PROSITE logo

PROSITE entry PS51265

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   ZF_DBF4; MATRIX.
AC   PS51265;
DT   01-NOV-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger DBF4-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8617007; R2=0.0085572; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6242.0429688; R2=2.0071943; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=987; H_SCORE=8223; N_SCORE=10.3; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=543; H_SCORE=7332; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-16; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-45,-27,9,-43,-1,-26,-17,27,-23,23,-23,0,50,35,11,-16,-22,-44,-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-17,-47,43,31,-46,-39,23,-36,20,-37,-4,-19,-35,50,28,-25,-28,2,-50,-32;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-46,-28,5,-40,-40,5,-36,45,2,-27,-25,45,23,27,-25,15,-35,-45,-33;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-45,-25,-15,-46,-19,-25,-46,64,-44,-33,5,-35,21,53,-4,-4,-41,-44,-34;
MA   /M: SY='P'; M=1,15,-26,3,-49,8,5,-45,29,-46,-36,-22,52,31,-21,32,-22,-41,-47,-38;
MA   /M: SY='G'; M=0,-45,-32,-38,-52,85,-37,-56,-34,-52,-41,-19,-37,18,-41,-17,-35,-50,-42,-44;
MA   /M: SY='Y'; M=-39,-50,-42,-43,26,-47,-11,-22,-36,-21,-19,-42,-52,-32,-33,-36,-34,-3,57,109;
MA   /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-46,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-35,-70,-51;
MA   /M: SY='E'; M=-27,40,-3,88,-50,-42,-24,-52,-13,-45,-41,-25,-27,-6,-23,3,-27,-44,-50,-42;
MA   /M: SY='N'; M=-31,75,-21,-36,-30,-32,-24,28,-29,-30,-26,77,-46,-30,-35,-23,-21,-3,-50,15;
MA   /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-46,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-35,-70,-51;
MA   /M: SY='R'; M=-33,7,-27,2,-37,-42,-22,-42,44,-12,-28,3,-40,33,65,-27,-30,-40,-40,10;
MA   /M: SY='V'; M=-27,-42,23,33,-32,-46,-35,28,-12,-4,-19,-30,-38,24,-31,-29,-2,43,-51,-32;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-46,-18,39,-48,-39,-25,-47,70,-44,-35,-19,-31,23,25,-23,-3,-41,-43,-35;
MA   /M: SY='Y'; M=-42,-45,-47,-47,82,-49,-18,-21,-40,-15,-19,-43,-53,-42,-37,-39,-35,-26,-2,90;
MA   /M: SY='D'; M=-18,-44,66,48,-50,-33,-22,-48,-4,-47,-42,31,-32,-15,-11,6,13,-43,-58,-39;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-42,67,1,-38,-32,5,-2,-25,-37,-35,42,-37,-23,-32,16,0,0,-55,5;
MA   /M: SY='F'; M=-39,-40,-52,-47,65,-53,-31,-8,-45,55,-6,-48,-53,-43,-42,-43,-33,-15,-20,44;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-45,37,62,-39,-36,16,-46,16,-43,-37,1,-31,-12,-20,2,-9,-41,-44,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-44,24,47,-43,-38,-26,-1,-18,-22,-28,2,-34,50,-6,-1,-5,6,-49,-35;
MA   /M: SY='H'; M=-38,-50,-22,-22,-36,-40,132,-55,-27,-37,-22,-11,-39,-16,-21,-27,-37,-54,-72,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-32,-41,-54,-49,-15,-56,-47,63,-47,45,-2,-48,-47,-43,-47,-42,-27,34,-43,-25;
MA   /M: SY='M'; M=-5,-41,-29,20,11,-18,-29,-19,9,7,25,5,-39,19,1,0,-25,20,-40,-1;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-35,-3,23,-44,7,-29,-42,-24,-44,-38,-15,-31,-18,-30,69,29,-34,-51,-37;
