PROSITE logo

PROSITE entry PS51399

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   SEP; MATRIX.
AC   PS51399;
DT   01-AUG-2008 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   SEP domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4773149; R2=0.0089281; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9002.6689453; R2=1.0923424; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=675; H_SCORE=9740; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=451; H_SCORE=9495; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-47; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='K'; M=-33,-112,23,28,-108,-105,23,-75,42,-28,0,-26,26,-4,26,-41,-13,-4,-116,-100;
MA   /M: SY='V'; M=-23,-107,13,24,-57,-38,-101,-9,-25,-40,-89,-4,-8,10,2,-51,-7,57,-117,-100;
MA   /M: SY='P'; M=-18,5,7,11,-76,-69,24,-5,-34,-36,-49,-45,47,-10,-52,11,32,9,7,-99;
MA   /M: SY='H'; M=-96,2,-107,-101,-93,-116,66,34,-59,-23,-31,-100,-111,-95,57,-100,-94,58,-116,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-67,-5,-47,2,-103,-105,25,-5,-2,-36,-92,37,41,-47,6,-24,35,24,-119,-100;
MA   /M: SY='I'; M=-98,-106,-120,-114,-81,-122,-112,68,-112,55,-17,-114,-114,-108,-113,-108,-93,40,-110,-91;
MA   /M: SY='T'; M=-63,-105,-94,-42,-100,-40,67,-39,22,-97,-92,-27,-101,-27,3,-40,74,18,-14,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-102,-105,-120,-114,77,-119,-104,-4,-112,57,26,-114,-117,-111,-110,-68,-97,17,-94,-74;
MA   /M: SY='W'; M=-108,-126,-121,-112,-65,-110,-97,-99,-104,-57,-96,-119,-116,-102,-104,-110,-111,-109,153,99;
MA   /M: SY='R'; M=-46,-110,-91,-27,-109,-101,-12,-110,55,-49,-98,10,-32,15,68,28,-21,-106,-111,-43;
MA   /M: SY='N'; M=-74,-107,66,-4,-116,-70,-82,-114,-40,-116,-107,99,-104,24,-91,-39,-40,-113,-128,-105;
MA   /M: SY='G'; M=-84,-111,-50,-109,-117,101,-27,-125,-104,-121,-110,-84,-103,-101,-111,-40,-102,-119,-109,-111;
MA   /M: SY='F'; M=-108,-107,-122,-118,109,-119,-103,35,-113,-20,-11,-112,-118,-118,-111,-109,-100,-80,-81,2;
MA   /M: SY='T'; M=-28,38,-96,-32,-36,-100,-99,-3,-43,-62,1,-88,-101,34,-39,48,67,-6,-116,-98;
MA   /M: SY='V'; M=-92,-104,-119,-113,-40,-120,-115,52,-110,1,35,-113,-112,-110,-112,-104,-89,81,-115,-92;
MA   /M: SY='D'; M=-81,-111,84,17,19,-6,-14,-113,-12,-112,-108,66,-103,-87,-94,-88,-91,-112,-120,-97;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-113,101,9,-119,6,-32,-116,-89,-116,-112,8,-101,-31,-39,-16,-54,-55,-129,-105;
MA   /M: SY='G'; M=-86,-111,0,-31,-53,94,-22,-121,-101,-65,-108,-19,-103,-98,-108,-28,-100,-116,-110,-108;
MA   /I: I=-22; MD=-57;
MA   /M: SY='P'; M=-50,-120,-27,54,-117,-35,-54,-110,-26,-115,-105,-99,102,-55,-99,-26,-94,-49,-114,-59; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
MA   /M: SY='F'; M=-56,-105,-118,-58,84,-118,-102,-56,-109,66,-73,-113,-118,-44,-42,-109,-99,-81,-91,-71;
MA   /M: SY='R'; M=-100,-114,-100,-89,3,-111,11,-101,1,-42,44,-63,-109,-36,99,-97,-98,-40,-103,14;
