PROSITE logo

PROSITE entry PS51337

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   B12_BINDING_NTER; MATRIX.
AC   PS51337;
DT   01-NOV-2007 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   B12-binding N-terminal domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=95;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=92;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0990186; R2=0.0076604; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12164.8017578; R2=8.5884409; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1032; H_SCORE=21028; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=575; H_SCORE=17103; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-19; D=-90; I=-90; E0=-100; B1=-400; E1=-400; MI=-205; MD=-205; IM=-205; DM=-205;
MA   /I: B1=0; BI=-205; BD=-205;
MA   /M: SY='K'; M=21,-50,-4,25,-51,-17,-4,-15,30,-35,-39,-1,21,-11,12,-1,10,-3,-57,-45;
MA   /M: SY='D'; M=22,-50,35,28,-52,2,-18,-25,19,-26,-20,17,-8,-15,-3,-9,-1,-16,-59,-46;
MA   /M: SY='E'; M=5,-51,20,36,-28,-11,-38,-14,11,4,-25,-14,4,11,-9,14,-11,-10,-56,-43;
MA   /M: SY='E'; M=16,-51,-21,47,-25,-16,-40,5,0,-2,-10,-37,14,13,-18,3,-5,-12,-9,-42;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-56,7,13,-11,-25,-16,9,4,1,-12,-7,7,-1,-16,-27,-8,-13,91,17;
MA   /M: SY='R'; M=22,-50,-24,15,-28,-32,-29,-36,15,-20,-12,-7,21,-11,43,16,-9,-2,-55,-43;
MA   /M: SY='P'; M=21,-51,17,37,-47,-10,-30,-19,1,-36,-43,33,40,0,-36,5,-7,-31,-59,-48;
MA   /M: SY='E'; M=8,-51,20,31,-21,-23,-39,-14,10,30,25,-20,-25,10,-35,-26,-23,-16,19,-38;
MA   /M: SY='P'; M=-15,-53,13,20,-52,-10,-39,-29,-3,-34,-30,3,62,-11,-3,15,27,-22,-58,-25;
MA   /M: SY='P'; M=-20,-49,-33,-45,-34,-40,-9,16,-31,34,3,-12,36,-43,-8,-12,12,35,-57,-39;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-52,13,51,15,-33,-38,-4,7,8,-12,-6,-26,-6,0,-16,-23,-1,-29,-37;
MA   /M: SY='E'; M=-17,-56,23,73,-53,-37,-9,-53,26,-25,-43,-15,-39,21,8,-34,-26,-38,-54,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-25,-56,4,14,-54,-22,-34,-24,28,-49,-7,-31,10,18,68,4,-6,-31,-55,-43;
MA   /M: SY='L'; M=-43,-48,-31,-53,-7,-63,-49,38,-34,66,22,-56,-58,-48,-51,-52,-38,15,-50,-31;
MA   /M: SY='A'; M=32,-49,-34,27,-19,-33,17,-28,28,-28,-38,-2,-45,-5,24,9,-15,-8,-51,3;
MA   /M: SY='H'; M=-17,-55,23,30,-36,-46,61,-50,25,-21,-38,22,-45,35,22,-33,-17,-38,-54,17;
MA   /M: SY='A'; M=61,-46,-20,-19,-43,-37,11,-12,10,-18,-7,-37,-25,10,6,-9,-20,-33,-48,18;
MA   /M: SY='I'; M=-39,-49,-61,-55,-25,-64,-55,58,-30,44,17,-56,-56,-50,-53,-50,-35,47,-54,-34;
MA   /M: SY='V'; M=-28,-49,-56,-14,5,-62,-24,50,-51,19,14,-53,-54,-49,-52,-47,-34,59,-50,12;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-56,60,53,-57,-46,17,-58,41,-52,-48,-12,-40,18,-13,-12,-22,-54,-60,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-15,-17,-26,-57,87,-46,-40,-44,-59,-50,-29,-46,-16,-36,-15,-43,-55,-51,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-54,56,33,-42,-36,-41,46,-8,5,-27,-12,-46,-33,-10,-19,-6,-22,-59,-41;