MA   /M: SY='R'; M=6,-45,18,42,-2,-37,-24,-46,31,-42,-36,7,-6,-13,48,-13,-27,-40,-45,-32;
MA   /M: SY='K'; M=-31,-47,11,19,-43,-40,34,-41,49,-8,-28,-19,-35,45,34,-24,0,-39,-46,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-38,-50,-22,-22,-36,-40,132,-55,-27,-37,-22,-11,-39,-16,-21,-27,-37,-54,-72,-5;
MA   /M: SY='R'; M=-33,-49,-30,7,-5,-44,-24,-16,19,-19,-29,-26,-41,4,84,-10,-31,-36,-42,-28;
MA   /M: SY='R'; M=3,-41,-23,3,-42,-30,-24,-40,31,-14,-31,29,-36,25,41,35,-20,-37,-47,-34;
MA   /M: SY='F'; M=-42,-40,-52,-46,100,-51,-35,-18,0,5,-18,-43,-52,-50,-37,-41,-35,-23,-13,9;
MA   /I: I=-15; MD=-77;
MA   /M: SY='A'; M=68,-34,-41,-34,-40,-27,-42,-26,-36,-5,-27,-35,-40,-33,-40,-16,7,6,-49,-40; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='M'; M=-11,24,1,33,-37,-38,-28,4,27,-14,37,-7,-34,-17,10,15,8,-26,-48,-33;
MA   /M: SY='N'; M=-30,-41,33,24,-48,-28,-18,-45,21,-47,-37,74,-35,31,-18,-17,12,-44,-56,-38;
MA   /M: SY='D'; M=-1,-42,68,9,-50,-27,-23,-47,-14,-49,-43,40,15,-20,-30,32,-6,-42,-59,-39;
MA   /M: SY='E'; M=17,-41,24,38,-42,-32,14,-24,1,-14,-32,21,-35,-15,24,21,-22,-34,-50,-35;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-39,-14,-26,13,-27,42,-39,-7,-22,-31,84,-42,5,9,-1,-21,-41,-48,-1;
MA   /M: SY='W'; M=-41,-48,-49,-42,75,-47,-25,-25,-38,-19,-22,-44,-51,10,-36,-39,-38,-31,93,76;
MA   /M: SY='Q'; M=33,-41,-30,7,-38,-35,-32,15,36,-6,-22,-28,-36,45,-18,-22,-25,6,-43,-33;
MA   /M: SY='D'; M=16,34,37,20,-45,2,23,-37,13,-37,9,-20,-36,29,-8,-14,-27,-5,-51,-34;
MA   /M: SY='I'; M=-31,-39,-51,-46,-15,-54,-44,52,-45,50,-3,-45,-46,-41,-45,-39,5,29,-44,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-34,-47,97,-3,-49,-33,-23,-46,-25,-12,-43,-7,-36,-24,-33,3,-24,-45,-67,-37;
MA   /M: SY='D'; M=1,-40,55,6,-47,-28,-26,-44,-2,-45,-39,1,-33,-1,12,45,23,-37,-55,-36;
MA   /M: SY='L'; M=-36,-39,-54,-47,46,-54,-38,26,-46,60,23,-49,-51,-42,-44,-44,-31,0,-32,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-12,-43,-51,-48,10,-2,-45,67,-45,25,31,-42,-44,-41,-46,-38,-29,11,-40,-23;
MA   /M: SY='S'; M=23,-40,16,27,-19,5,-28,-25,-24,-8,1,-5,-35,30,-29,34,-21,-31,-46,-33;
MA   /M: SY='Q'; M=-26,18,-25,5,-41,-36,36,-38,3,-15,-2,-9,-36,54,33,25,24,-35,-49,-29;
MA   /M: SY='L'; M=-29,-39,-48,-44,25,-19,-39,34,-42,45,26,-41,-46,-38,-43,11,-26,16,-39,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=16,-42,4,-9,-33,-2,-26,-20,10,-9,-27,-23,-38,41,20,14,-2,-13,-39,22;
MA   /M: SY='F'; M=-32,19,5,0,51,-41,14,-32,-17,-19,-27,-4,-42,30,45,-3,-5,-14,-36,-16;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-47,46,19,-6,-36,4,-37,10,-39,-7,5,38,6,14,0,-25,-8,-47,-8;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=12(12); /POSITIVE=12(12); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=DBF4-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9NK54   , CHIF_DROME , T; Q99MU0    , DBF4A_CRIGR, T; 
DR Q9UBU7 , DBF4A_HUMAN, T; Q9QZ41 , DBF4A_MOUSE, T;
DR Q7ZZH7 , DBF4A_XENLA, T; Q28FY7 , DBF4A_XENTR, T;
DR Q8NFT6 , DBF4B_HUMAN, T; Q283Q6 , DBF4B_XENLA, T;
DR P32325 , DBF4_YEAST , T; O59836 , HIM1_SCHPO , T;
DR Q9Y7J1 , SPO6_SCHPO , T; Q9HCK1 , ZDBF2_HUMAN, T;
3D 4F99; 4F9A; 4F9B; 4F9C; 6YA6; 6YA7; 6YA8; 7P5Z; 7PT6; 7PT7; 7V3V; PR PRU00600; DO PDOC51265; //