MA   /M: SY='P'; M=-20,-111,23,-44,-109,-75,-31,-106,-8,-25,-99,-17,66,-59,50,41,-24,-104,-7,-102;
MA   /M: SY='Y'; M=-104,-110,-108,-107,54,-113,-83,-28,-45,18,-7,-41,-116,-99,-17,-44,-98,-88,-74,107;
MA   /M: SY='D'; M=-44,-109,81,20,-113,-6,-87,-114,-48,-113,-107,33,-100,30,-92,33,-32,-110,-119,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-68,-112,102,-25,-111,-49,4,-48,-91,-53,-107,-1,-102,-89,-98,11,-90,-21,42,-99;
MA   /M: SY='P'; M=-13,-120,-7,-9,-117,-63,8,-107,-94,-114,-37,-40,115,-31,-104,-94,-49,-71,-115,-111;
MA   /M: SY='E'; M=27,-107,-13,65,-107,-57,-92,-47,-20,-14,-29,-3,-98,7,21,5,-7,-97,-113,-75;
MA   /M: SY='N'; M=-55,19,-77,-93,-109,-20,-21,-107,-86,-112,-102,108,-104,-87,-94,10,40,-105,-126,-104;
MA   /M: SY='Q'; M=55,-105,-11,-12,-107,-96,-33,-23,22,-64,-4,-90,-101,55,17,-21,-8,-32,-109,-33;
MA   /M: SY='Q'; M=21,-109,-17,34,-45,-99,-22,-102,11,-48,2,-32,-23,74,5,13,-56,-36,-110,-62;
MA   /M: SY='F'; M=-103,38,-24,-46,103,-114,-102,13,-108,-44,-42,-105,-115,-113,-109,-32,-29,-10,-85,-7;
MA   /M: SY='L'; M=-99,-22,-117,-111,26,-55,-102,12,-109,74,60,-112,-114,-104,-108,-108,-95,-9,-102,-83;
MA   /M: SY='E'; M=12,-110,31,68,-114,-99,-87,-110,-4,-108,-101,24,-97,42,36,-26,-90,-51,-114,-102;
MA   /M: SY='D'; M=12,-105,63,29,-107,-30,-91,-46,-89,-104,23,0,-99,-85,-96,54,-4,-70,-116,-12;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='I'; M=-51,-107,-119,-115,-83,-121,-114,85,-111,29,9,-112,-111,-108,-113,-106,-92,39,-110,-91;
MA   /M: SY='M'; M=-24,-107,-6,6,-100,-12,-88,-51,33,-3,51,49,-103,-5,39,-36,-32,-97,-110,-14;
MA   /M: SY='R'; M=12,-110,37,24,-113,-99,-88,-112,46,-109,-100,0,-99,41,51,-10,-29,-106,-113,-100;
MA   /M: SY='G'; M=-61,-108,-96,-105,-114,95,-101,-118,-100,-69,-40,-32,-102,-49,-58,25,-95,-113,-109,-108;
MA   /M: SY='E'; M=-57,-112,-48,57,40,-72,-35,26,-84,-89,-89,-97,-104,21,40,-96,-96,-10,-94,53;
MA   /M: SY='C'; M=34,53,-111,-61,41,-58,-104,30,-105,2,-81,-105,-111,-105,-107,-62,-77,36,-42,34;
MA   /M: SY='P'; M=-53,-124,-100,-89,-119,-101,-103,-107,-57,-117,-104,-105,126,-99,-56,-50,-92,-112,-113,-116;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-107,-93,23,-71,-66,-28,-42,2,4,33,-93,41,18,-12,35,-40,-39,2,34;
MA   /M: SY='E'; M=-32,-109,-52,92,-112,-50,24,-110,-50,-107,-101,-86,-45,14,-24,39,-88,-38,-113,-101;
MA   /M: SY='L'; M=-70,-103,-115,-109,28,-71,4,21,-109,78,-21,-111,-51,-104,-107,-106,-45,-51,-100,-25;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-108,-94,17,-38,-71,-10,-58,22,27,35,-93,-103,57,41,-48,-46,-37,-41,-24;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,-109,32,-9,-113,-9,3,-110,3,-110,-100,38,35,55,32,7,-16,-107,-114,-100;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-105,-39,-31,-97,-55,-95,-3,27,-6,-6,-16,-48,45,25,-6,-16,40,-109,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-40,36,8,40,-3,-11,-98,-90,-58,-92,-22,2,-4,8,-28,-56,-49,-88,79;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='P'; M=-50,-117,-4,-34,17,-105,35,-105,-3,-44,-11,-24,90,2,34,-96,-61,-107,-109,-49; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='D'; M=-99,-116,52,-42,-119,46,-17,-59,2,-59,-110,47,-109,-38,-3,-59,-27,-116,-125,-110; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-123,-67,-5,-126,-5,-106,-28,-6,-118,-110,-22,-113,71,-40,-20,35,-113,-126,-114; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-50;