MA   /M: SY='K'; M=-34,-53,11,12,-46,-15,-35,-40,51,-13,-2,-18,-27,-6,42,-5,11,-23,-52,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-54,59,68,-58,-30,-33,-33,-9,-46,-49,9,-39,-5,-15,-10,1,-45,-63,-48;
MA   /M: SY='G'; M=-18,-54,7,20,21,51,-10,-23,-24,-25,-11,11,-12,-35,-11,-10,-39,-46,-43,32;
MA   /M: SY='I'; M=2,-3,-13,-34,-25,-56,-51,57,-29,30,13,-24,-52,-46,-50,-29,-9,30,-55,-37;
MA   /M: SY='E'; M=-22,-52,7,49,-45,-13,-27,19,11,-20,-22,-9,-44,6,-8,-20,3,24,-56,-20;
MA   /M: SY='E'; M=30,-51,35,57,-56,-7,-36,-54,-5,-51,-47,-8,8,3,-35,10,-8,-42,-58,-26;
MA   /M: SY='D'; M=1,-52,61,-4,-41,7,-28,-27,-5,26,-33,-25,-48,2,-40,-21,-24,-13,31,-8;
MA   /M: SY='T'; M=0,-44,-52,-49,-31,-54,-51,19,-47,36,-6,-45,-50,-47,-50,-34,51,46,-58,-38;
MA   /M: SY='E'; M=-23,-56,33,69,-55,-33,-32,-20,18,-46,-44,6,-27,32,0,-27,-27,-26,-57,-21;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-31,21,67,-54,-38,-36,-22,37,-20,-43,-28,-41,5,1,-20,-30,-27,-57,-47; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='A'; M=68,-21,-48,-22,-42,8,-48,-21,-35,12,-25,-44,-48,-40,-47,-28,-35,-14,36,-12; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='L'; M=-43,-50,-56,-48,-17,-55,-45,16,-16,57,18,-51,-57,-41,32,-47,1,6,-14,-18; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='Q'; M=17,-54,10,33,-56,-24,-36,-45,36,-29,-5,2,-36,48,-1,-13,-9,-37,-57,-46; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='E'; M=20,-38,-5,37,-50,-41,4,-13,27,-10,-38,1,-45,21,8,-17,3,-41,-56,-21; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-48,-41,7,-3,54,-25,-12,-7,-16,-28,-7,-50,-33,-10,-31,-35,-33,-42,45; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='W'; M=4,-52,0,11,-28,-23,-31,-3,20,10,0,-21,12,-35,-16,-2,9,2,21,-42; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-31;
MA   /M: SY='D'; M=-17,-68,42,13,-69,-58,-20,-41,13,-52,-51,-20,-58,-11,0,-4,-10,-61,-75,-39; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-31; IM=0; DM=-31;
MA   /M: SY='P'; M=13,-32,-41,2,-62,-43,-46,-51,-39,-58,-47,-48,110,-40,-50,-33,-27,-51,-57,-58;
MA   /M: SY='L'; M=-35,-50,-40,-31,18,-59,-41,32,-47,52,30,-51,-56,20,-32,-36,-39,-1,-41,31;
MA   /M: SY='D'; M=7,-53,54,48,-57,-38,17,-40,3,-47,-46,9,-41,27,-8,6,2,-43,-62,-45;
MA   /M: SY='I'; M=-19,-50,-61,-57,-27,-63,-59,73,-54,25,-3,-54,-54,-52,-56,-47,-19,45,-54,-35;
MA   /M: SY='I'; M=-38,-51,-60,-57,-9,-62,-58,77,-54,20,-15,-52,-53,-51,-56,-4,-33,39,-53,-34;
MA   /M: SY='N'; M=-40,-50,31,49,0,-40,-28,-30,-27,-35,-44,79,-45,3,-35,-28,-2,-23,-62,-43;
MA   /M: SY='D'; M=-36,-54,50,45,-59,43,-35,-48,0,-57,-50,30,-42,6,-22,-26,-1,-44,-61,-49;
MA   /M: SY='P'; M=20,-54,-19,-27,-17,33,11,7,-30,-23,-37,-30,59,-14,-32,-26,-28,-27,-45,32;
MA   /M: SY='L'; M=-45,-47,-62,-54,1,-63,-45,-1,-55,79,27,-60,-61,-48,-52,-55,-41,-17,-48,-29;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-48,-57,-51,-29,-54,-44,49,-46,24,86,-47,-50,-42,-27,2,-7,10,-53,-33;
MA   /M: SY='P'; M=8,-55,41,-1,-54,-19,-41,-31,7,-24,-20,-5,72,-7,-23,-16,-19,-5,-59,-49;
