PROSITE logo

PROSITE entry PS51702

View entry in NiceSite format
View entry in raw text format (no links)
ID   HTH_MU; MATRIX.
AC   PS51702;
DT   01-JAN-2014 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Mu-type HTH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2966406; R2=0.0093798; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10213.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=662; H_SCORE=10213; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=449; H_SCORE=10213; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-87; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='M'; M=-19,-61,-8,44,-13,-106,-72,-15,-2,-49,99,8,-43,-23,-36,-4,25,-7,-255,-236;
MA   /M: SY='W'; M=-61,-256,-42,-36,-77,-39,61,-248,58,-26,-19,0,-85,18,5,11,-38,-249,115,16;
MA   /M: SY='E'; M=-49,-22,22,69,45,-64,-39,-3,-235,-8,22,-239,-71,1,-103,-85,-27,-57,42,53;
MA   /M: SY='W'; M=7,-255,-80,-68,-73,-110,-254,-246,-82,-66,-245,-43,-61,-239,-64,47,46,-247,154,-60;
MA   /M: SY='Y'; M=38,-39,-255,-250,58,-251,-78,21,-249,24,-39,-250,-16,-247,-249,-74,-108,35,-235,63;
MA   /M: SY='T'; M=35,-243,-236,-42,-247,-94,-241,-104,-14,-39,-40,-51,-12,13,-56,49,85,-43,-259,-243;
MA   /M: SY='E'; M=69,-31,-43,74,-252,-239,-241,-79,-69,-85,-240,-236,4,-227,-239,-32,23,-3,-257,-248;
MA   /M: SY='Q'; M=-22,-251,-69,-58,-59,-89,-237,7,60,47,-21,-29,-248,65,-16,3,-64,-110,-250,-237;
MA   /M: SY='E'; M=45,-251,34,86,-252,-96,-236,-243,-58,-1,-239,-234,-240,23,-76,-89,-235,-16,-257,-246;
MA   /M: SY='L'; M=12,57,-2,24,-60,-30,-244,22,-25,60,-71,-73,-251,-6,-244,-40,-236,-43,-253,-238;
MA   /M: SY='A'; M=61,-244,-250,-19,-3,-245,-63,-4,-91,42,57,-246,-249,-240,-46,-48,-8,18,-251,-235;
MA   /M: SY='G'; M=-11,-63,18,20,-89,71,20,-258,15,-256,-246,10,-32,26,2,-35,-53,-76,-256,-246;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-14,-257,-250,-66,-257,-246,16,-39,80,13,-253,-55,-52,-55,-47,-74,5,-250,-51;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-257,14,-9,-69,-10,-39,-33,-63,6,-3,-87,100,-8,-64,-10,-26,-69,-256,-247;
MA   /M: SY='G'; M=-230,26,16,0,-256,91,-57,-87,-11,-256,-32,2,-245,-238,-245,-12,-50,-47,-255,-61;
MA   /M: SY='M'; M=-241,-247,-261,-253,43,-260,-245,3,-76,68,87,-254,-257,-50,-249,-250,-74,28,-245,-225;
MA   /M: SY='P'; M=-51,-261,-242,-233,-259,-60,-34,-250,-239,-102,-246,-243,125,-240,-250,32,-10,-252,-257,-255;
MA   /M: SY='T'; M=-21,-55,1,-15,-249,20,-20,-68,20,-58,-39,32,-244,-23,15,44,51,-20,-5,-243;
MA   /I: I=-28; MD=-71;
MA   /M: SY='T'; M=-10,-250,-5,-63,-254,-57,-17,-250,-25,-62,-247,-66,-247,-79,-51,59,82,-243,-266,-33; D=-28;
MA   /I: I=-28; MD=-71;
MA   /M: SY='P'; M=13,-261,2,26,-256,-79,-14,-8,26,-62,-45,-73,37,0,-4,-58,-54,16,-264,-54; D=-28;
MA   /I: I=-28; MI=-71; IM=-71; DM=-71;
