PROSITE logo

PROSITE entry PS51644

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   HTH_OST; MATRIX.
AC   PS51644;
DT   01-MAY-2012 CREATED; 01-MAY-2012 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   OST-type HTH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=74;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=74;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0157390; R2=0.0071836; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1098; N_SCORE=9.9; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=653; N_SCORE=6.7; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-33; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='S'; M=7,-38,25,11,-42,-49,-47,6,-4,-14,-17,-6,11,26,-8,35,-12,-1,-66,-64;
MA   /M: SY='L'; M=-30,-33,28,-44,-37,-89,-142,11,11,39,10,-9,38,-25,3,-9,-14,-6,-61,-72;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-75,26,48,-80,-66,-47,-49,29,-104,-36,5,15,16,27,24,-11,-30,-61,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-64,37,47,-33,-60,-25,-16,19,-10,-35,-23,-18,27,16,-24,-1,-20,-22,-35;
MA   /M: SY='L'; M=3,0,-97,-80,48,-157,-151,26,-152,54,-56,-154,-2,-150,-111,-93,-46,44,-64,-57;
MA   /M: SY='K'; M=8,-54,-48,8,-55,-57,-10,11,47,-7,-13,-136,-41,21,26,-2,9,12,-37,-103;
MA   /M: SY='R'; M=17,-13,6,23,-33,-41,-20,-50,31,-37,-35,22,-6,22,39,16,-13,-83,-155,-42;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-56,-6,39,-17,-52,-18,-10,-2,28,20,-13,-147,44,17,-96,-13,-10,-34,-25;
MA   /M: SY='I'; M=-47,-46,-161,-155,-31,-162,-153,67,-110,59,24,-155,-156,-150,-74,-148,-28,41,-152,-133;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-8,-52,0,-57,-72,11,-8,30,5,-52,-48,-75,27,63,-38,-5,10,-151,5;
MA   /M: SY='E'; M=18,-151,27,44,-85,-50,-44,-102,37,-45,-35,7,-77,30,14,33,-11,-98,-69,-66;
MA   /M: SY='L'; M=32,-11,-95,-88,-45,-78,-150,47,-150,59,-7,-66,-153,-77,-151,-23,-27,21,-153,-136;
MA   /M: SY='L'; M=-42,-15,-159,-109,-22,-160,-86,41,-110,72,0,-155,-95,-148,-89,-47,-35,35,-18,-55;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-25,24,32,-81,-42,-33,-11,27,-20,-8,8,-103,27,23,20,6,-9,-39,-142;
MA   /I: I=-25; MI=0; MD=-63; IM=0; DM=-63;
MA   /M: SY='S'; M=20,-45,-4,25,-87,-38,-19,-65,19,-32,6,-7,-83,28,-11,59,-4,-54,-33,-27;
MA   /M: SY='H'; M=14,-7,42,6,-15,-34,62,-100,-15,-92,-43,36,-147,9,6,12,-30,-78,-18,50;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-31,49,29,-157,-11,-5,-154,30,-125,-45,8,69,-3,-24,20,-39,-81,-159,-62;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-38,55,29,-153,32,-6,-120,-21,-85,-87,55,-48,-2,-15,36,-37,-152,-159,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-63,14,-52,-49,-64,86,-60,-111,-6,-124,-147,-87,32,-21,-14,-6,-19,-40,-4,-99;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='W'; M=-48,-55,-160,-153,-19,-121,-153,47,-150,30,49,-154,-65,-77,-152,-41,-12,52,100,-10;
MA   /M: SY='W'; M=24,-48,-14,-43,0,-54,-24,-69,-36,7,-85,18,46,-23,-22,27,19,-63,84,-23;
MA   /M: SY='L'; M=5,7,-95,-86,7,-60,2,16,-75,59,41,-9,-24,-57,-78,-11,-136,9,-149,-9;
MA   /M: SY='S'; M=11,-85,-11,-27,-25,11,25,-63,-27,15,-51,-13,-44,-49,-42,72,-15,-58,-28,-60;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='Q'; M=14,-37,25,33,-105,-31,-2,-49,19,-41,5,15,-59,48,24,11,-16,-41,-78,-50;
MA   /M: SY='L'; M=-81,-65,-117,-156,53,-162,-151,39,-155,68,-83,-157,-159,-152,-154,-109,-84,41,-144,-64;