MA   /M: SY='G'; M=41,-49,-43,-47,-58,81,-48,-59,-25,-57,-48,-31,-45,-41,-49,-17,-40,-50,-52,-53;
MA   /M: SY='M'; M=-40,-48,-62,-52,-26,-56,-36,29,-47,23,120,-50,-50,-39,-45,-50,-38,-16,-51,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-19,-52,34,30,-57,5,-32,-55,46,-56,-47,48,-43,-9,8,-1,-2,-40,-60,-47;
MA   /M: SY='E'; M=-30,-53,-23,51,-40,-38,11,34,-17,-21,-9,-41,-45,-1,11,-39,-15,39,-56,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-9,-44,-60,-54,-32,-60,-62,24,-52,-10,-20,-55,-56,-54,-54,-43,-29,87,-64,-39;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-52,-41,-51,-59,90,-47,-50,-45,-61,-51,-27,-45,-42,-52,17,-17,-57,-52,-53;
MA   /M: SY='D'; M=-23,-57,71,50,-59,-47,-32,-42,6,-53,-49,-15,-42,14,37,-33,-20,-29,-64,-46;
MA   /M: SY='L'; M=-44,-50,-8,-24,-27,-59,-40,-20,4,65,27,-48,-56,-16,33,-48,-40,-26,-51,-34;
MA   /M: SY='Y'; M=-51,-54,-57,-57,90,-58,-30,-30,-50,-23,-28,-53,-62,-52,-47,-48,-44,-35,21,91;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-55,34,52,-60,56,-36,-62,-29,-58,-50,6,-42,13,-4,-13,-23,-56,-58,-50;
MA   /M: SY='Q'; M=18,-51,32,19,-57,-40,-33,-52,35,-52,-44,12,-43,35,28,24,-31,-28,-58,-45;
MA   /M: SY='G'; M=-30,-53,-35,-45,-59,84,-41,-65,-5,-62,-51,41,-46,-8,-13,-27,-41,-60,-54,-53;
MA   /M: SY='E'; M=-39,-56,-9,55,-49,-53,-38,27,54,-35,-36,-34,-41,29,-12,-36,-25,0,-54,-43;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-49,-56,-49,-3,-55,-37,26,-25,27,85,-49,-53,-40,-2,-45,-38,8,-41,42;
MA   /M: SY='F'; M=-50,-52,-58,-50,100,-58,-40,4,-48,-16,-27,-50,-60,34,-46,-47,-43,-31,-22,32;
MA   /M: SY='L'; M=-41,-46,-62,-55,-21,-64,-50,11,-55,71,-9,-60,-60,-50,-53,-52,-37,40,-52,-33;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-65,-44,-33,-62,-44,-47,-50,-40,-59,-47,-48,115,-43,-52,-38,0,-53,-57,-59;
MA   /M: SY='Q'; M=-40,-57,15,27,34,-46,25,-50,-24,-44,-38,23,-46,93,-26,-31,-38,-51,-48,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-35,-45,-61,-54,-26,-62,-54,-2,-53,48,27,-58,-58,-51,-53,-48,-33,71,-58,-35;
MA   /M: SY='M'; M=-40,-48,-62,-55,-24,-62,-48,45,-53,53,67,-56,-56,-47,-52,-51,-37,29,-52,-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-19,-53,-42,-27,-43,-50,-34,-9,43,20,50,-36,-47,70,10,-22,-37,-24,-50,-37;
MA   /M: SY='S'; M=44,-41,-37,-36,-51,-15,-40,-24,-37,-50,-44,-27,-42,-30,-41,80,-9,-37,-58,-45;
MA   /M: SY='A'; M=83,-40,-44,-38,-54,1,-46,-44,-40,-46,-40,-37,-44,-36,-45,13,-29,-32,-54,-49;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-58,37,67,-60,-21,-31,-60,7,-55,-48,4,-41,30,44,-21,-37,-55,-59,-47;
MA   /M: SY='T'; M=43,-40,-44,-42,-43,-42,-50,-16,-41,-34,-32,-36,-44,-42,-46,-5,65,44,-61,-44;
MA   /M: SY='M'; M=-37,-46,-61,-51,-29,-54,-34,-10,-45,-7,127,-49,-49,-37,-43,-48,-36,23,-53,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-40,-54,4,-23,-43,-48,-15,-28,78,-15,5,-14,-44,27,-6,-24,-8,-44,-46,24;
MA   /M: SY='K'; M=41,-49,-9,8,-47,0,-26,-34,44,-49,-24,3,0,21,-12,-3,-5,-42,-53,-28;
MA   /M: SY='A'; M=67,-8,-44,-42,-54,49,-47,-28,-42,-49,-42,-34,-45,-39,-47,12,-24,-37,-54,-50;
