PROSITE entry PS51134
View entry in NiceSite formatView entry in raw text format (no links)
ID ZF_TFIIB; MATRIX. AC PS51134; DT 01-JUN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Zinc finger TFIIB-type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=32; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=29; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6841733; R2=0.0059513; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2026.4241943; R2=1.5353535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1011; H_SCORE=3579; N_SCORE=7.7; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=810; H_SCORE=3270; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-13; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=-3,-22,5,20,6,-1,3,-9,0,-12,-6,5,11,3,-4,6,0,-9,-20,1; MA /M: SY='P'; M=-1,-23,2,7,-20,0,-6,-4,14,-12,-8,-3,21,7,7,3,2,0,-27,-15; MA /M: SY='R'; M=-6,-1,-3,5,-9,-23,10,3,5,6,6,-9,-20,15,20,-8,-7,5,-22,2; MA /M: SY='R'; M=-1,1,-12,-2,-6,-8,-12,4,13,-6,-1,-6,-17,6,13,-2,9,7,9,0; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100; MA /M: SY='P'; M=-11,-33,-13,-3,-26,-15,-13,-19,12,-24,-11,-13,87,-9,-8,-3,-3,-22,-24,-17; MA /M: SY='E'; M=-2,-23,23,27,-19,-10,3,-9,4,-16,-9,25,-14,11,0,-1,-4,-10,-28,-6; MA /M: SY='C'; M=-10,118,-25,-25,-19,-24,25,-27,-22,-17,-15,-12,-37,-27,-27,-11,-10,-16,-49,-22; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='G'; M=-5,-30,7,1,-25,39,-10,-34,-2,-32,-23,-1,24,-4,-4,-3,-13,-30,-28,-23; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='S'; M=2,-6,18,4,-25,10,-3,-22,-2,-25,-18,9,18,1,-10,26,11,-16,-32,-17; MA /M: SY='P'; M=8,-19,5,4,-24,14,-11,-18,4,-21,-14,5,22,2,3,9,15,-11,-29,-18; MA /M: SY='N'; M=-62,-16,55,35,-92,-82,41,5,-30,-48,-82,66,6,11,-48,8,-24,-38,-105,-83; MA /M: SY='I'; M=-12,-19,-32,-26,30,-34,-22,40,-23,31,20,-26,-27,-21,-18,-21,-8,24,-18,2; MA /M: SY='V'; M=-4,-20,-6,4,-5,-30,-24,31,-14,9,7,-17,-20,-12,-16,-11,0,32,-30,-10; MA /M: SY='E'; M=-7,-21,2,22,1,-18,-2,-5,5,-6,-6,-4,-14,2,8,0,10,1,-17,13; MA /M: