PROSITE entry PS51613
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SAM_MT_RRMJ |
| Accession [info] | PS51613 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2011 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51555 |
| Associated ProRule [info] | PRU00945 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RrmJ-type ribose 2'-O-methyltransferase (EC 2.1.1.57) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=203; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=198; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.9052601; R2=0.0044625; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=43736.9023438; R2=4.5154319; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2487; H_SCORE=54967; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=582; H_SCORE=46365; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-125; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='I'; M= 42,-178,-171,-168,-171,-173, 59, 61,-169, -13,-158, 24,-176, 44,-172, 6, 36,-153,-187,-167; /M: SY='F'; M=-180,-182,-186,-178, 117,-188,-171,-164, 7,-156,-162,-176,-189,-176, 61,-177,-174,-167,-155,-135; /M: SY='M'; M=-170,-184,-176,-166,-169,-182, 59, 46,-156, -10, 88,-167,-179, 58, 65, 6,-167,-157,-184,-162; /M: SY='N'; M=-170,-178,-150,-164,-184,-163,-156,-182,-155,-188,-176, 120, 45,-159, 27,-154, 28,-182,-198,-179; /M: SY='R'; M=-175,-191,-171,-159,-183,-185,-160,-190,-131,-182,-171,-164,-183,-147, 127,-169,-173,-184,-183,-170; /M: SY='A'; M= 99, 96,-178,-171,-182,-161,-179,-175,-173,-175,-170,-171,-178,-171,-178,-153,-161,-162,-188,-181; /M: SY='W'; M= 92,-177,-181,-173,-173, 20,-183,-177,-173,-177,-173,-174,-177,-170,-177,-156,-167,-168, 121,-165; /M: SY='H'; M=-168,-179,-177,-173,-164,-185, 93,-149,-166, 23, 74,-169,-181,-166, 36,-169, 26, 57,-191,-160; /M: SY='K'; M=-170,-184,-162,-149,-186,-177,-166,-187, 121,-186,-173,-155,-170,-147,-131,-164,-165,-182,-180,-173; /M: SY='M'; M=-171,-177,-189,-182,-154,-188,-170, 21,-178, 63, 122,-181,-182,-172,-177,-177, 13,-146,-181,-160; /M: SY='A'; M= 92,-173,-174,-166,-176,-164, 67,-170, 21, 11,-163,-167,-176,-164,-167,-155,-163,-162,-185,-170; /M: SY='N'; M= 9,-179,-143, 83,-187,-166,-156,-186,-154,-186,-178, 106,-172,-151,-163,-156,-160,-182,-194,-180; /M: SY='I'; M=-170,-178,-188,-184,-156,-192,-182, 78,-182, 54, 44,-181,-183,-178,-183,-175, 35, 16,-183,-164; /M: SY='D'; M=-174,-186, 120,-143,-188,-172,-160,-183,-163,-180, 66, 24,-175,-162,-170,-164,-164,-183,-206,-175; /M: SY='A'; M= 71,-178,-160, 56,-185,-169, 56,-182, 67,-180,-171,-162,-171,-153,-154,-157,-164,-173,-185,-173; /M: SY='I'; M= 38,-178,-177,-168,-170,-179,-176, 43, 30, -2,-157,-170,-178, 27, 27,-163, 26, 36,-185,-170; /M: SY='F'; M= 6, 49,-192,-187, 118,-186,-178,-154,-184,-151,-159,-182,-191,-191,-183,-176,-171, 22,-157,-136; /M: SY='N'; M=-165,-182, 50, 20,-187, 62, 68,-191,-164,-189,-179, 75,-175,-160,-170, 5,-164,-188,-194,-174; /M: SY='W'; M=-175,-181,-193,-185, 66,-190,-182, 17,-184, 62,-148,-189, 20,-183,-184,-182,-171, 23, 87,-150; /I: I=-3; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='K'; M= 43,-188,-181,-170,-189,-182,-180,-175, 