PROSITE logo

PROSITE entry PS51178

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   PASTA; MATRIX.
AC   PS51178;
DT   01-DEC-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   PASTA domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1051230; R2=0.0064917; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=986; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=631; N_SCORE=6.2; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-30; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-77,18,-15,-89,52,-57,-42,40,-82,-72,27,-76,21,-1,-13,31,-71,-94,-83;
MA   /M: SY='P'; M=12,-67,-51,23,-81,-69,-61,-9,27,-64,-60,15,61,-7,-51,13,20,18,-94,-79;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='P'; M=8,-72,7,39,-90,-66,-53,-76,-21,-80,-69,10,46,42,2,36,15,-39,-96,-82; D=-21;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='K'; M=-61,-84,-26,-23,-81,-2,-61,-30,42,-80,-72,3,11,25,-16,11,6,-14,-90,3; D=-21;
MA   /I: I=-21; MI=-53; MD=-53; IM=-53; DM=-53;
MA   /M: SY='V'; M=-14,-66,-24,-75,14,1,-71,26,-12,-9,-47,-69,-88,-72,-29,10,-1,40,-72,21; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-70,-24,32,6,-32,-57,0,20,-9,-52,-57,7,33,-26,-23,21,-13,-78,-9; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='M'; M=-58,-57,-92,-35,-53,-33,-86,47,-82,-8,87,-88,-93,-70,-83,-74,-53,69,-75,-69; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='P'; M=-30,-83,-66,-26,-100,-15,-71,-90,-25,-86,-84,-66,115,-9,-67,-7,-16,-79,-105,-97; D=-21;
MA   /I: I=-21; DM=-53;
MA   /M: SY='D'; M=-32,-81,84,3,-31,-60,5,-91,-16,-91,-84,65,-76,-45,-16,34,-48,-85,-106,-74;
MA   /M: SY='Y'; M=-63,7,-98,-92,41,-101,-59,4,-87,31,24,-90,-97,-81,-86,-77,-59,61,-46,67;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-63,-70,-18,-59,-80,-61,34,23,-25,-44,-62,-79,-9,35,4,11,47,-77,9;
MA   /M: SY='G'; M=-50,-86,41,-58,-97,87,-65,-103,-64,-99,-91,23,-21,-9,-29,-21,-26,-92,-97,-96;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='W'; M=-64,-71,-73,-21,-54,-86,-61,3,24,37,67,-64,-84,41,27,-8,-58,-44,81,-57;
MA   /M: SY='T'; M=-42,-63,13,1,-34,-62,-56,-71,20,-76,-68,24,19,-46,-51,61,63,-63,-96,-73;
MA   /M: SY='C'; M=-3,30,-78,-72,8,3,-68,-1,22,25,28,-69,12,-63,-61,2,-55,21,14,13;
MA   /M: SY='D'; M=26,-75,64,37,-90,-4,-58,-77,-19,-82,-75,-40,-11,-42,33,8,12,-41,-99,-84;
MA   /M: SY='E'; M=-20,-80,58,65,-19,-72,-49,-67,-20,-75,-65,-40,-72,61,-50,-15,12,-4,-89,-74;
MA   /M: SY='A'; M=78,-49,-77,-66,-62,-54,-72,-12,-65,-1,-46,-73,-66,-65,-73,-35,-11,37,-80,-13;
MA   /M: SY='R'; M=10,-10,-56,34,-70,-76,-55,5,32,5,40,-58,-75,37,45,-54,-56,-11,-84,-74;
MA   /M: SY='Q'; M=32,-72,5,38,-79,-23,-48,-76,32,-49,-64,15,-25,50,4,-3,-3,-67,-85,-12;
MA   /M: SY='W'; M=1,-71,1,23,6,-74,-57,20,6,0,-49,22,-10,22,23,-50,20,-27,23,-60;
MA   /M: SY='L'; M=19,-59,-92,-85,-44,-36,-83,-5,-80,74,13,-85,-21,-74,-81,-28,-58,11,-77,-66;
MA   /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
MA   /M: SY='K'; M=-56,-86,4,26,-93,-26,-47,-85,71,-83,-68,-14,-71,47,44,-1,-1,-78,-92,-79;
MA   /M: SY='W'; M=22,-71,34,10,-77,-8,-58,-6,18,-38,-61,5,-16,13,20,5,-7,-15,49,-71;
MA   /M: SY='L'; M=23,-64,-62,-20,-15,-33,0,-19,26,39,-39,12,-76,-9,-23,22,-50,-20,-74,11;
