PROSITE logo

PROSITE entry PS51183

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   JMJN; MATRIX.
AC   PS51183;
DT   01-FEB-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   JmjN domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=42;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=38;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0609195; R2=0.0138589; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2398.1782227; R2=1.2883356; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=465; H_SCORE=2997; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; H_SCORE=2812; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-21,-8,-30,-25,-6,-30,-25,26,-24,7,8,-13,-22,-20,-25,-12,-7,20,-26,-9,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-21,-34,-14,-4,-22,-22,-19,-10,-13,-14,-10,-21,56,-9,-18,-12,-9,-17,-28,-23,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-17,-15,-20,-14,-7,-24,-20,9,-10,1,5,-16,-20,-14,-8,-3,7,20,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-37,-29,46,-32,-23,15,-28,16,7,-23,-28,-33,-22,-19,-8,14,-5,15,-29;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-4,-26,-7,1,-9,-22,-3,-10,5,-9,-6,0,-18,0,8,-8,-3,-12,-16,5,-2;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-20,-34,-14,-4,-21,-22,-20,-12,-14,-14,-12,-20,61,-12,-19,-11,-5,-21,-28,-23,-12;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-15,-7,-4,-17,-15,-7,-17,0,-18,-11,2,-11,-3,-4,15,25,-7,-29,-10,-4;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-13,-30,-14,-2,-12,-14,-10,-10,1,-10,4,-13,-11,-2,-5,-14,-13,-12,1,-1,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-5,1,-27,3,24,-27,-17,-3,-23,17,-20,-8,-1,-8,18,11,-1,-7,-21,-25,-14,20;
MA   /M: SY='E'; M=-11,13,-30,23,54,-31,-19,1,-30,9,-21,-19,2,-1,21,0,0,-10,-30,-30,-19,38;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-29,-20,-38,-28,67,-29,-18,4,-28,15,7,-21,-29,-35,-19,-21,-10,2,5,25,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-1,-1,-23,0,4,-24,-16,-6,-19,5,-20,-11,-2,-2,2,1,3,2,-12,-28,-14,2;
MA   /M: SY='D'; M=-17,42,-27,49,13,-33,-8,3,-34,3,-29,-26,29,-14,1,0,2,-7,-29,-38,-19,6;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-21,-31,-19,-11,1,-15,-18,-13,-16,-15,-8,-17,37,-18,-19,-11,-8,-18,-18,-12,-16;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-25,-23,-11,-2,-27,-13,14,-18,17,15,-19,-15,-7,-16,-16,-8,4,-19,0,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-4,1,-24,3,2,-21,-3,-8,-19,-1,-17,-12,0,-14,0,-6,2,-5,-16,-24,-10,0;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-29,-25,53,-30,2,0,-19,5,0,-20,-30,-24,-15,-20,-10,-5,21,57,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-28,-19,-37,-28,9,-37,-24,34,-28,16,14,-21,-24,-21,-27,-20,-10,20,-15,8,-28;