58,-179, 44,-174,-184, 44,-165,-169, 12, 12,-194,-182; D=-3; /I: I=-3; DM=-8; /M: SY='T'; M=-185,-194, 46,-178,-188,-192,-185,-181,-184, 25,-178, 21, 33,-185,-191,-175, 60,-181,-209,-189; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='H'; M= 7,-198,-175, 46,-200, -3, 47,-200, 6,-196,-188,-176,-187,-169, 35,-174, 26,-193,-204,-188; D=-3; /I: I=-3; DM=-8; /M: SY='C'; M= 42, 96,-173, 7,-178,-173, 58,-171,-172, -13,-167,-169, 58,-169,-176, 21,-163, 0,-192,-175; /M: SY='R'; M=-170,-186, 72, 38,-188,-174,-161,-190, 29,-186,-179, 21,-175,-151, 76, 19,-164,-184,-191,-175; /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='D'; M=-170,-186, 82, 9,-190, 20, 68,-190,-159,-186,-177, 59,-175, 71,-163,-159,-166,-189,-196,-172; /M: SY='V'; M=-166,-177,-178, 21, 29,-189,-177, 6,-176, 27,-151,-178,-182,-175,-178,-170, 35, 72,-177, 31; /M: SY='F'; M=-175,-180, 38,-175, 87,-188,-173, 16,-172, 18, 60,-175,-186,-176, 27,-177,-169, 12,-169,-147; /M: SY='Y'; M=-171,-179,-176,-178, 17,-184,-161, 17,-173, 2,-156,-171,-181,-172,-175,-162, 80,-157,-156, 107; /M: SY='F'; M= 7,-179,-191,-187, 123,-185,-171,-158,-183,-151,-159,-182,-191,-190,-181,-177,-173,-162,-149, 46; /M: SY='A'; M= 68, 59,-182,-177,-170, 8,-183,-150,-177, 11,-158,-176,-182,-176,-181,-162,-162, 65,-188,-174; /M: SY='D'; M=-175,-189, 129,-138,-196,-172,-161,-194,-162,-192,-191,-143,-174,-162,-171,-163,-165,-191,-211,-178; /M: SY='V'; M=-167,-178,-192,-187,-157,-194,-189, 71,-184, 36,-144,-186,-186,-183,-186,-178,-163, 80,-186,-166; /M: SY='C'; M=-170, 157,-189,-189, 33,-185,-187,-182,-185,-173,-174,-176,-199,-193,-190,-172,-169,-172,-197,-177; /M: SY='G'; M= 76,-176,-173,-175,-187, 84,-178,-184,-174,-184,-176,-163,-175,-171,-180,-153,-167,-174,-182,-182; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='P'; M=-174,-199,-174,-163,-194,-176,-177,-181,-170,-192,-178,-181, 136,-174,-183,-171,-166,-187,-187,-191; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='G'; M= 18,-183,-166, 31,-190, 94,-173,-192,-168,-188,-179,-160,-174, 43,-175,-156,-172,-185,-182,-182; /M: SY='F'; M=-182, 62,-195,-191, 128,-190,-176,-159,-186,-150,-160,-183,-194,-197,-184,-181,-174,-163,-151,-130; /M: SY='S'; M= 44,-170,-166,-166,-180,-160,-170,-175,-166,-179,-173,-156,-171,-161,-171, 94, 63,-166,-190,-175; /M: SY='E'; M=-168,-186, 15, 100,-190,-175,-158,-189,-151,-185,-178, 71,-168, 51,-159,-160,-165,-185,-191,-179; /M: SY='Y'; M= 17,-187,-178,-179,-130,-181,-147,-165,-173,-162,-158,-178,-189,-168,-170,-170,-171,-168,-138, 140; /M: SY='L'; M=-167,-176,-188,-183,-156,-190,-181, 44,-181, 57, 56,-181,-184,-178,-182,-173, 36, 57,-185,-164; /M: SY='Y'; M=-172,-179,-185,-181, 40,-185,-164,-149,-179, 66, 67,-180,-187,-173,-177, 20,-168,-155,-161, 82; /M: SY='W'; M= 17,-189,-183,-177,-159,-170,-186,-180,-172,-180,-179, 36,-181,-170,-177, 49,-171,-184, 164,-147; /M: SY='R'; M=-172,-185,-169,-161,-175,-180,-161,-172, 18, 11, 66, 36,-181, 28, 97,-168,-169,-172,-183,-168; /M: SY='N'; M=-165,-180,-163,-163,-179, 20,-164,-172, 58, -13,-168, 71,-178,-157, 48, 20,-161, 13,-187,-174; /M: SY='K'; M=-170,-185, 