PROSITE logo

PROSITE entry PS51460

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   GAR; MATRIX.
AC   PS51460;
DT   01-MAR-2010 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   GAR domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=74;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7160497; R2=0.0086696; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9880.3740234; R2=2.7806418; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=668; H_SCORE=11738; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=437; H_SCORE=11096; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-39; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='T'; M=16,21,-15,-46,-88,9,-36,-25,-35,-38,5,35,-53,-38,-30,25,49,-57,-100,-85;
MA   /M: SY='P'; M=-53,-98,48,-17,-89,-43,35,-38,12,-92,-84,-71,77,-43,-32,-41,19,-89,-95,17;
MA   /M: SY='G'; M=4,-89,-34,-13,-51,32,7,-45,4,-18,-51,20,-38,1,-6,27,18,-82,-96,-83;
MA   /M: SY='D'; M=-27,-37,51,24,-17,-29,25,-84,7,10,-78,-12,40,-43,-14,-30,-76,-47,-98,-80;
MA   /M: SY='T'; M=-18,-88,10,-34,-55,-83,-79,-58,46,-12,0,-19,19,-30,-25,23,50,-79,-97,-82;
MA   /M: SY='L'; M=-63,-89,-93,-35,-16,-67,-85,32,-9,64,-54,-41,-39,-18,-31,-51,-39,-15,-89,-36;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-91,74,3,-94,-18,23,-46,-72,-89,-31,-21,-17,-13,-36,-11,49,-46,-107,-84;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-95,59,21,-16,-84,19,-36,-74,-30,-80,-30,48,28,-80,-6,-48,-11,-100,-81;
MA   /M: SY='A'; M=61,-86,-24,43,-90,-78,-14,-49,-73,-25,3,-32,-23,11,-79,-12,0,-42,-96,-85;
MA   /M: SY='V'; M=-23,-89,-96,-91,24,-48,-92,33,-58,2,-62,-48,21,-90,-34,-84,-74,64,-90,-11;
MA   /M: SY='R'; M=30,-90,24,-32,-91,-6,18,-46,20,-68,-81,-12,-85,-4,37,21,-14,-56,-30,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-40,-96,6,26,-90,-87,39,-92,32,-31,-5,18,13,-28,60,-27,-76,-90,-96,-32;
MA   /M: SY='I'; M=-40,-37,-85,-46,4,-15,-81,35,17,13,-66,-31,-51,32,16,-2,-54,-3,-87,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-9,0,-33,-27,-36,-68,-30,10,-19,15,12,-44,-32,-26,25,-8,-55,45,-96,-78;
MA   /M: SY='N'; M=13,3,4,7,-44,-19,13,-90,-17,-58,-23,56,-86,-32,26,8,11,-85,9,-37;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='S'; M=-27,-104,-21,18,-105,-42,-31,-32,-5,-54,-35,-13,13,-26,8,35,-59,-96,-110,-97; D=-16;
MA   /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
MA   /M: SY='H'; M=-59,-95,9,-16,-87,-23,49,-45,20,-23,-78,-12,27,12,47,-12,11,-86,-95,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-2,108,0,-79,-85,-87,-40,-16,-8,-24,-76,-52,-52,20,-25,4,-5,4,-103,-86;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-37,17,-69,-90,-81,17,-44,3,-49,-80,41,29,-3,30,5,42,-52,-100,-49;
MA   /M: SY='C'; M=-33,109,-78,15,-91,-8,8,-45,7,-86,9,4,18,-18,-80,8,-74,-59,-103,-88;
MA   /M: SY='P'; M=-2,31,20,17,-91,-86,-16,-28,19,-33,-33,-75,64,8,5,-44,-21,-19,-98,-86;
MA   /M: SY='N'; M=-34,-88,13,-71,-87,-9,6,-83,7,-10,-20,57,12,12,-40,27,24,-58,-99,-33;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-28,-76,-2,-89,-15,-79,9,32,-44,-76,-28,30,29,26,18,5,-25,-94,-83;