SY='D'; M=-14,-28,68,23,-34,-12,6,-33,-1,-31,-29,25,-14,0,6,-2,-5,-30,-48,-17; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='Y'; M=-9,-25,-4,1,15,-16,27,-9,-7,-5,-4,-1,10,-5,-4,-3,-3,-12,-2,40; D=-14; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='E'; M=10,-22,6,22,-28,-6,-6,-26,12,-24,-17,2,-13,11,18,13,-2,-18,-28,-18; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='R'; M=9,-21,-6,1,-22,-8,35,-24,15,-21,-10,8,-17,8,35,7,-1,-17,-29,-8; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='G'; M=9,-23,-12,-22,-31,70,-19,-36,-17,-32,-22,3,-17,-14,-24,4,-14,-28,-23,-26; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='D'; M=-12,-28,50,40,-26,-18,-1,-30,-3,-26,-23,10,-11,10,-5,-3,-5,-26,-31,-5; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='M'; M=0,-17,-20,-18,1,-22,0,15,-14,16,19,-10,-20,-12,-11,-4,11,12,-22,5; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='V'; M=-6,-18,-30,-26,13,-33,-27,36,-23,15,11,-24,-25,-24,-25,-6,0,45,-21,-6; MA /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100; MA /M: SY='G'; M=10,-39,-5,6,-23,17,-11,-15,7,-19,-10,2,13,4,0,11,12,-10,-26,-17; MA /M: SY='D'; M=-1,-22,33,21,-27,-4,-3,-21,10,-23,-17,19,-13,7,8,6,0,-14,-33,-17; MA /M: SY='C'; M=-79,157,-99,-99,-89,-94,-99,-96,-94,-86,-87,-85,-109,-102,-101,-81,-79,-83,-119,-100; MA /M: SY='G'; M=8,-34,-4,-21,-31,75,-18,-38,-17,-33,-23,2,-16,-14,-24,3,-15,-31,-22,-25; MA /M: SY='C'; M=-4,31,-22,-18,8,-23,-13,11,-15,25,10,-16,-25,-8,-10,-2,3,9,-17,10; MA /M: SY='V'; M=-1,-15,-31,-26,-1,-33,-34,36,-23,4,11,-36,-26,-25,-25,-15,1,50,-34,-9; MA /M: SY='I'; M=-8,-18,-40,-26,4,-34,-26,34,-24,29,17,-26,-26,-22,-25,-18,-1,32,-26,-5; MA /M: SY='E'; M=1,-25,23,47,-30,20,-6,-30,7,-25,-20,1,-9,12,-4,1,-3,-23,-28,-20; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=78(78); /POSITIVE=78(78); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=9; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=N_Hulo; CC /TAXO-RANGE=A?EPV; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=TFIIB-type; CC /VERSION=5; DR Q29S07 , BRF2_BOVIN , T; A8KBY2 , BRF2_DANRE , T;
DR Q9HAW0 , BRF2_HUMAN , T; Q4R318 , BRF2_MACFA , T;
DR Q3UAW9 , BRF2_MOUSE , T; Q4V8D6 , BRF2_RAT , T;
DR Q66IW8 , BRF2_XENLA , T; A4QNR3 , BRF2_XENTR , T;
DR Q9LIA6 , PBRP2_ARATH, T; P48512 , TF2B1_ARATH, T;
DR Q9HNA2 , TF2B1_HALSA, T; Q9HJM7 , TF2B1_THEAC, T;
DR Q5JGN1 , TF2B1_THEKO, T; Q979Q3 , TF2B1_THEVO, T;
DR Q9SS44 , TF2B2_ARATH, T; Q9HRE6 , TF2B2_HALSA, T;
DR Q9YGA5 , TF2B2_HALVD, T; P58110 , TF2B2_SACS2, T;
DR Q9HJM2 , TF2B2_THEAC, T; P58109 , TF2B2_THEKO, T;
DR Q979P7 , TF2B2_THEVO, T; Q9HHK5 , TF2B3_HALSA, T;
