-15,-14,18,-21,16,-8,-12,-9,-5,-9,-24,-9,-10,-4,-3,-11,4,43,-14;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-12,-21,-19,-16,6,-22,0,7,-13,12,21,-10,-23,-7,-11,-15,-3,-1,-12,15,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-26,-20,-13,18,-27,-7,-5,0,4,1,-16,-24,-13,-2,-19,-10,-7,-1,23,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-12,17,-28,23,9,-30,-13,-5,-30,12,-29,-20,11,0,2,8,0,-6,-25,-32,-18,4;
MA   /M: SY='E'; M=-9,20,-25,24,25,-28,-13,-3,-28,6,-24,-20,12,-8,7,-2,6,1,-24,-34,-18,16;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-25,-20,-31,-23,9,-27,-17,22,-22,20,23,-21,-23,-16,-19,-16,-6,16,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-30,5,27,-31,-20,-1,-28,26,-23,-11,0,-8,25,20,-4,-10,-26,-23,-13,26;
MA   /M: SY='K'; M=2,-5,-21,-5,5,-22,-15,-11,-18,15,-20,-11,-3,-13,2,11,3,-2,-8,-26,-14,3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-10,-25,-8,-3,-12,-26,-15,3,-6,5,1,-12,-19,-7,-4,-14,-9,2,-25,-8,-6;
MA   /M: SY='A'; M=13,-18,-2,-24,-17,-6,-19,-22,2,-20,12,1,-18,-22,-17,-20,-6,2,7,-25,-12,-17;
MA   /I: I=-5; MD=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,16,-20,24,12,-26,2,-5,-27,-4,-25,-21,10,-9,0,-9,13,0,-20,-31,-19,6; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-21,2,14,-20,-13,-5,-20,14,-19,-12,-1,4,6,12,0,-4,-17,-20,-13,9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-12,-19,-11,-7,3,-17,0,-3,-3,-1,-1,-12,-2,-6,-5,-12,-6,-8,1,19,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-10; MD=-10; IM=-10; DM=-10;
MA   /M: SY='N'; M=-4,15,-18,6,-6,-18,21,-2,-21,-6,-22,-15,26,-15,-6,-6,4,-6,-22,-24,-18,-6; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-19,-21,-24,-18,-4,-28,-21,21,-13,11,9,-15,-17,-13,-14,-12,-1,16,-19,-3,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-15,-32,-9,-2,-25,-6,-15,-21,-5,-25,-16,-13,52,-8,-7,-7,-10,-25,-24,-24,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-22,0,-27,-24,-3,-28,-25,21,-21,6,6,-19,-22,-21,-21,-9,1,25,-25,-8,-24; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='E'; M=9,8,-18,9,10,-24,-9,-7,-19,-2,-15,-13,1,-7,6,-8,5,0,-14,-24,-15,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-18,-13,-22,-22,-1,-24,-20,22,-17,9,7,-14,-24,-20,-16,-10,-2,28,-25,-8,-22; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-26,-22,-32,-26,0,-32,-26,39,-24,15,15,-20,-20,-20,-24,-15,-6,31,-20,-2,-26; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-3,16,-23,21,6,-26,-7,-7,-23,-4,-24,-20,9,10,-3,-11,4,-3,-20,-30,-19,0; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-13,-8,-7,-10,-8,-5,-4,-8,-9,7,4,-13,-1,-8,11,10,-4,-28,-10,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=3,-13,-17,-16,-7,-10,-14,-9,-3,-6,5,6,-10,-16,1,-1,-5,-4,-3,-19,-8,-4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,11,-21,18,-1,-21,-2,-10,-16,-9,-10,-12,0,-15,-9,-13,-4,-8,-9,-27,-15,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-20,-23,-23,-20,33,-25,6,2,-13,5,7,-17,-25,-14,-11,-17,-9,-4,15,49,-18; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='G'; M=4,-6,-24,-6,-6,-25,43,-15,-30,-13,-23,-16,-1,-14,-11,-15,1,-14,-23,-19,-24,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-13,-20,-17,-10,-2,-20,-3,0,1,4