MA   /M: SY='G'; M=-40,-114,36,26,-51,42,-37,-28,-49,-107,13,-23,24,30,-12,-16,-42,-52,-115,-104; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-50;
MA   /M: SY='V'; M=-49,-26,-116,-110,7,-116,-113,49,-108,9,5,-109,-111,-108,-109,-66,-43,80,-110,-88;
MA   /M: SY='H'; M=-37,-108,60,-6,-108,-95,65,-107,-86,-71,6,52,45,-2,-30,18,-11,-106,-121,-44;
MA   /M: SY='V'; M=-92,-101,-40,-63,37,-116,-109,13,-107,33,-73,-47,-112,-108,-108,-101,-43,78,-107,-84;
MA   /M: SY='N'; M=-15,-106,30,23,-108,-48,-8,-58,40,-82,-99,65,-99,7,13,7,-16,-40,-115,-46;
MA   /M: SY='V'; M=-49,-101,-112,-59,-82,-71,-105,24,-105,50,41,-108,-110,-35,-105,-22,-88,68,-110,-90;
MA   /I: I=-22; MD=-57;
MA   /M: SY='E'; M=-48,-113,-18,52,-38,-110,13,37,-3,-96,-94,-8,-40,-8,-9,-6,-20,-4,-112,2; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-109,93,-46,-110,-97,16,-27,41,-105,-12,-3,-38,-1,4,-12,-60,-33,-120,-97;
MA   /M: SY='H'; M=-95,46,-52,-53,-105,-101,85,-65,50,-69,-93,11,-51,21,70,-18,-68,-105,-113,-89;
MA   /M: SY='H'; M=-50,-103,-92,-57,-98,-34,67,-60,8,4,13,-32,-26,-13,56,14,52,-52,-112,-90;
MA   /M: SY='H'; M=-91,-107,54,49,-65,-17,67,-18,-49,-104,-97,40,-32,29,-55,15,-13,-50,-118,-94;
MA   /M: SY='E'; M=-90,-109,11,94,-110,-59,-86,-102,-58,-65,-34,-10,-9,43,-52,-24,-21,-5,-112,-101;
MA   /M: SY='D'; M=-42,22,72,16,-96,-99,-88,-3,12,-25,-34,16,-8,-36,-54,-12,-1,-29,-24,35;
MA   /M: SY='Y'; M=-52,48,-108,-105,63,-109,-84,-42,-99,-50,-83,-104,-114,-13,-32,-99,-96,6,69,105;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-102,-38,4,-97,-101,3,0,12,-35,3,-11,21,20,-12,4,23,49,-112,-95;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=27(26); /POSITIVE=27(26); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SEP;
CC   /VERSION=6;
DR   Q3SZC4   , NSF1C_BOVIN, T; Q5ZK10    , NSF1C_CHICK, T; 
DR Q54BQ5 , NSF1C_DICDI, T; Q9UNZ2 , NSF1C_HUMAN, T;
DR Q9CZ44 , NSF1C_MOUSE, T; Q5RBG3 , NSF1C_PONAB, T;
DR O35987 , NSF1C_RAT , T; Q9SUG6 , PUX3_ARATH , T;
DR Q8RWU7 , PUX4_ARATH , T; Q7Y175 , PUX5_ARATH , T;
DR F4IXN6 , PUX6_ARATH , T; Q5T124 , UBX11_HUMAN, T;
DR Q9D572 , UBX11_MOUSE, T; Q8R512 , UBX11_RAT , T;
DR P0C8Q0 , UBX1_EMENI , T; P34223 , UBX1_YEAST , T;
DR P68543 , UBX2A_HUMAN, T; Q99KJ0 , UBX2A_MOUSE, T;
DR D3ZID8 , UBX2A_RAT , T; Q5ZLK2 , UBX2B_CHICK, T;
DR Q14CS0 , UBX2B_HUMAN, T; Q0KL01 , UBX2B_MOUSE, T;
DR P0C627 , UBX2B_RAT , T; Q0P3R5 , UBX2B_XENLA, T;
DR Q9UT81 , UBX3_SCHPO , T; Q9N2W5 , UBXN2_CAEEL, T;
3D 1SS6; 1VAZ; 6OPC; 7R7S; 7R7T; PR PRU00732; DO PDOC51399; //