PROSITE logo

PROSITE entry PS51477

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   PAH; MATRIX.
AC   PS51477;
DT   01-FEB-2010 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   PAH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=71;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=70;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9425911; R2=0.0144807; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=488; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=288; N_SCORE=6.1; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-20,-15,-10,-25,-15,0,5,-5,0,-15,-25,-10,25,-10,-5,15,-25,-10,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-10,-33,-6,7,-27,-20,-10,-22,9,-22,-12,-9,28,7,7,-7,-9,-24,-25,-18,4;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-11,-19,-11,-4,-9,-23,-10,-2,-10,2,-2,-13,-15,-10,-11,-6,3,3,-24,-5,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,5,-26,6,4,-23,-8,1,-25,2,-20,-13,4,-14,2,-1,0,-2,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-22,-18,-27,-22,10,-22,-19,11,-19,7,7,-19,-24,-19,-17,-10,-2,15,-16,2,-20;
MA   /I: I=-6; MD=-13;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-24,14,16,-22,-10,1,-21,1,-17,-14,9,-11,4,0,1,-5,-20,-29,-14,9; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
MA   /M: SY='D'; M=-12,16,-28,24,20,-26,-16,-1,-29,5,-24,-19,7,-3,6,-2,0,-5,-25,-30,-15,12;
MA   /M: SY='A'; M=29,-6,-14,-11,2,-19,-6,-15,-13,-8,-10,-11,-7,-10,-4,-15,10,2,-6,-25,-18,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-21,-20,-23,-13,2,-26,-18,12,-17,19,11,-19,-23,-14,-15,-14,-5,10,-23,-4,-14;
MA   /M: SY='T'; M=-3,0,-13,-3,-4,-17,-15,-4,-15,-6,-10,-8,3,-17,-1,-3,5,6,-11,-30,-11,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-26,-24,-31,-26,53,-24,-7,-1,-23,7,0,-20,-29,-28,-17,-20,-11,-4,13,41,-26;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-26,14,-31,-23,22,-26,24,12,-28,-29,-24,-21,-22,-8,20,-8,6,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-24,22,10,-28,-9,-2,-28,11,-27,-19,18,-12,3,7,5,-4,-23,-32,-17,6;
MA   /M: SY='K'; M=-3,-4,-25,-5,2,-23,-17,-10,-18,20,-17,-7,-2,-8,5,9,-5,-6,-14,-24,-12,3;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-28,-16,-30,-26,2,-29,-24,27,-22,17,11,-27,-27,-24,-21,-15,-4,32,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,0,15,-28,-20,-6,-26,35,-23,-9,-1,-11,16,26,-8,-10,-21,-21,-11,15;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-1,-16,-3,9,-17,-18,-9,-14,0,-13,-11,0,-13,-1,-3,0,-3,-12,-27,-12,3;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-11,-16,-14,-7,-16,-18,-5,-14,3,-11,-6,-7,-19,0,14,-2,-1,-6,-24,-9,-5;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-19,-14,-21,-15,27,-19,-13,5,-18,16,5,-16,-14,-19,-13,-15,-6,1,-4,8,-16; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-6,1,-17,3,6,-17,-7,6,-17,7,-14,-7,2,-8,7,6,-1,-5,-14,-17,-6,6; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='S'; M=3,6,-11,8,3,-17,0,-5,-16,-4,-18,-13,6,-6,1,-6,15,5,-10,-23,-13,2; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='D'; M=-9,15,-25,19,13,-25,-7,5,-25,1,-20,-15,10,-11,9,-1,0,-8,-23,-24,-9,10; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-11,-25,-7,0,-15,-6,-7,-16,-3,-16,-10,-9,17,-2,-2,-6,-9,-17,-14,-7,-4; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-26,11,21,-22,-14,-2,-21,5,-17,-11,2,-7,7,1,-3,-8,-19,-25,-12,13; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-18,-20,-20,-14,-3,-26,-19,17,-18,17,12,-19,-21,-14,-17,-15,-5,14,-22,-5,-15; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='Y'; M=-18,-18,-11,-19,-19,16,-29,21,-5,-13,-4,-2,-17,-30,-11,-12,-17,-11,-9,10,54,-19;