MA   /M: SY='E'; M=-4,6,-25,12,30,-27,-14,-5,-27,11,-23,-18,3,-6,11,5,6,-3,-22,-30,-18,20;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-9,-24,-9,1,-17,-19,-5,-14,9,-9,-4,-5,-16,1,10,-5,-5,-10,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-26,-24,-30,-22,5,-34,-19,29,-22,16,12,-22,-24,-18,-21,-18,-8,22,-14,10,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,10,-24,9,15,-24,-14,-3,-25,10,-22,-16,11,-12,6,15,4,1,-21,-29,-16,9;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,1,-29,5,7,-26,-17,-1,-23,10,-23,-12,-1,-1,15,9,-2,-7,-23,-22,-8,10;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-14,-24,-19,-12,-2,-20,-10,2,-9,6,7,-10,-21,-5,-6,-12,-5,-3,-17,1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=20,-11,-21,-15,-17,-25,37,-21,-25,-16,-20,-15,-5,-17,-17,-20,3,-11,-14,-21,-25,-17;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-7,-24,-7,7,-18,-14,-4,-13,2,-10,-3,-6,-14,1,1,-4,-7,-10,-25,-12,3;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-4,-27,-3,7,-25,-19,-11,-23,31,-24,-10,-3,-8,5,22,-5,-7,-14,-24,-12,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-11,-22,-14,-14,13,-18,6,-7,-11,-9,-7,-7,-23,-9,-11,-1,-2,-9,3,37,-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=5,-23,-7,-31,-23,-6,-25,-22,20,-21,10,14,-19,-21,-16,-23,-12,-7,16,-24,-8,-21;
MA   /M: SY='C'; M=1,-24,33,-30,-27,-9,-27,-28,5,-24,1,-1,-23,-30,-26,-24,-10,-5,18,-34,-17,-27;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-23,-4,6,-27,-20,-9,-30,42,-27,-10,-1,-14,8,36,-10,-10,-20,-21,-11,6;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-18,-34,-29,1,-34,-29,36,-25,18,15,-26,-26,-25,-24,-16,-5,39,-25,-5,-29;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-22,-31,-24,-4,-33,-26,30,-15,9,11,-21,-23,-19,-14,-15,-6,30,-24,-5,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-20,-36,-14,-4,-26,-21,-19,-13,-9,-23,-15,-18,65,-9,-14,-10,-9,-22,-28,-25,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13,-3,-27,-22,-21,-13,-12,-25,-16,-20,80,-11,-21,-11,-10,-24,-29,-27,-12;