MA   /M: SY='Q'; M=-27,-254,-52,-225,-66,-106,-49,-90,30,-249,-22,-19,-3,78,77,25,6,-83,-254,-240;
MA   /M: SY='G'; M=31,-248,-236,-243,-56,80,-240,-255,-57,-255,-43,55,-246,-236,11,-6,-3,-249,-21,-248;
MA   /M: SY='I'; M=-43,-6,-260,-256,-228,-261,-258,81,-253,5,12,-253,-254,-251,-255,-246,-40,72,-12,-59;
MA   /M: SY='R'; M=-46,-252,-29,5,-246,-87,58,-7,-88,-9,-43,44,-247,38,67,3,25,-70,-258,-61;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-254,7,3,-47,-96,0,-15,55,1,-42,0,-247,29,57,-43,-93,-99,-248,25;
MA   /M: SY='R'; M=-76,-67,-240,-83,-4,-251,49,-57,58,-27,47,-61,-249,13,84,-109,-239,-38,-250,-18;
MA   /M: SY='A'; M=99,-240,-248,-241,-64,-87,-247,-9,-243,21,-230,-243,-246,-239,-246,-224,-231,-82,-252,-243;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-252,8,32,-254,-39,-29,-251,74,-68,-242,30,-242,19,35,-31,-5,-50,-256,-244;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-253,-65,10,-252,-247,-47,-101,65,-64,-240,12,-245,-10,84,-36,-19,-30,-254,-242;
MA   /M: SY='E'; M=-52,-254,6,92,-46,-85,-10,-248,-66,3,-239,25,-240,40,-232,-8,-235,-94,-17,-1;
MA   /M: SY='G'; M=19,-78,-43,-50,-69,72,-21,-255,-30,-256,-247,68,-246,-7,-87,30,-232,-78,-14,-72;
MA   /M: SY='W'; M=-62,-271,-267,-18,-222,-47,-48,-248,-246,-99,-249,-263,-254,-245,-73,-23,-71,-51,179,-209;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-253,-25,20,-251,-14,-234,-62,18,-18,-34,29,40,73,18,-55,13,-50,-254,-64;
MA   /M: SY='K'; M=-13,37,-29,-33,44,-48,23,-245,51,-86,-13,29,-248,-62,12,27,0,-243,23,27;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
MA   /M: SY='R'; M=-56,-259,-238,-5,-253,-252,-45,-86,-25,-95,-240,-233,-250,32,116,-76,-241,-60,-253,-240;
MA   /M: SY='K'; M=-48,-37,-38,28,-254,-247,-56,-44,75,-58,-32,-19,28,51,50,-49,-103,-83,-253,-243;
MA   /M: SY='R'; M=-43,-43,-62,-29,-249,-252,-235,-40,20,-93,-236,-91,-82,-10,104,-76,-51,31,-255,-240;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='E'; M=26,-252,-13,38,-35,-46,-37,-79,21,-114,-36,-86,36,33,3,16,18,-19,-256,-62; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='G'; M=-9,20,-244,-251,-260,99,-249,-265,-21,-262,-252,-231,-248,-74,-35,-40,-74,-106,-255,-255; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-50;
MA   /M: SY='R'; M=-71,-264,-252,-242,-257,-48,-40,-32,34,-89,-64,-85,-17,-2,78,-49,-37,28,-265,-251; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
MA   /M: SY='G'; M=-88,-27,-240,-248,-56,99,-34,-259,-38,-96,-248,-227,-245,-241,-249,15,16,-87,-252,-250;
MA   /M: SY='G'; M=-233,-254,-238,-30,-254,74,-6,-40,68,-252,-243,-45,-8,-230,24,-100,-67,-5,-253,-246;
MA   /M: SY='G'; M=53,-247,-242,-242,-253,74,-244,-85,-51,-74,-242,-80,-245,-5,15,-2,-7,-12,-253,-248;
MA   /M: SY='F'; M=-242,-43,-72,-57,61,-254,-15,-2,26,-6,-2,7,-253,-237,40,-87,-28,24,55,47;
MA   /M: SY='E'; M=-46,-256,-213,115,-83,-253,-232,-252,-54,-6,-243,-236,-235,-214,-36,-235,-238,-107,-255,-52;