MA   /M: SY='F'; M=-80,-90,15,-24,67,-33,-8,-26,-81,-12,-12,-23,24,-43,-20,-16,-24,20,-78,20;
MA   /M: SY='Q'; M=-19,43,-16,-34,-89,-53,-34,-79,37,-17,-21,-9,29,51,15,2,-73,4,-96,-83;
MA   /M: SY='M'; M=-78,-15,10,7,8,-56,-84,25,-81,21,43,-83,-33,-80,-7,-81,-4,41,-92,-42;
MA   /M: SY='Q'; M=-28,-94,-13,36,5,-42,-14,19,-4,-23,-51,-78,-87,44,-7,-53,-62,3,35,43;
MA   /M: SY='R'; M=-81,-97,-73,-6,-87,-89,56,-94,50,-89,-78,-34,-86,30,78,-41,-78,-54,-90,12;
MA   /M: SY='I'; M=-58,-89,10,15,-71,-95,-82,38,-33,34,27,-24,-89,29,-81,-81,-74,34,-93,-28;
MA   /M: SY='H'; M=1,-90,11,-37,-82,30,61,-38,7,-88,-80,-66,-23,7,-74,48,-70,-85,-88,37;
MA   /M: SY='E'; M=-77,-96,25,70,-93,-34,55,-93,-11,-26,-81,-68,4,25,19,-21,-19,-90,-98,-80;
MA   /M: SY='G'; M=-35,-91,-35,-87,-91,89,-83,-93,-44,0,-82,18,-55,-81,-89,-39,-80,-90,-91,-89;
MA   /M: SY='K'; M=-75,-92,-33,-66,-89,5,13,-87,62,-31,-78,-59,-84,24,55,7,-6,-30,-92,-45;
MA   /M: SY='Y'; M=-84,-43,-26,-43,-20,-91,-8,-78,16,-75,-70,-80,-94,-5,11,-35,-79,-81,-54,117;
MA   /M: SY='R'; M=0,9,-78,-72,-37,-83,-75,-50,4,-12,-76,21,7,-3,73,12,-37,-40,35,-78;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-87,-93,-91,68,-26,-87,43,-88,-22,-9,-17,-24,-89,-90,-19,-25,32,-78,0;
MA   /M: SY='G'; M=-24,-93,-80,-49,-9,88,-85,-100,-5,-97,-88,-69,27,-80,-86,-29,-81,-95,-88,-88;
MA   /M: SY='D'; M=-12,-90,64,45,-92,5,9,-88,-31,-21,-83,14,-81,-67,-76,2,20,-49,-102,-84;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-88,-38,-5,-92,-26,-76,-88,69,-66,-81,-66,-35,-7,16,43,9,-40,-93,-83;
MA   /I: I=-24; MD=-61;
MA   /M: SY='Q'; M=-53,-108,13,-82,-103,-17,11,-97,-1,2,-89,-47,34,36,-88,2,-47,-98,-110,-96; D=-24;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='K'; M=-78,-106,-96,-89,17,-106,-97,27,44,-68,-85,-32,3,-18,-27,-89,13,-28,-102,-86; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-61;
MA   /M: SY='M'; M=-77,-11,-88,-81,-43,-29,-83,35,36,28,40,-39,-34,-43,3,-15,-73,26,-91,-75;
MA   /M: SY='R'; M=-79,45,-93,-85,-68,-99,-83,41,-73,30,-59,-87,-95,-19,53,-84,-76,36,-89,11;
MA   /M: SY='F'; M=-83,-87,-92,-90,92,-43,6,-26,-85,14,19,-23,-94,-88,-18,-5,12,-68,-70,-14;
MA   /M: SY='V'; M=-39,33,-99,-94,-68,-100,-99,57,-92,4,-56,-93,-94,-92,-94,-84,-45,76,-98,-77;
MA   /M: SY='R'; M=-80,-97,-79,-69,-90,8,-71,-93,18,-28,-78,-72,-90,-12,102,-76,-81,-61,-91,-80;
MA   /M: SY='I'; M=-40,37,-85,15,-30,-47,-82,51,-75,6,44,-82,-88,-6,19,-47,-4,15,-90,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-40,-85,0,11,-29,-92,-81,-54,-26,61,-7,-29,-90,-77,-82,-10,-5,30,-92,-73;
MA   /M: SY='R'; M=-60,-96,-76,-38,-95,54,45,-101,-3,-95,-83,-6,-87,20,72,-71,-30,-96,-95,-82;
MA   /M: SY='E'; M=-70,-91,-45,54,-95,28,-19,-96,-17,-50,-86,31,-81,-1,4,52,-56,-91,-97,-86;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
MA   /M: SY='H'; M=-25,-92,-74,-70,-89,-86,95,-93,31,-87,-20,-1,-85,-64,61,-49,39,-88,-102,-72;