MA   /M: SY='G'; M=-22,-83,19,-63,-88,84,-68,-27,16,-27,-75,15,-85,-62,-18,-52,-65,-76,-94,-91;
MA   /M: SY='F'; M=-70,-64,-31,-92,66,-102,-76,43,-91,42,7,-90,-99,-83,-89,-82,-63,32,53,9;
MA   /I: I=-13; MD=-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-58,-80,21,41,-37,-36,-52,-62,35,-25,-59,-6,7,53,4,-21,17,-3,-90,-76; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-33;
MA   /M: SY='V'; M=-34,-10,-3,11,-57,-46,-64,9,-35,19,-43,5,37,-5,-27,-61,-4,41,-77,15; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-33;
MA   /M: SY='E'; M=6,-69,-2,38,-6,11,-63,21,-4,-56,-11,7,-78,-48,-4,-3,15,13,-88,-69; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-82,-92,-4,-13,-26,-54,-79,7,-77,-70,4,-78,-106,29,-22,-42,4,0,-96,-14; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='W'; M=-9,-91,-2,9,-99,-41,-6,-84,0,-56,-82,-69,1,4,-71,-22,18,-32,21,-89; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-40,-86,1,-5,-91,-29,-68,-80,-15,-91,-81,-2,-91,31,-69,30,9,-14,-101,-15; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-84,-16,5,-96,-10,-79,-33,-36,-48,-74,-72,-23,18,-28,-5,-20,8,-107,-97; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='P'; M=-23,-90,-31,25,3,-96,-71,-37,-75,-81,-78,-76,33,7,-81,-65,29,-26,-86,14; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='S'; M=-17,1,8,-36,-22,-9,-76,-80,-76,-90,-85,26,-23,-9,-82,28,-5,-16,-109,-88; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='S'; M=-36,-88,21,13,-107,-18,-72,-101,-31,-103,-94,24,12,-62,-75,40,0,-91,-119,-100; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='F'; M=-24,-68,1,-5,37,0,-65,-7,-15,-28,-56,-13,29,-13,-16,20,29,14,-80,-54; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-18,-68,-16,-1,-67,6,3,16,5,-16,-52,7,-78,39,-25,27,8,14,-83,-9; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-33;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-79,18,8,-90,59,-4,-85,0,-49,-76,-49,57,5,-60,-6,0,-76,-96,-85;
MA   /M: SY='E'; M=9,-69,29,41,-26,-24,-9,-25,8,-42,-62,-14,19,-44,-56,22,26,-1,-88,-23;
MA   /M: SY='G'; M=-47,-85,-22,-10,-96,94,-69,-93,-24,-96,-89,19,-87,-66,-71,-24,-65,-34,-94,-96;
MA   /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
MA   /M: SY='K'; M=-33,-70,-23,-13,-16,-77,-4,-45,49,-28,5,-13,-77,-44,34,-48,48,23,-71,29;
MA   /M: SY='V'; M=-23,33,-96,-88,-56,-98,-96,56,-87,-27,-31,-93,-90,-84,-88,-71,-49,86,-81,-70;
MA   /M: SY='I'; M=-60,5,-16,-67,-11,-91,-64,53,-4,9,6,-11,-88,19,-66,-34,-4,45,-68,28;
MA   /M: SY='K'; M=20,-74,1,38,-84,24,-54,-75,48,-80,-71,-9,-70,-7,3,29,-48,-28,-89,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-52,-68,-54,-30,-78,-74,-41,-20,-36,-61,-1,-44,-72,104,-6,-1,57,-12,-80,-74;
MA   /M: SY='S'; M=-21,-70,40,35,-57,-63,-45,-25,-54,-75,-69,51,-75,-46,-61,52,11,-33,-71,48;
MA   /M: SY='P'; M=-28,-76,-75,-69,-85,-85,-79,-24,-70,-21,-65,-77,117,-70,-76,-61,-26,14,-100,-92;
MA   /I: I=-15; MD=-39;
MA   /M: SY='P'; M=20,-82,0,15,-92,-14,-58,-82,20,-39,-70,-15,52,37,31,-51,-25,-74,-98,-87; D=-15;
MA   /I: I=-15; MD=-39;
MA   /M: SY='P'; M=42,-71,-52,37,-92,-11,-64,-76,-4,-81,-74,-18,54,-9,-60,18,-14,-34,-99,-87; D=-15;