MA   /M: SY='R'; M=-13,5,-26,6,7,-19,-19,-3,-16,5,-11,-9,4,-16,1,10,-7,-8,-14,-28,-12,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,3,-20,2,2,-22,-8,-9,-20,6,-21,-14,6,-14,-1,5,7,-1,-13,-29,-17,0;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-28,-18,-36,-27,62,-28,-19,4,-27,14,3,-21,-28,-35,-19,-19,-9,4,3,22,-27; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-19,-22,-13,8,-25,-16,10,-21,30,11,-20,-25,-16,-12,-21,-8,5,-19,-1,-14; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-13,16,-27,22,20,-27,-14,11,-30,10,-24,-16,10,-10,8,8,-1,-9,-25,-29,-11,13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-18,-8,-22,-18,-8,-23,-23,15,-20,4,4,-16,-21,-18,-21,-10,-5,15,-26,-10,-20; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-31,-22,10,-26,-16,19,-22,27,24,-25,-25,-16,-17,-24,-10,10,-6,3,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='H'; M=-6,-3,-17,-5,-3,-21,-11,10,-21,10,-20,-7,1,-16,-1,6,-5,-9,-13,-25,-7,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-12,2,-22,3,-1,-11,-20,-7,-9,-6,-1,-3,-3,-16,-4,-2,-6,1,-8,-22,-3,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-19,-21,-24,-20,36,-24,1,0,-17,2,3,-13,-25,-19,-13,-13,-7,-2,3,31,-19; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='K'; M=-9,6,-26,6,12,-27,-9,-3,-27,20,-25,-13,7,-11,12,15,-1,-7,-23,-24,-14,12; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-23,-1,6,-18,-16,-4,-11,-1,-11,-4,-1,-7,7,-5,0,-4,-13,-23,-8,6; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-8,1,-25,0,10,-25,-6,7,-22,3,-20,-9,4,-12,13,4,1,-6,-22,-24,-11,11; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: M=-2,-11,-22,-12,-8,-14,0,-6,-15,-6,-13,-7,-6,-13,-3,-2,-2,-7,-9,-21,-11,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-21,-24,-22,-17,-2,-27,-19,14,-14,14,8,-19,-22,-14,-8,-19,-9,10,-11,-2,-17; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-3,12,-17,17,12,-22,-6,0,-23,0,-23,-17,10,-8,3,-4,15,3,-17,-30,-15,8; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='T'; M=6,-8,-15,-12,-8,-14,-10,-16,-8,-1,-10,-6,-7,-7,-8,-4,2,8,1,-21,-12,-9; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='H'; M=-4,-7,-20,-7,-3,-16,-14,10,-15,0,-15,-7,-3,0,-1,4,-1,-3,-12,-23,-7,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='D'; M=-11,17,-29,26,25,-33,-4,5,-32,1,-25,-19,7,-9,12,-5,2,-10,-29,-31,-17,18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-23,-16,-24,-21,4,-26,-23,17,-22,19,8,-23,-26,-23,-20,-15,-5,22,-23,-5,-22;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-14,-28,-17,-17,8,-28,5,9,-15,3,4,-11,-24,-9,-14,-15,-10,0,-3,30,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-8,-4,-11,-3,-19,-18,-11,-16,0,-14,-9,-4,-17,1,6,1,1,-10,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='R'; M=-15,2,-29,7,17,-26,-20,-1,-25,14,-15,-10,0,-13,17,24,-7,-10,-22,-25,-12,15;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-14,-29,-25,2,-28,-23,24,-21,20,17,-27,-28,-23,-18,-14,0,32,-26,-6,-24;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='A'; M=9,-6,-15,-6,4,-17,-11,-13,-10,-3,-11,-9,-5,-12,-3,-8,8,2,-3,-27,-15,1; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=3,4,-23,7,14,-25,-12,-7,-20,1,-16,-13,-1,1,7,-5,0,-5,-18,-25,-17,10; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-18,-31,-23,15,-30,-22,20,-28,38,16,-29,-30,-24,-20,-25,-8,17,-19,1,-23;