53,-153,-186,-176, 58,-182, 73,-184,-174,-156, 69,-159,-154,-161, 55,-179,-191,-173; /I: I=-13; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34; /M: SY='W'; M=-179,-195, 25, 22,-163, -3,-178,-173,-175, 36,-168,-180,-187, 40,-178,-179,-181,-179, 126, 31; D=-13; /I: I=-13; DM=-34; /M: SY='N'; M=-169,-179,-164,-167,-171,-174, 47,-164,-155, 35,-160, 80,-183,-160, 68, 19,-162, 11,-190,-168; /M: SY='C'; M= 71, 107,-180,-175,-174,-169,-180,-164,-176, 10,-164,-172,-183,-174,-180, 20,-161, 11,-190,-177; /M: SY='K'; M=-171,-186,-163,-150,-186,-178, 58,-187, 105,-183,-171,-156,-173, 43, 35,-164,-167,-184,-182,-168; /M: SY='G'; M= 19,-181,-174,-181,-186, 101,-179,-181,-177,-184,-177,-161,-176,-175,-183,-157,-172, 12,-183,-183; /M: SY='F'; M=-182,-183,-192,-188, 118,-189,-168,-159,-183,-152,-159,-184,-192,-188,-180,-180,-176,-165, 71, 80; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='F'; M=-174,-178,-194,-188, 102,-191,-179, 19,-184, 10, 44,-185,-189,-187,-183,-180,-169, 49,-163,-141; /M: SY='T'; M=-158,-169,-165,-168,-176,-173,-174,-167,-165,-172,-168,-154,-167,-168,-173, 22, 122,-159,-195,-173; /M: SY='L'; M=-173,-176,-189,-183,-151,-192,-177, 16,-183, 92,-139,-185,-188,-178,-182,-178, 28,-146,-180,-162; /M: SY='K'; M= -5,-183,-168,-157,-181,-178,-167, 5, 84,-177,-169,-160,-174,-152, 76,-162, 36,-170,-183,-172; /M: SY='N'; M= 9,-178,-158,-173,-187, 81,-164,-189,-166,-190,-179, 98,-178,-166,-174,-154,-164,-185,-189,-182; /I: I=-17; MD=-42; /M: SY='H'; M=-176,-192, 53, 10,-190,-184, 59,-174,-173,-183,-179, 22,-187, 39,-177, 19,-171, 42,-207,-179; D=-17; /I: I=-17; MD=-42; /M: SY='N'; M=-176, 82,-164,-172,-171,-176, 44,-179, 29, 2,-170, 92,-188,-167,-167,-167,-167,-180,-188, 47; D=-17; /I: I=-17; MD=-42; /M: SY='D'; M=-178,-196, 97, 52,-202,-182,-172,-201,-169,-199,-196,-159,-181,-165,-177, 29,-172,-196,-211,-188; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; /M: SY='F'; M=-180,-187, 26,-184, 91,-192,-180,-157,-185,-160,-166,-184,-194,-189,-186,-183,-176, 48, 83, 46; D=-17; /I: I=-17; DM=-42; /M: SY='N'; M=-168, 70,-158, 7,-180, 20, 60,-180, 7, -13,-169, 82,-178, 40,-164,-159, 15,-178,-193,-173; /M: SY='W'; M=-168,-180, 26,-174,-160,-184,-181,-145,-178, 54,-153,-179, 37,-176,-181, 5,-165, 64, 86,-164; /M: SY='E'; M=-173,-185, 58, 64, 61,-181, 58,-177,-162,-171,-170,-161,-175, 29,-166,-165, 12,-177,-171, 54; /M: SY='W'; M=-168,-181,-168, 10,-170,-179,-172, 5, 66,-166, 59, 22,-174,-161,-157,-163, 55, 14, 94,-165; /I: I=-14; MD=-37; /M: SY='F'; M=-193,-199,-199,-193, 93,-198,-182,-177,-192,-172,-176,-196, 69,-197,-194,-190,-185,-182,-166, 53; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; /M: SY='T'; M=-188,-199,-192,-187, 20,-200,-191, 4,-175,-187,-184,-184, 33,-185, 51,-178, 65,-181,-200,-183; D=-14; /I: I=-14; DM=-37; /M: SY='M'; M= 43,-195, 37, 20,-195,-191,-190,-177,-186,-182, 59,-185,-194,-182,-191,-180,-181, 23,-209,-192; D=-14; /I: I=-14; DM=-37; /M: SY='C'; M= -6, 95,-190,-192,-188, 36,-192,-186,-190, 10,-180,-179,-195,-188,-195, 16, 13,-181,-203,-191; D=-14; /I: I=-14; DM=-37; /M: SY='P'; M= 11,-201,-189,-179,-199,-190,-191, 17, 