MA   /M: SY='P'; M=0,-2,-25,2,6,-25,-13,-13,-18,-3,-23,-17,-3,21,-4,-11,3,-3,-16,-31,-22,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-3,11,-23,14,9,-20,4,-8,-27,-7,-23,-20,9,-12,-4,-11,7,-5,-21,-29,-18,3;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-34,-37,-37,-28,20,-21,-27,-11,-21,-11,-13,-32,-28,-24,-20,-29,-21,-15,92,22,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-16,0,1,-22,-18,-9,-21,13,-15,-9,0,-16,3,12,-4,-3,-15,-27,-12,1;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-21,-7,2,-27,-19,-15,-21,0,-26,-15,-9,43,-5,-10,-8,-9,-25,-30,-24,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-14,-33,-9,5,-17,-22,-12,-19,0,-18,-12,-13,33,-1,-1,-10,-10,-23,-23,-16,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /PROMOTED_BY: PS51184;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=56(56); /POSITIVE=56(56); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=JmjN;
CC   /VERSION=5;
DR   Q03214   , ECM5_YEAST , T; Q6BDA0    , ELF6_ARATH , T; 
DR Q03833 , GIS1_YEAST , T; Q5F363 , JARD2_CHICK, T;
DR Q1LVC2 , JARD2_DANRE, T; Q92833 , JARD2_HUMAN, T;
DR Q62315 , JARD2_MOUSE, T; P47156 , JHD2_YEAST , T;
DR Q53WJ1 , JM703_ORYSJ, T; Q5N712 , JM705_ORYSJ, T;
DR Q336N8 , JM706_ORYSJ, T; F4KIX0 , JMJ13_ARATH, T;
DR Q8GUI6 , JMJ14_ARATH, T; O64752 , JMJ15_ARATH, T;
DR C0SUT9 , JMJ16_ARATH, T; F4I6G4 , JMJ18_ARATH, T;
DR Q8L7T6 , JMJ19_ARATH, T; Q9US53 , JMJ2_SCHPO , T;
DR O94691 , JMJ3_SCHPO , T; Q6IQX0 , KD5BB_DANRE, T;
DR Q9V333 , KDM4A_DROME, T; O75164 , KDM4A_HUMAN, T;
DR Q8BW72 , KDM4A_MOUSE, T; Q5RD88 , KDM4A_PONAB, T;
DR Q9V6L0 , KDM4B_DROME, T; O94953 , KDM4B_HUMAN, T;
DR Q91VY5 , KDM4B_MOUSE, T; Q9H3R0 , KDM4C_HUMAN, T;
DR Q8VCD7 , KDM4C_MOUSE, T; Q6B0I6 , KDM4D_HUMAN, T;
DR Q3U2K5 , KDM4D_MOUSE, T; A1A5Q5 , KDM4D_RAT , T;
DR B2RXH2 , KDM4E_HUMAN, T; A0A1W2PPD8, KDM4F_HUMAN, T;
DR Q9U297 , KDM4_CAEEL , T; P29375 , KDM5A_HUMAN, T;
DR Q3UXZ9 , KDM5A_MOUSE, T; Q5F3R2 , KDM5B_CHICK, T;
DR Q9UGL1 , KDM5B_HUMAN, T; Q80Y84 , KDM5B_MOUSE, T;
DR Q38JA7 , KDM5C_CANLF, T; P41229 , KDM5C_HUMAN, T;
DR P41230 , KDM5C_MOUSE, T; A1YVX4 , KDM5C_PIG , T;
DR Q30DN6 , KDM5D_CANLF, T; Q9BY66 , KDM5D_HUMAN, T;
DR Q62240 , KDM5D_MOUSE, T; Q5XUN4 , KDM5D_PANTR, T;
DR Q61T02 , KDM5_CAEBR , T; Q23541 , KDM5_CAEEL , T;
DR Q9VMJ7 , KDM5_DROME , T; Q9HDV4 , LID2_SCHPO , T;
DR Q9UT79 , MSC1_SCHPO , T; Q9STM3 , REF6_ARATH , T;
DR P39956 , RPH1_YEAST , T; Q10RP4 , SE14_ORYSJ , T;
3D 2GP3; 2GP5; 2OQ6; 2OQ7; 2OS2; 2OT7; 2OX0; 2P5B; 2PXJ; 2Q8C; 2Q8D; 2Q8E; 3D 2VD7; 2W2I; 2WWJ; 2XML; 2YBK; 2YBP; 2YBS; 3DXT; 3DXU; 3NJY; 3OPT; 3OPW; 3D 3PDQ; 3RVH; 3U4S; 4AI9; 4BIS; 4D6Q; 4D6R; 4D6S; 4GD4; 4HON; 4HOO; 4IGO; 3D 4IGP; 4IGQ; 4LXL; 4URA; 4V2V; 4V2W; 4XDO; 4XDP; 5A1F; 5A3N; 5A3P; 5A3T; 3D 5A3W; 5A7N; 5A7O; 5A7P; 5A7Q; 5A7S; 5A7W; 5A80; 5ANQ; 5CEH; 5E6H; 5F2S; 3D 5F2W; 5F32; 5F37; 5F39; 5F3C; 5F3E; 5F3G; 5F3I; 