MA   /M: SY='Y'; M=-249,-258,-252,-252,46,-255,-220,-233,-245,-85,-228,-251,-261,-242,-242,-245,-244,-87,75,135;
MA   /I: I=-24; MD=-61;
MA   /M: SY='H'; M=16,-76,-42,-48,-243,-247,132,-52,-101,-4,-232,-19,-22,-74,-26,-24,-87,-83,-266,-8; D=-24;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='I'; M=-35,-252,-260,-256,30,-261,-44,71,-251,23,-23,-52,-79,-250,-46,-84,-81,44,31,24; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-61;
MA   /M: SY='S'; M=18,-55,25,-41,-252,-63,-38,-250,-44,-115,-42,33,-62,-10,-24,80,20,-86,-33,-40; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-61;
MA   /M: SY='S'; M=5,24,-2,-238,-241,-105,-240,-18,-239,10,-18,5,-247,-234,-243,89,-222,20,-258,-56;
MA   /M: SY='L'; M=-83,-247,-262,-254,52,-261,-244,-42,-253,86,63,-257,-32,-248,-251,-252,-240,-219,-242,-223;
MA   /M: SY='P'; M=-242,-267,-80,-232,-263,-81,-40,-251,-67,-261,-247,-248,133,-242,-251,-35,-235,-256,-257,-259;
MA   /M: SY='E'; M=28,-251,-17,56,-247,-71,-21,-20,7,-16,-4,-9,34,30,-52,-18,-3,-7,-255,-37;
MA   /M: SY='E'; M=19,-251,28,71,-250,-59,-2,-37,-21,-65,-39,-16,-2,-22,-9,20,-13,-4,-257,-34;
MA   /M: SY='T'; M=54,-243,-80,-78,-238,-244,-249,35,-242,-24,-3,-239,-245,-15,-246,-58,67,40,-5,-46;
MA   /M: SY='Q'; M=-90,-258,-80,-92,-36,-86,-44,-51,14,-43,-39,-84,-248,101,86,-87,-239,-47,-251,-237;
MA   /M: SY='A'; M=57,-247,-3,23,-249,-104,-30,-106,-10,-5,-27,-15,-244,49,1,17,13,-27,-256,-243;
MA   /M: SY='A'; M=68,-248,-57,41,-35,-88,-3,-24,-5,-62,-40,-84,-80,31,19,-20,-66,-49,-249,9;
MA   /M: SY='L'; M=-243,-249,-261,-255,-12,-264,-248,66,-253,75,-36,-257,-257,-249,-66,-251,-88,-4,-245,13;
MA   /M: SY='R'; M=27,-249,-80,-8,-238,1,-241,18,-38,33,30,-17,-249,-28,44,-19,-5,-10,-20,-66;
MA   /M: SY='E'; M=24,-250,-29,38,-4,1,-45,-36,34,11,0,-14,-50,-8,4,-14,-61,-4,-35,-58;
MA   /M: SY='R'; M=16,-76,-30,-29,-85,-35,47,-32,37,-49,-11,9,-36,30,62,9,-9,-107,-255,-70;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-251,-20,45,9,-48,32,-58,-23,-5,22,-9,-54,53,-4,-27,-1,-31,-248,17;
MA   /M: SY='A'; M=31,-248,-28,18,-240,23,-51,-2,-9,13,-7,-34,-26,-8,-24,10,-11,3,-251,5;
MA   /M: SY='Q'; M=34,-249,-12,1,-249,-27,-238,-20,26,-5,-235,-38,12,49,21,9,24,-43,-255,-243;
MA   /M: SY='Q'; M=29,-250,-37,32,-98,-41,-11,8,-7,-62,-23,1,13,55,-27,-1,15,11,-54,-73;
MA   /M: SY='A'; M=49,-248,-21,26,-244,-61,2,-16,-6,11,-40,-3,34,-3,-94,-14,-12,11,-256,-91;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=4(4); /POSITIVE=4(4); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=?B?P?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH Mu-type;
CC   /VERSION=3;
DR   P07040   , REPC_BPD10 , T; P06019    , REPC_BPMU  , T; 
DR P07636 , TNPA_BPMU , T; O05069 , TRA_HAEIN , T;
3D 1G4D; 1QPM; 1TNS; 1TNT; PR PRU01039; DO PDOC51702; //