MA   /M: SY='V'; M=-38,-47,-62,-56,56,-61,-51,22,-53,12,54,-55,-57,-53,-52,-48,-35,61,-45,-22;
MA   /M: SY='A'; M=50,-48,36,42,-25,-4,-39,-51,-17,-51,-45,-22,9,-29,-26,-1,-2,-42,-57,-47;
MA   /M: SY='Y'; M=-32,-35,-52,-48,14,-58,45,40,-26,11,-4,-46,-55,-41,14,-45,-39,16,2,67;
MA   /M: SY='L'; M=-44,51,-62,-55,-21,-63,-49,21,-56,74,-9,-59,-61,-50,-54,-53,-40,-9,-51,-33;
MA   /M: SY='K'; M=-26,-53,-22,46,-51,-48,-34,-15,52,-20,0,12,-41,22,16,-11,11,-34,-55,-43;
MA   /M: SY='P'; M=-22,-62,-5,24,-62,-44,-41,-52,-21,-58,-47,-40,100,22,-42,0,-11,-53,-57,-55;
MA   /M: SY='Y'; M=-39,-53,-41,15,35,-54,42,-28,6,21,-4,-13,-52,-9,7,-25,-27,-15,-34,61;
MA   /M: SY='M'; M=-32,-47,-59,-52,-24,-57,-43,33,-50,55,82,-51,-54,-43,-49,-6,-16,-15,-51,-31;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-54,8,69,-27,-9,-36,-25,12,-49,-44,-8,10,4,-19,-8,1,-19,-57,-46;
MA   /M: SY='K'; M=21,-51,-26,38,-56,6,-8,-49,50,-42,-43,-24,-41,22,2,21,-25,-47,-54,-45;
MA   /M: SY='E'; M=3,-49,27,42,-54,-3,-36,-42,20,-49,-11,18,-19,-5,-32,19,21,-8,-60,-46;
MA   /M: SY='K'; M=13,-52,24,18,-56,22,-5,-52,31,-53,-12,9,29,-19,2,8,-17,-34,-58,-47;
MA   /M: SY='E'; M=19,-50,-4,26,-53,18,6,-31,19,-31,-41,-3,0,11,2,15,-9,-7,-57,-45;
MA   /M: SY='P'; M=21,-51,13,27,-52,13,-38,-44,12,-35,-36,-8,28,10,-30,19,2,-18,-55,-17;
MA   /M: SY='K'; M=-22,-38,-5,23,-51,20,6,-38,45,-25,-1,6,-38,2,-8,15,23,-43,-56,-40;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-42,-4,-14,-49,37,-29,9,26,-17,-33,-19,-19,14,8,9,4,-10,-55,-44;
MA   /I: E1=0; IE=-205; DE=-205;
PP   /PROMOTED_BY: PS51332;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=44(44); /POSITIVE=44(44); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=B12-binding N-terminal;
CC   /VERSION=6;
DR   Q50900   , CARH_MYXXA , T; Q5E814    , METH_ALIF1 , T; 
DR Q9AJQ8 , METH_ALIFS , T; Q4JIJ3 , METH_BOVIN , T;
DR A8XY95 , METH_CAEBR , T; Q09582 , METH_CAEEL , T;
DR Q54P92 , METH_DICDI , T; P13009 , METH_ECOLI , T;
DR Q99707 , METH_HUMAN , T; A6H5Y3 , METH_MOUSE , T;
DR Q49775 , METH_MYCLE , T; O33259 , METH_MYCTU , T;
DR Q9I2Q2 , METH_PSEAE , T; Q9Z2Q4 , METH_RAT , T;
DR P37586 , METH_SALTY , T; Q55786 , METH_SYNY3 , T;
DR Q9KUW9 , METH_VIBCH , T; Q87L95 , METH_VIBPA , T;
DR Q8DCJ7 , METH_VIBVU , T; Q7MHB1 , METH_VIBVY , T;
DR Q46EH4 , MTAC_METBF , T; Q8TTB0 , MTBC1_METAC, T;
DR P58979 , MTBC1_METMA, T; Q8TS71 , MTBC2_METAC, T;
DR P58980 , MTBC2_METMA, T; Q8TN69 , MTBC3_METAC, T;
DR P58981 , MTBC3_METMA, T; O93657 , MTBC_METBA , T;
DR Q24SP8 , MTGC_DESHY , T; P58867 , MTMC1_METAC, T;
DR O30641 , MTMC1_METBA, T; P58977 , MTMC1_METMA, T;
DR P58868 , MTMC2_METAC, T; Q9P9L5 , MTMC2_METBA, T;
DR P58978 , MTMC2_METMA, T; P0DX07 , MTQC_EUBLI , T;
DR Q48925 , MTSB_METBA , T; Q8PUA7 , MTSB_METMA , T;
DR Q8TTA8 , MTTC1_METAC, T; P58982 , MTTC1_METMA, T;
DR Q8TS74 , MTTC2_METAC, T; P58983 , MTTC2_METMA, T;
DR O93659 , MTTC_METBA , T; Q57195 , Y1042_HAEIN, T;
3D 1BMT; 1K7Y; 1K98; 2I2X; 3BUL; 3EZX; 3IV9; 3IVA; 7XCN; PR PRU00667; DO PDOC51332; //