5F5A; 5F5C; 5F5I; 5FJH; 3D 5FJK; 5FP4; 5FP7; 5FP8; 5FP9; 5FPA; 5FPB; 5FPL; 5FPU; 5FPV; 5FUN; 5FUP; 3D 5FV3; 5FWE; 5FWJ; 5FY4; 5FY5; 5FY8; 5FY9; 5FYB; 5FYC; 5FYH; 5FYI; 5FYS; 3D 5FYT; 5FYU; 5FYV; 5FYY; 5FYZ; 5FZ0; 5FZ1; 5FZ3; 5FZ4; 5FZ6; 5FZ7; 5FZ8; 3D 5FZ9; 5FZA; 5FZB; 5FZC; 5FZD; 5FZE; 5FZF; 5FZG; 5FZH; 5FZI; 5FZK; 5FZL; 3D 5FZM; 5ISL; 5IVB; 5IVC; 5IVE; 5IVF; 5IVJ; 5IVV; 5IVY; 5IW0; 5IWF; 5K4L; 3D 5KR7; 5LW9; 5LWB; 5LY1; 5LY2; 5PH0; 5PH1; 5PH2; 5PH3; 5PH4; 5PH5; 5PH6; 3D 5PH7; 5PH8; 5PH9; 5PHA; 5PHB; 5PHC; 5PHD; 5PHE; 5PHF; 5PHG; 5PHH; 5PHI; 3D 5PHJ; 5PHK; 5PHL; 5PHM; 5PHN; 5PHO; 5PHP; 5PHQ; 5PHR; 5PHS; 5PHT; 5PHU; 3D 5PHV; 5PHW; 5PHX; 5PHY; 5PHZ; 5PI0; 5PI1; 5PI2; 5PI3; 5PI4; 5PI5; 5PI6; 3D 5PI7; 5PI8; 5PI9; 5PIA; 5PIB; 5PIC; 5PID; 5PIE; 5PIF; 5PIG; 5PIH; 5PII; 3D 5PIJ; 5PIK; 5PIL; 5PIM; 5PIN; 5PIO; 5PIP; 5PIQ; 5PIR; 5PIS; 5PIT; 5PIU; 3D 5PIV; 5PIW; 5PIX; 5PIY; 5PIZ; 5PJ0; 5PJ1; 5PJ2; 5PJ3; 5PJ4; 5PJ5; 5PJ6; 3D 5PJ7; 5PJ8; 5PJ9; 5PJA; 5PJB; 5PJC; 5PJD; 5PJE; 5PJF; 5PJG; 5PJH; 5PJI; 3D 5PJJ; 5PJK; 5PJL; 5PJM; 5PJN; 5PJO; 5PJP; 5PJQ; 5PJR; 5PJS; 5PJT; 5PJU; 3D 5PJV; 5PJW; 5PJX; 5PJY; 5PJZ; 5PK0; 5PK1; 5PK2; 5PK3; 5PK4; 5PK5; 5PK6; 3D 5PK7; 5PK8; 5PK9; 5PKA; 5PKB; 5PKC; 5PKD; 5PKE; 5PKF; 5PKG; 5PKH; 5PKI; 3D 5PKJ; 5PKK; 5PKL; 5PKM; 5PKN; 5PKO; 5PKP; 5PKQ; 5PKR; 5PKS; 5PKT; 5PKU; 3D 5PKV; 5PKW; 5PKX; 5PKY; 5PKZ; 5PL0; 5PL1; 5PL2; 5PL3; 5PL4; 5PL5; 5PL6; 3D 5PL7; 5PL8; 5PL9; 5PLA; 5PLB; 5PLC; 5PLD; 5PLE; 5PLF; 5PLG; 5PLH; 5PLI; 3D 5PLJ; 5PLK; 5PLL; 5PLM; 5PLN; 5PLO; 5PLP; 5PLQ; 5PLR; 5PLS; 5PLT; 5PLU; 3D 5PLV; 5PLW; 5PLX; 5PLY; 5PLZ; 5PM0; 5PM1; 5PM2; 5PM3; 5PM4; 5PM5; 5PM6; 3D 5PM7; 5PM8; 5PM9; 5PMA; 5PMB; 5PMC; 5PMD; 5PME; 5PMF; 5PMG; 5PMH; 5PMI; 3D 5PMJ; 5PMK; 5PML; 5PMM; 5PMN; 5PMO; 5PMP; 5PMQ; 5PMR; 5PMS; 5PMT; 5PMU; 3D 5PMV; 5PMW; 5PMX; 5PMY; 5PMZ; 5PN0; 5PN1; 5PN2; 5PN3; 5PN4; 5PN5; 5PN6; 3D 5PN7; 5PN8; 5PN9; 5PNA; 5PNB; 5PNC; 5PND; 5PNE; 5PNF; 5PNG; 5PNH; 5PNI; 3D 5PNJ; 5PNK; 5PNL; 5PNM; 5PNN; 5PNO; 5PNP; 5PNQ; 5PNR; 5PNS; 5PNU; 5PNV; 3D 5PNW; 5TVR; 5TVS; 5V9P; 5V9T; 5VGI; 5VMP; 5YKN; 5YKO; 6BGU; 6BGV; 6BGW; 3D 6BGX; 6BGY; 6BGZ; 6BH0; 6BH1; 6BH2; 6BH3; 6BH4; 6BH5; 6CG1; 6CG2; 6DQ4; 3D 6DQ5; 6DQ6; 6DQ7; 6DQ8; 6DQ9; 6DQA; 6DQB; 6DQC; 6DQD; 6DQE; 6DQF; 6EIN; 3D 6EIU; 6EIY; 6EJ0; 6EJ1; 6EK6; 6ETE; 6ETG; 6ETS; 6ETT; 6ETU; 6ETV; 6ETW; 3D 6F5Q; 6F5R; 6F5S; 6F5T; 6G5W; 6G5X; 6H0W; 6H0X; 6H0Y; 6H0Z; 6H10; 6H11; 3D 6H4O; 6H4P; 6H4Q; 6H4R; 6H4S; 6H4T; 6H4U; 6H4V; 6H4W; 6H4X; 6H4Y; 6H4Z; 3D 6H50; 6H51; 6H52; 6H8P; 6HGT; 6IP0; 6IP4; 6RBI; 7DYG; 7DYQ; 7EQV; 7JM5; 3D 7KSO; 8WD3; 8WUG; PR PRU00537; DO PDOC51183; //