,17,-12,-17,-2,5,-12,-3,-2,-12,7,-7; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-21,-17,-27,-20,1,-22,-9,22,-14,19,37,-20,-20,-8,-13,-17,-7,16,-19,-1,-15; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-14,23,-24,25,7,-25,-10,13,-27,8,-24,-16,20,-13,4,8,-2,-8,-24,-29,-10,4; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-11,-25,-11,-17,-21,48,-17,-27,-19,-16,-12,-4,-19,-17,-17,-4,-16,-21,-17,-22,-17; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='D'; M=-9,10,-20,12,5,-17,-15,-8,-13,-1,-9,-10,4,-13,-3,-5,-2,1,-9,-27,-12,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-26,1,11,-26,-6,-9,-27,30,-25,-11,0,-9,6,16,-6,-10,-20,-18,-12,8; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='V'; M=4,-20,-15,-24,-20,-5,-22,-22,22,-18,5,6,-16,-18,-17,-19,-3,-1,24,-23,-8,-20; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-25,-20,-24,-15,4,-25,-17,12,-24,33,12,-25,-11,-16,-17,-24,-9,4,-19,-4,-16; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-10;
MA   /M: SY='K'; M=-7,15,-23,13,11,-26,-12,-5,-26,16,-27,-17,15,-11,4,7,6,3,-21,-31,-15,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-8,-25,-9,6,-25,-20,-3,-11,4,-5,2,-8,-14,27,2,-7,-9,-16,-20,-9,17;
MA   /M: SY='A'; M=32,-12,-17,-20,-14,-20,13,-21,-11,-14,-12,-9,-9,-13,-13,-21,4,-6,-4,-20,-20,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,28,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-24;
MA   /M: SY='A'; M=15,-3,-19,-6,4,-26,0,-11,-21,1,-21,-13,-1,-10,5,-6,10,-2,-14,-25,-18,5;
MA   /M: SY='L'; M=-4,-28,-19,-30,-20,15,-26,-20,14,-28,38,14,-26,-28,-21,-20,-24,-9,8,-16,1,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-26,-19,-31,-24,0,-27,-21,27,-21,20,23,-23,-23,-17,-20,-16,-6,24,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-4,7,-24,11,10,-25,-15,-9,-23,13,-17,-13,1,-12,2,3,-2,-6,-16,-27,-14,6;
MA   /M: SY='N'; M=-1,8,-21,2,8,-23,-13,-6,-20,10,-21,-12,11,-11,8,3,5,6,-18,-28,-15,8;
MA   /M: SY='E'; M=8,-2,-23,-3,13,-25,-13,4,-23,11,-19,-11,-2,-10,6,6,-1,-8,-17,-24,-12,9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,1,-24,1,-3,-18,4,-8,-19,-4,-18,-13,2,-17,-8,-9,-2,-9,-14,-20,-8,-6;
MA   /M: SY='A'; M=8,0,-20,-4,5,-22,-11,-8,-16,6,-15,-9,2,-12,7,-1,3,-3,-14,-25,-15,6;
MA   /M: SY='Q'; M=7,4,-20,0,9,-26,-9,-6,-21,9,-23,-13,7,-10,10,2,10,0,-17,-28,-16,9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=22(22); /POSITIVE=22(22); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=V_Lesaux;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PTS EIIB type-3;
CC   /VERSION=7;
DR   Q9CIF0   , PTCB_LACLA , T; A2RIE6    , PTCB_LACLM , T; 
DR P55901 , PTEB_AERHY , T; O05505 , PTEB_BACSU , T;
DR Q45399 , PTEB_GEOSE , T; P46318 , PTJB_BACSU , T;
DR P24400 , PTLCB_LACCA, T; P23531 , PTLCB_LACLL, T;
DR Q5HE15 , PTLCB_STAAC, T; Q931G6 , PTLCB_STAAM, T;
DR Q99S77 , PTLCB_STAAN, T; Q6GEN9 , PTLCB_STAAR, T;
DR Q6G7C4 , PTLCB_STAAS, T; P11162 , PTLCB_STAAU, T;
DR Q7A092 , PTLCB_STAAW, T; Q5HM40 , PTLCB_STAEQ, T;
DR Q8CNF7 , PTLCB_STAES, T; Q4L869 , PTLCB_STAHJ, T;
DR P50976 , PTLCB_STRMU, T; P69830 , PTQB_ECO57 , T;
DR P69796 , PTQB_ECOL6 , T; P69795 , PTQB_ECOLI , T;
3D 1E2B; 1H9C; 1IIB; 2WWV; 2WY2; PR PRU00423; DO PDOC00795; //