MA   /M: SY='V'; M=-72,-17,-100,-94,-70,-101,-99,11,-92,0,12,-95,-96,-93,-93,-84,-33,90,-102,-77;
MA   /M: SY='M'; M=-78,-86,-100,-90,-12,-93,-73,-28,-84,-9,138,-88,-89,-77,-82,-88,-76,-9,-89,-66;
MA   /M: SY='V'; M=-41,29,-99,-94,-71,-100,-102,3,-91,-57,-60,-94,-96,-94,-93,-82,-68,97,-104,-79;
MA   /M: SY='R'; M=-83,-100,-80,-68,-93,-93,-69,-99,-10,-92,-81,-73,-9,-57,112,-78,-82,-93,-92,-80;
MA   /M: SY='V'; M=-70,-84,-99,-93,-70,-99,-99,30,-91,-55,13,-93,-94,-91,-92,-25,-68,93,-102,-77;
MA   /M: SY='G'; M=-66,-93,-79,-22,-100,100,-87,-107,-85,-102,-92,-67,-84,-82,-92,-66,-84,-100,-90,-94;
MA   /M: SY='G'; M=-66,-93,-79,-92,-99,100,-86,-107,-85,-103,-92,-6,-85,-83,-93,-66,-84,-100,-91,-94;
MA   /M: SY='G'; M=-66,-93,-14,-90,-100,100,-87,-107,-86,-103,-92,-66,-85,-83,-93,-66,-84,-101,-91,-94;
MA   /M: SY='W'; M=-92,-114,-117,-97,10,-91,-112,-87,-89,-84,-88,-110,-96,-89,-92,-98,-102,-101,173,5;
MA   /M: SY='M'; M=38,-88,50,21,-86,-82,-77,5,-74,-22,51,-72,-84,35,-79,-25,-34,-8,-97,-81;
MA   /M: SY='T'; M=14,-86,70,-9,-92,-30,-79,-84,-74,-88,-84,-62,-20,-74,-81,-4,72,-34,-105,-85;
MA   /M: SY='L'; M=-82,-84,-99,-92,-8,-101,-84,16,-93,87,-44,-97,-98,-86,-90,-92,-77,-52,-84,-66;
MA   /M: SY='D'; M=13,-90,59,54,-97,29,-72,-96,12,-93,-87,-25,-78,-5,-38,13,-71,-89,-97,-86;
MA   /M: SY='E'; M=-76,-95,-18,92,-94,-12,79,-98,-34,-89,-82,-32,-75,-9,1,-71,-77,-64,-98,-77;
MA   /M: SY='Y'; M=-87,-91,-92,-92,91,-94,-65,-68,-86,-62,-66,-88,-98,-86,-83,-34,-80,-73,27,106;
MA   /M: SY='L'; M=-81,-84,-99,-92,-22,-101,-84,10,-93,88,-44,-98,-98,-86,-90,-91,-77,-34,-85,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-39,-89,37,-25,-81,-31,2,-69,3,17,-36,-70,-86,38,47,-12,-14,24,-95,-76;
MA   /M: SY='K'; M=-38,-90,5,42,-35,-86,-73,-79,72,-4,-74,-19,-80,8,6,-38,-36,-4,-91,-78;
MA   /M: SY='H'; M=-83,-92,-69,-75,-32,-83,99,-84,-29,-34,-70,62,-90,-66,16,-73,-76,-86,-74,87;
MA   /M: SY='D'; M=31,-88,88,-16,0,-78,-2,-81,-72,-21,-15,-4,-83,8,-78,-68,-23,-18,-100,-77;
MA   /M: SY='P'; M=-12,-93,-78,-8,-87,-81,-4,6,-6,-27,18,-45,94,-73,-80,31,-28,-47,-93,-84;
MA   /M: SY='C'; M=-38,117,-20,-10,-85,-11,88,-86,-12,-52,-5,-71,-91,-13,-79,-74,-37,-19,-107,-77;
MA   /M: SY='H'; M=-80,-94,-34,-24,-85,-87,92,-89,-1,-33,7,-5,-86,-28,85,-14,-77,-52,-97,-69;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=19(19); /POSITIVE=19(19); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=GAR;
CC   /VERSION=5;
DR   Q03001   , DYST_HUMAN , T; Q91ZU6    , DYST_MOUSE , T; 
DR A0A1L8HFX9, G2L2L_XENLA, T; A0A1L8H8C0, G2L2S_XENLA, T;
DR Q99501 , GA2L1_HUMAN, T; Q8JZP9 , GA2L1_MOUSE, T;
DR Q8NHY3 , GA2L2_HUMAN, T; Q5SSG4 , GA2L2_MOUSE, T;
DR D3ZUE1 , GA2L2_RAT , T; Q86XJ1 , GA2L3_HUMAN, T;
DR Q3UWW6 , GA2L3_MOUSE, T; Q9W3Y4 , GA2PE_DROME, T;
DR O43903 , GAS2_HUMAN , T; P11862 , GAS2_MOUSE , T;
DR O94854 , K0754_HUMAN, T; Q69ZZ9 , K0754_MOUSE, T;
DR Q9UPN3 , MACF1_HUMAN, T; Q9QXZ0 , MACF1_MOUSE, T;
DR D3ZHV2 , MACF1_RAT , T;
3D 1V5R; 5VE9; 5X57; PR PRU00792; DO PDOC51460; //