MA   /M: SY='P'; M=-27,-48,-46,8,-110,51,-35,-33,36,-25,-41,-26,62,-7,-1,-25,-37,-48,-57,-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-92,17,6,-70,-22,-61,-73,23,-65,-65,38,-7,59,9,40,7,-55,-157,-62;
MA   /M: SY='D'; M=13,-11,30,27,-21,-119,23,-7,-29,18,22,-17,-148,21,2,-34,-8,-23,-18,25;
MA   /M: SY='Y'; M=-94,-153,-155,-154,46,-158,-21,29,-149,35,40,-75,-159,-145,-147,-147,-106,-39,-62,106;
MA   /M: SY='K'; M=-27,-43,-99,8,-35,-32,26,-18,46,-12,-11,-4,-119,37,45,12,-7,-30,-151,-2;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-153,13,21,-101,-84,-7,-112,62,-47,-25,30,-144,32,50,1,-44,-62,-15,-55;
MA   /M: SY='K'; M=-20,-15,-139,-2,-44,-116,37,-8,44,14,35,-13,-147,30,36,-46,11,-9,-31,-35;
MA   /M: SY='Y'; M=-65,-13,21,-11,68,-110,29,-28,-17,-45,-5,-22,-107,7,-30,-19,3,-40,-35,78;
MA   /M: SY='P'; M=-45,-155,-60,-63,-112,66,-16,-87,11,-109,-90,6,78,-37,-22,17,-46,-64,-155,-69;
MA   /I: I=-26; MD=-67;
MA   /M: SY='E'; M=-61,-17,-59,34,-39,-77,17,-112,18,-80,-62,-51,-80,-3,28,-37,-37,-33,-167,17; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67;
MA   /M: SY='D'; M=-18,-86,55,10,-82,-11,-2,-71,-13,-90,-148,-2,55,28,-52,25,-6,-38,-17,-148; D=-26;
MA   /I: I=-26; DM=-67;
MA   /M: SY='F'; M=-83,8,-163,-157,95,-161,-148,16,-155,57,-2,-100,-81,-156,-113,-152,-142,-33,17,-113;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-15,82,-22,-156,-64,4,-97,-17,-84,-36,40,63,-27,3,8,-85,-48,-164,-39;
MA   /M: SY='P'; M=-20,-43,-97,23,11,-100,19,-29,-65,-1,-46,-67,74,-25,-87,-1,-15,27,-19,36;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-53,-3,-19,-99,-25,29,-82,37,-76,-43,-24,-98,17,76,21,-6,-46,-155,-28;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-151,41,13,-37,-20,6,-44,6,-39,-87,56,-56,20,-5,6,2,-11,29,-15;
MA   /I: I=-19; MD=-49;
MA   /M: SY='Y'; M=-150,-34,-114,-154,53,-121,19,-66,-150,38,-33,-85,-163,-90,-89,-62,-144,-79,-25,108; D=-19;
MA   /I: I=-19; MD=-49;
MA   /M: SY='G'; M=-134,-160,-61,-75,-165,100,-47,-171,-69,-93,-157,-46,-94,-42,-157,-90,-115,-123,-158,-160; D=-19;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
MA   /M: SY='Y'; M=-44,35,-158,-117,78,-60,32,-108,-96,-74,-135,-107,-165,-84,-80,-49,-89,-6,-49,94; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='S'; M=-6,15,-8,-43,-87,-55,-74,-67,36,-50,-28,8,3,-7,23,40,10,-29,-56,7; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='K'; M=-70,-66,0,-63,-83,-49,-36,-155,70,-112,-147,21,-34,-9,18,54,17,-116,-160,-97; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='L'; M=-53,-60,-162,-156,51,-162,-92,1,-155,74,37,-67,-57,-96,-108,-116,-25,-14,-52,-97; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='S'; M=-25,-150,-16,27,-31,-19,-74,-4,-13,-13,4,-29,-60,13,-11,59,25,-25,-71,-74; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-53,73,54,-105,-68,25,-154,5,-84,-45,-5,-12,16,-18,16,-6,-73,-162,-71;
MA   /M: SY='L'; M=-60,-147,-108,-153,69,-120,-144,-15,-152,74,46,-58,-159,-38,-151,-113,-66,-31,-139,-25;
MA   /M: SY='L'; M=-47,-58,-161,-91,11,-162,-151,52,-111,67,18,-156,-157,-150,-153,-149,-65,41,-150,-130;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-61,6,44,-41,-20,-25,-61,40,-32,-33,-6,-78,38,41,16,-33,-52,-155,-142;
MA   /M: SY='S'; M=43,-11,23,6,-85,-58,-7,-32,22,-36,-47,-7,-144,-34,-13,54,-4,-80,6,-45;