MA   /M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25,40,-30,-20,13,-29,29,13,-24,-29,-28,-20,-24,-10,7,-6,14,-25;
MA   /M: SY='R'; M=0,-10,-25,-11,-6,-20,-5,-9,-18,3,-17,-9,-5,-6,-3,5,-3,-7,-13,-22,-13,-6;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-12,24,-27,29,11,-31,2,-3,-33,4,-28,-22,17,-13,0,-1,2,-8,-27,-33,-20,5;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-9,-27,-11,-7,2,-23,51,-18,-11,-9,0,-2,-22,1,-2,-12,-14,-20,-16,22,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-7,-36,1,16,-33,-20,-9,-23,-1,-26,-16,-10,47,12,-9,-6,-10,-30,-28,-23,11;
MA   /M: SY='D'; M=-15,26,-29,36,23,-27,-15,1,-27,0,-20,-20,11,-11,5,-7,-3,-9,-25,-31,-12,13;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21,15,-30,-20,19,-30,47,19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,9,-18,2,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-18,-28,-20,6,-29,-17,14,-19,19,10,-20,-25,-18,-13,-19,-9,11,-19,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-23,6,16,-22,-15,3,-17,-3,-11,-9,4,-12,8,-6,0,-6,-17,-29,-13,12;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-1,-29,1,17,-20,3,-7,-27,-2,-19,-13,-1,-12,4,-3,-4,-13,-26,-15,-15,11;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-29,-21,-36,-26,52,-30,-20,6,-27,19,6,-21,-29,-31,-16,-22,-10,3,-1,19,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-7,9,-25,5,8,-20,-9,-6,-17,3,-14,-11,11,-14,0,-2,-3,-5,-18,-29,-15,3;
MA   /M: SY='T'; M=4,2,-19,-3,3,-22,-13,-10,-17,8,-20,-11,4,-11,3,1,8,9,-11,-27,-14,3;
MA   /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-37,-29,66,-29,-21,0,-28,7,-1,-20,-29,-36,-19,-18,-6,2,11,25,-28;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-28,-18,12,-28,-15,12,-21,35,17,-25,-28,-16,-9,-26,-10,5,-16,5,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-18,-29,-14,-7,-20,-13,-20,-8,-12,-15,-10,-16,27,-12,-14,-7,-7,-8,-28,-21,-12;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-10,-27,-5,-3,-14,-20,-10,-11,-5,-12,-9,-12,17,-7,-7,-8,-6,-11,-20,-6,-7; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='G'; M=5,-3,-17,-2,-7,-26,8,-16,-24,-7,-23,-16,-3,-5,-10,-13,4,-6,-15,-28,-22,-9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=48(19); /POSITIVE=48(19); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=B_Cuche;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PAH;
CC   /VERSION=1;
DR   Q3T8J9   , GON4L_HUMAN, T; Q9DB00    , GON4L_MOUSE, T; 
DR Q535K8 , GON4L_RAT , T; Q09750 , PST1_SCHPO , T;
DR O13919 , PST2_SCHPO , T; O74755 , PST3_SCHPO , T;
DR Q96ST3 , SIN3A_HUMAN, T; Q60520 , SIN3A_MOUSE, T;
DR O75182 , SIN3B_HUMAN, T; Q62141 , SIN3B_MOUSE, T;
DR A5JYW9 , SIN3_CAEEL , T; P22579 , SIN3_YEAST , T;
DR Q9SRH9 , SNL1_ARATH , T; Q9LFQ3 , SNL2_ARATH , T;
DR O48686 , SNL3_ARATH , T; O04539 , SNL4_ARATH , T;
DR Q9XIE1 , SNL5_ARATH , T; Q9XIK6 , SNL6_ARATH , T;
DR Q9SZ67 , WRK19_ARATH, T;
3D 1E91; 1G1E; 1PD7; 1S5Q; 1S5R; 2CR7; 2CZY; 2F05; 2L9S; 2LD7; 2RMR; 2RMS; 3D 5Y95; 6XAW; 6XDJ; 7YI0; 7YI2; 7YI3; 7YI4; 7YI5; 8BPA; 8BPB; 8BPC; 8C60; 3D 8GA8; 8HPO; 8HXX; 8HXY; 8HY0; 8I02; 8I03; 8JHO; 8KC7; 8KD2; 8KD3; 8KD4; 3D 8KD5; 8KD6; 8KD7; PR PRU00810; DO PDOC51477; //