DR Q9HR45 , TF2B4_HALSA, T; Q9HSB3 , TF2B6_HALSA, T;
DR Q9HSF7 , TF2B7_HALSA, T; O28970 , TF2B_ARCFU , T;
DR Q2KIN8 , TF2B_BOVIN , T; O16991 , TF2B_CAEEL , T;
DR A8MCX6 , TF2B_CALMQ , T; Q54FD6 , TF2B_DICDI , T;
DR P29052 , TF2B_DROME , T; Q9NHP7 , TF2B_DROVI , T;
DR Q8SRP3 , TF2B_ENCCU , T; Q00403 , TF2B_HUMAN , T;
DR A8AC96 , TF2B_IGNH4 , T; Q05959 , TF2B_KLULA , T;
DR Q4R3J5 , TF2B_MACFA , T; A6UW60 , TF2B_META3 , T;
DR Q8TT29 , TF2B_METAC , T; A7IAR4 , TF2B_METB6 , T;
DR Q58192 , TF2B_METJA , T; Q8TX21 , TF2B_METKA , T;
DR A4G0F2 , TF2B_METM5 , T; A9A8Q0 , TF2B_METM6 , T;
DR A6VI28 , TF2B_METM7 , T; P0CW15 , TF2B_METMA , T;
DR A3CSQ6 , TF2B_METMJ , T; Q6M176 , TF2B_METMP , T;
DR P0CW14 , TF2B_METMZ , T; B8GJQ9 , TF2B_METPE , T;
DR A5UKA1 , TF2B_METS3 , T; Q2NEL6 , TF2B_METST , T;
DR O26971 , TF2B_METTH , T; Q9P9I7 , TF2B_METTL , T;
DR A0B5T8 , TF2B_METTP , T; P62915 , TF2B_MOUSE , T;
DR Q8W0W3 , TF2B_ORYSJ , T; Q5R886 , TF2B_PONAB , T;
DR Q9V0V5 , TF2B_PYRAB , T; Q8ZWS3 , TF2B_PYRAE , T;
DR A4WMA6 , TF2B_PYRAR , T; P61998 , TF2B_PYRFU , T;
DR O59151 , TF2B_PYRHO , T; A1RV37 , TF2B_PYRIL , T;
DR B1YCX0 , TF2B_PYRNV , T; P61999 , TF2B_PYRWO , T;
DR P62916 , TF2B_RAT , T; O13749 , TF2B_SCHPO , T;
DR P48513 , TF2B_SOYBN , T; P29054 , TF2B_XENLA , T;
DR P29055 , TF2B_YEAST , T; P43072 , TF3B_CANAL , T;
DR Q92994 , TF3B_HUMAN , T; P46070 , TF3B_KLULA , T;
DR Q8CFK2 , TF3B_MOUSE , T; Q9P6R0 , TF3B_SCHPO , T;
DR P29056 , TF3B_YEAST , T; P46221 , YTF2_SACSH , T;
DR Q980W8 , LYSW_SACS2 , N; Q4JAQ0 , LYSW_SULAC , N;
DR Q976J8 , LYSW_SULTO , N; Q5SH22 , LYSW_THET8 , N;
DR O23215 , PBRP1_ARATH, N; O81787 , PTF2_ARATH , N;
DR Q9HHH8 , TF2B5_HALSA, N; Q5UPT1 , TF2B_MIMIV , N;
DR Q257B3 , TF2B_TRYBB , N;
3D 1DL6; 1PFT; 1RLY; 1RO4; 3K1F; 3K7A; 3VPB; 3WWL; 4BBR; 4BBS; 4V1N; 4V1O; 3D 5FMF; 5FYW; 5FZ5; 5IY6; 5IY7; 5IY8; 5IY9; 5IYA; 5IYB; 5IYC; 5IYD; 5OQJ; 3D 5OQM; 5SVA; 6CNB; 6CNC; 6CND; 6CNF; 6EU0; 6F40; 6F41; 6F42; 6F44; 6GYK; 3D 6GYL; 6GYM; 6O9L; 7EDX; 7EG7; 7EG8; 7EG9; 7EGA; 7EGB; 7EGC; 7ENA; 7ENC; 3D 7LBM; 7ML0; 7ML1; 7ML2; 7ML4; 7NVR; 7NVS; 7NVT; 7NVU; 7NVY; 7NVZ; 7NW0; 3D 7O4I; 7O4J; 7O72; 7O73; 7O75; 7Q5B; 7UI9; 7UIF; 7UIO; 7ZS9; 7ZSA; 7ZSB; 3D 7ZWC; 7ZWD; 7ZX7; 7ZX8; 7ZXE; 8BVW; 8BYQ; 8BZ1; 8CEN; 8CEO; 8FFZ; 8GXQ; 3D 8GXS; 8ITY; 8IUE; 8IUH; 8WAK; 8WAL; 8WAN; 8WAO; 8WAP; 8WAQ; 8WAR; 8WAS; PR PRU00469; DO PDOC51134; //