PROSITE logo

PROSITE entry PS51500

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   SIN; MATRIX.
AC   PS51500;
DT   01-JUL-2010 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Sin domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5733585; R2=0.0192588; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1617.7957764; R2=1.7957747; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=412; H_SCORE=2358; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=204; H_SCORE=1984; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: M=-12,-14,-22,-17,-6,-11,-26,-5,-4,-1,-2,-2,-8,-21,-6,-8,-10,-10,-3,-23,-4,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-9,-24,-12,2,-18,-22,-3,-14,3,-7,2,-1,-18,3,4,-3,-8,-13,-25,-14,2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,7,-24,4,4,-18,-12,-1,-23,3,-22,-14,12,-16,1,-5,3,-6,-20,-26,-8,2;
MA   /M: SY='K'; M=-9,1,-23,-3,2,-24,-17,-9,-20,9,-17,-7,8,-13,4,3,3,9,-14,-27,-19,3;
MA   /M: SY='N'; M=-12,0,-24,-4,2,-20,-19,-2,-16,2,-13,-2,6,-17,4,-1,-1,-8,-14,-28,-14,3;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-7,-23,-3,5,-14,-18,-11,-12,-2,-13,-7,-7,-16,-1,-11,-1,-4,-8,-23,-11,3;
MA   /M: SY='T'; M=-9,-4,-23,-1,1,-16,-20,-11,-19,1,-18,-10,-5,-4,-2,-8,0,3,-14,-23,-13,0;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-27,2,10,-26,-6,-2,-28,9,-25,-16,6,-13,5,-1,5,-5,-20,-29,-18,8;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,8,16,-25,-18,-7,-19,3,-20,-11,0,-13,13,-4,1,-7,-14,-30,-18,15;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-12,-29,-24,-5,-35,-26,18,-19,25,12,-22,-27,-19,-21,-17,-8,11,-25,-12,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,27,-29,44,18,-26,-15,-11,-23,-9,-30,-23,4,-12,-1,-18,-2,-10,-23,-37,-26,9;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-5,-29,-3,13,-25,-20,-7,-25,10,-20,-11,-6,1,11,-1,0,-9,-18,-26,-14,12;
MA   /M: SY='E'; M=-11,14,-39,25,46,-30,-19,-1,-30,7,-31,-21,1,-10,17,-3,0,-10,-21,-31,-21,36;
MA   /M: SY='W'; M=-30,-40,-20,-40,-30,10,-20,-20,-30,-30,-20,-10,-40,-40,-20,-30,-30,-20,-30,110,20,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-23,-15,-23,-13,-10,-30,-21,13,-11,6,7,-20,-21,-10,-15,-13,-4,15,-25,-9,-12;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-7,-15,-4,0,-21,-17,-15,-12,-6,-11,-7,-10,-17,1,-10,-4,-6,-8,-26,-18,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-39,-10,-39,-30,0,-40,-30,22,-21,38,19,-30,-30,-21,-21,-20,-10,12,-21,-10,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-32,-10,-32,-26,-2,-36,-28,28,-22,22,20,-28,-26,-20,-24,-18,-8,24,-24,-10,-24;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-15,-20,-18,-2,-20,-23,-14,-12,9,-1,2,-12,-16,9,3,-6,-8,-8,-25,-14,0;
MA   /M: SY='E'; M=-11,8,-37,16,39,-27,-20,3,-28,9,-27,-16,0,-11,16,-1,-1,-11,-19,-29,-18,32;
MA   /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-17,-21,-22,-8,-17,-27,-13,-7,9,0,8,-11,-20,2,11,-10,-10,-7,-24,-15,-5;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-28,4,11,-26,-13,-5,-24,13,-23,-15,4,-13,3,1,1,-6,-19,-30,-19,8;
MA   /M: SY='M'; M=2,-19,-14,-18,-7,-14,-21,-18,-1,-8,3,6,-15,-17,1,-11,-2,-5,1,-24,-14,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-7,-30,-9,-19,-30,56,-18,-39,-19,-39,-29,4,-20,-19,-19,1,-19,-30,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-34,-10,-34,-27,-2,-37,-29,27,-22,26,17,-29,-27,-21,-24,-19,-8,23,-24,-10,-26;
MA   /M: SY='S'; M=5,-5,-12,-6,-3,-20,-10,-8,-17,-4,-16,-10,4,-11,-1,-8,21,21,-12,-25,-17,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-19,-18,-23,-12,-16,-28,-21,2,5,3,1,-18,-14,-10,-8,-10,-8,4,-29,-16,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-12,14,-35,21,32,-30,-13,-3,-31,6,-31,-20,5,-11,16,-3,1,-10,-23,-31,-21,26;
MA   /M: SY='E'; M=-13,16,-36,28,38,-30,-17,-3,-30,5,-31,-20,3,-10,19,-4,0,-10,-23,-31,-21,31;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-13,-30,-25,11,-32,-25,25,-25,10,7,-30,-28,-25,-30,-20,-8,25,-20,0,-25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-9,-27,-14,4,-26,-21,-6,-22,16,-15,-8,-3,-18,6,27,-5,-9,-21,-29,-19,2;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-28,-3,14,-20,-19,7,-23,6,-21,-13,0,-15,8,6,0,-9,-19,-25,-8,12;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-30,-27,52,-30,-2,-3,-27,-3,-3,-27,-37,-25,-27,-20,-20,-10,13,41,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-36,-12,-36,-29,9,-37,-26,16,-22,29,14,-28,-31,-22,-22,-18,-8,7,-15,-4,-29;
MA   /M: SY='E'; M=-10,3,-26,0,7,-24,-17,-2,-22,7,-18,-9,5,-15,6,5,-2,-7,-19,-29,-17,6;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-16,-18,-18,-13,-6,-11,-12,-13,-9,-9,-6,-8,-21,-10,-6,2,0,-13,-18,-7,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-6,0,-23,-1,4,-21,-11,-2,-19,-1,-18,-6,5,-15,5,-5,4,-7,-15,-27,-15,5;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-9,8,-30,-19,-2,-30,32,-22,-12,2,-7,9,19,-3,-10,-23,-30,-18,8;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=6(6); /POSITIVE=6(6); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Sin;
CC   /VERSION=4;
DR   P22755   , SINI_BACLI , T; P23308    , SINI_BACSU , T; 
DR P22753 , SINR_BACLI , T; P06533 , SINR_BACSU , T;
DR P0C8M5 , SLRA_BACSU , T; P71049 , SLRR_BACSU , T;
3D 1B0N; 2YAL; 3ZKC; 5TMX; 5TN2; PR PRU00833; DO PDOC51500; //