MA   /M: SY='M'; M=-4,5,-55,-35,-4,-118,-18,40,-71,39,67,-61,-76,-22,-40,-28,13,-3,24,0;
MA   /I: I=-23; MD=-58;
MA   /M: SY='P'; M=-14,-30,-15,-21,-163,-33,-15,-91,2,-59,-39,-32,83,2,-23,21,-20,-66,-166,-157; D=-23;
MA   /I: I=-23; MI=0; MD=-58; IM=0; DM=-58;
MA   /M: SY='D'; M=-76,-85,82,15,-24,22,34,-163,-21,-131,-90,32,-82,-19,-31,-27,-47,-160,-167,-39; D=-23;
MA   /I: I=-23; DM=-58;
MA   /M: SY='I'; M=-27,-149,-38,-34,-7,-18,-19,41,-27,24,-10,-15,-53,-33,-35,-40,20,41,-28,19;
MA   /M: SY='V'; M=-29,53,-65,-52,59,-53,-150,16,-73,13,-33,-51,-66,-151,-64,-80,-52,64,-146,1;
MA   /M: SY='E'; M=-34,-61,12,56,-68,-68,21,-21,19,-38,-60,-78,-143,28,25,-1,26,9,-9,-51;
MA   /M: SY='I'; M=-73,-64,-92,-78,0,-120,-70,56,-110,35,22,-79,-48,-147,-3,-88,12,56,-58,-66;
MA   /M: SY='E'; M=-52,-47,7,48,-111,-64,16,-8,34,-63,-19,-26,-70,39,14,-2,9,9,-38,8;
MA   /M: SY='Q'; M=-79,4,22,22,-36,0,3,-29,25,-72,-48,10,-14,31,30,2,4,-24,24,7;
MA   /M: SY='P'; M=-46,-34,31,16,-49,8,-4,-18,16,-32,-38,0,34,17,10,14,-17,-11,-32,-20;
MA   /I: I=-29; MD=-75;
MA   /M: SY='P'; M=-46,-85,2,27,-53,33,-9,-67,-21,-32,-50,29,42,-34,16,-5,-11,-71,-161,-57; D=-29;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
MA   /M: SY='G'; M=-22,-54,26,3,-113,43,13,-114,21,-91,-3,28,19,-10,-17,33,-5,-150,-158,-40;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-152,5,-10,-28,50,2,-150,21,-103,-20,40,-27,34,-9,14,-5,-28,-155,-47;
MA   /M: SY='Q'; M=-27,-84,23,5,-115,-20,32,1,3,-44,-39,36,-7,50,11,-8,21,-9,-18,-141;
MA   /M: SY='W'; M=-9,28,-109,-64,7,-78,0,24,6,9,-6,-68,-12,-143,-14,-74,-12,39,74,35;
MA   /M: SY='Y'; M=-53,-24,-79,-36,20,-105,26,27,-23,16,34,-145,-71,-7,5,-24,-3,28,30,49;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-22,-107,-150,-33,-101,-49,51,-95,22,-41,-151,-43,-9,-30,-36,-43,69,-155,-35;
MA   /M: SY='Y'; M=-33,8,-26,-57,16,-43,15,-18,16,0,-133,-35,-103,-13,52,16,-15,-20,-14,52;
MA   /M: SY='P'; M=15,-97,2,-24,-61,-41,1,16,-32,34,-10,-29,44,-39,-5,-24,-16,4,-10,-78;
MA   /M: SY='K'; M=3,-7,-40,-32,-45,-83,0,-30,57,-43,-48,8,14,-7,36,5,-22,6,-58,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-16,-61,27,22,-107,-8,-61,-94,27,-46,-30,13,31,-53,15,17,0,-15,-22,-15;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=117(33); /POSITIVE=117(33); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=8;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH OST-type;
CC   /VERSION=1;
DR   Q9SJ41   , C3H18_ARATH, T; Q84ZT0    , C3H51_ORYSJ, T; 
DR Q6ZK57 , C3H54_ORYSJ, T; C6KSS5 , LRR2_PLAF7 , T;
DR E1BP74 , MARF1_BOVIN, T; E1BZ85 , MARF1_CHICK, T;
DR Q9Y4F3 , MARF1_HUMAN, T; Q8BJ34 , MARF1_MOUSE, T;
DR Q8VIG2 , MARF1_RAT , T; B2GUN4 , MARF1_XENTR, T;
DR P25158 , OSKA_DROME , T; Q24741 , OSKA_DROVI , T;
DR D2H3M0 , TDRD5_AILME, T; E1BPH3 , TDRD5_BOVIN, T;
DR E2QTD3 , TDRD5_CANLF, T; Q1L981 , TDRD5_DANRE, T;
DR Q8NAT2 , TDRD5_HUMAN, T; Q5VCS6 , TDRD5_MOUSE, T;
DR B4F7C4 , TDRD5_RAT , T; A1L1H3 , TDRD5_XENLA, T;
DR A0JM98 , TDRD5_XENTR, T; D2H0H6 , TDRD7_AILME, T;
DR A6QLE1 , TDRD7_BOVIN, T; E2RDV1 , TDRD7_CANLF, T;
DR E1C3S7 , TDRD7_CHICK, T; Q8NHU6 , TDRD7_HUMAN, T;
DR Q8K1H1 , TDRD7_MOUSE, T; Q5RAH6 , TDRD7_PONAB, T;
DR Q9R1R4 , TDRD7_RAT , T; Q6NU04 , TDRD7_XENLA, T;
DR Q5M7P8 , TDRD7_XENTR, T; A6NAF9 , TRD7A_DANRE, T;
DR E7FDW8 , TRD7B_DANRE, T;
3D 2LH9; 2LY1; 2LY2; 3RCO; 3S93; 5A48; 5A49; 5CD7; 5CD8; 5NT7; 5YAD; PR PRU00975; DO PDOC51644; //