MA   /I: I=-15; MD=-39;
MA   /M: SY='G'; M=-48,-82,-56,-75,-84,89,-66,-100,-70,-97,-89,35,-88,-71,-76,2,-4,-89,23,-14; D=-15;
MA   /I: I=-15; MD=-39;
MA   /M: SY='T'; M=-8,-65,-18,15,-79,-4,-5,-65,7,-40,-7,-11,-72,38,-51,18,72,-58,-91,-75; D=-15;
MA   /I: I=-15; MD=-39;
MA   /M: SY='N'; M=8,-70,-16,-5,-84,-18,-57,-31,12,-45,-64,35,-19,30,0,27,35,-27,-96,-80; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
MA   /M: SY='V'; M=-37,-67,-98,-91,-67,-102,-96,23,-86,6,7,-89,-97,-84,-37,-34,20,60,-92,-81; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-39; IM=0; DM=-39;
MA   /M: SY='P'; M=-31,-71,24,-26,-72,-76,-64,28,36,6,-49,-20,40,16,-19,23,-20,-18,-93,-77; D=-15;
MA   /I: I=-15; DM=-39;
MA   /M: SY='P'; M=10,-75,0,20,-21,-30,-59,-7,35,-44,-64,-8,55,-46,13,-8,-20,-16,-86,-6; D=-15;
MA   /I: I=-15; DM=-39;
MA   /M: SY='G'; M=0,-73,12,17,-85,61,-65,-16,-62,-39,-70,24,27,-57,-69,2,24,-64,-96,-86;
MA   /M: SY='T'; M=-47,-71,38,-1,-86,29,-55,-73,-6,-81,-72,39,-74,-9,9,42,44,-28,-97,-81;
MA   /M: SY='K'; M=-55,-75,-56,10,-82,-77,-55,7,60,-63,-57,-50,37,41,21,-23,34,-1,-91,-77;
MA   /M: SY='I'; M=-60,-56,-92,-80,-50,-102,-86,68,-80,31,-24,-87,-92,13,-80,-73,-15,62,-80,-67;
MA   /M: SY='T'; M=-56,-65,0,10,4,-78,-62,25,-3,-50,-49,27,-80,-3,3,-20,51,37,26,-60;
MA   /M: SY='L'; M=-67,-60,-102,-95,11,-105,-89,30,-90,73,-15,-96,-94,-82,-87,-82,-61,42,-72,-56;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='T'; M=-61,-69,-63,17,7,-86,-57,17,9,11,3,-23,-83,16,0,-26,36,12,-69,27; D=-30;
MA   /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='V'; M=-59,-57,-93,-87,4,-99,-80,41,-84,40,-26,-85,-91,-80,-85,-68,21,65,-69,8;
MA   /I: I=-30; MD=-77;
MA   /M: SY='S'; M=16,-63,-12,-3,-72,37,-60,-22,-25,-72,-68,-11,-73,-55,-64,66,-39,1,-84,3; D=-30;
MA   /I: I=-30; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-74,45,8,-87,0,-58,-27,36,-77,-70,24,35,-15,-48,16,38,-33,-99,-82;
MA   /I: I=-30; E1=0; MI=-77; IE=-77; DE=-77;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=96(30); /POSITIVE=95(29); /UNKNOWN=1(1); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=A??P?; /MAX-REPEAT=4;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PASTA;
CC   /VERSION=3;
DR   Q07868   , PBP2B_BACSU, T; P14677    , PBPX_STRPN , T; 
DR P59676 , PBPX_STRR6 , T; Q9KIG4 , PK1_STRTO , T;
DR Q8R9T6 , PKN1_CALS4 , T; Q8FUI5 , PKN1_COREF , T;
DR Q8NU98 , PKN1_CORGL , T; Q97IC2 , PKN2_CLOAB , T;
DR Q8XJL8 , PKN2_CLOPE , T; Q8G4G1 , PKNA2_BIFLO, T;
DR Q8G6P9 , PKNB_BIFLO , T; Q9CEF5 , PKNB_LACLA , T;
DR P0A5S5 , PKNB_MYCBO , T; P54744 , PKNB_MYCLE , T;
DR A0QNG1 , PKNB_MYCS2 , T; A5TY84 , PKNB_MYCTA , T;
DR P9WI80 , PKNB_MYCTO , T; P9WI81 , PKNB_MYCTU , T;
DR Q9XA16 , PKNX_STRCO , T; Q9S2C0 , PKSC_STRCO , T;
DR Q81WH6 , PRKC_BACAN , T; O34507 , PRKC_BACSU , T;
DR A6QGC0 , PRKC_STAAE , T; Q03524 , SP5D_BACSU , T;
DR Q8KY50 , STKP_STREE , T; Q04J43 , STKP_STRP2 , T;
DR Q97PA9 , STKP_STRPN , T; Q8DNS0 , STKP_STRR6 , T;
DR O51090 , Y063_BORBU , T;
DR Q8TX79 , Y796_METKA , ?;
3D 1PMD; 1PYY; 1QME; 1QMF; 1RP5; 2KUD; 2KUE; 2KUF; 2KUI; 2Z2L; 2Z2M; 2ZC3; 3D 2ZC4; 3OUV; 5E0Y; 5E0Z; 5E10; 5E12; 5NOD; 5OAU; 5OIZ; 5OJ0; 5OJ1; PR PRU00528; DO PDOC51178; //