54,-193,-186,-184, 65,-179,-175, 6,-179,-183,-201,-194; D=-14; /I: I=-14; DM=-37; /M: SY='Q'; M= -5, 49,-187,-175,-205,-189,-183,-200,-172,-199,-189,-181, 37, 69, 36, 28,-180,-196,-204,-193; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37; /M: SY='E'; M= 7,-187, 14, 66,-187,-175, 55,-187, 30,-184,-175, 22, 59,-153, 35,-163,-166,-183,-189,-175; /M: SY='N'; M=-164,-176, 27,-161,-176,-164,-158,-180, 20,-183,-175, 94,-175,-158,-162, 55, 43,-177,-188, 31; /M: SY='F'; M=-183,-179,-196,-191, 132,-190,-175,-156,-186,-148,-158,-184,-194,-197,-183,-182,-175,-162,-148,-126; /M: SY='H'; M=-170, 61, 30, 37, 40,-181, 82,-171,-162,-170,-168,-161,-177,-163, 26,-163, 55, 11,-188,-160; /M: SY='P'; M= 52,-182,-172,-163,-184,-171,-176, 4, 42,-178,-170,-169, 95,-167,-167,-160, 36,-167,-185,-180; /M: SY='C'; M=-171, 94, 51, 19, 72,-186,-178, 28,-176,-159,-163,-171,-185,-178,-180,-173,-167, 37,-179,-158; /M: SY='Y'; M=-175,-186,-177,-180,-132,-185,-150, 19,-173,-159,-157,-176,-186,-170,-172,-169, 36,-161,-142, 135; /I: I=-18; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='P'; M= 56,-178, 29,-167,-175,-171,-177, 27,-172, -2,-163,-169, 64,-170,-178, 8, 13, -1,-187,-175; /M: SY='D'; M= 33,-182, 101, 8,-186,-169,-163,-182, 9, -14,-177, 37,-175,-160,-166,-160,-163,-178,-197,-177; /M: SY='D'; M=-167,-185, 71, 11,-191, 57,-164,-191, 54,-189,-180, 36,-173, 29,-158,-160,-167,-188,-189,-178; /M: SY='T'; M=-162,-174, 44, 24,-181,-170,-166,-175,-161,-179,-174, 53,-169,-161,-169, 29, 96,-169,-197,-175; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='D'; M=-173,-183, 110,-146,-191,-166,-157,-190,-160,-192,-186, 91,-177,-160,-168,-159,-161,-189,-208,-179; /M: SY='I'; M=-167,-179,-192,-187,-158,-194,-187, 83,-183, 2, 56,-185,-184,-181,-185,-178,-163, 73,-186,-165; /M: SY='F'; M=-179,-179,-189,-186, 109,-189,-168,-154,-182, 29,-153,-182,-190,-185,-180,-177, 13,-159,-152, 68; /M: SY='D'; M= -6,-182, 77, 23,-188,-169,-162,-187, 69,-187,-179, 52,-172,-154,-153, 18,-161,-182,-192,-177; /M: SY='P'; M=-166,-186,-168, 22,-178,-176,-171, 19, 30, 10,-165,-168, 86, 27,-165, 47,-162,-168,-184,-176; /M: SY='D'; M= -4,-185, 85, 80,-192,-173,-160,-189,-155,-186,-181, 45,-170, 31,-163,-160,-164,-184,-195,-179; /M: SY='N'; M=-169,-176,-149,-168,-177,-163,-157, 19,-160,-175,-169, 126,-181,-162,-168,-156,-156, 23,-200,-176; /M: SY='I'; M=-168,-184,-186,-177,-162,-192,-184, 98,-176,-146,-147,-178,-181, 67,-178,-174,-165, 50,-184,-166; /M: SY='E'; M= 11,-183, 15, 65, 41,-177,-164,-177, 20, -13,-169, 36,-175,-155, 53,-164,-167,-175,-180,-165; /M: SY='S'; M=-161,-182, 50, 52,-187,-169, 56,-187, 21,-184,-177,-153,-171, 42,-159, 76,-157,-182,-191,-171; /M: SY='F'; M=-179,-179,-194,-189, 110,-192,-177, 29,-186, 48,-149,-186,-191,-189,-184,-183,-173,-151,-158,-137; /M: SY='C'; M= 7, 69,-162, 45,-174,-171,-165,-172,-160,-175,-170, 36,-177, 27, 15, 53,-159, 15,-184, 31; /M: SY='S'; M= 9,-179,-161, 46,-178,-170,-165, 28, 6,-168, 58, 22,-172, 40,-163, 65,-157,-164,-186,-172; /M: SY='T'; M=-170,-179,-172,-167,-160,-182, 45,-162, 54, 48,-155,-165,-178,-163, 12,-163, 68,-163,-177, 47; /I: I=-22; MD=-57; /M: SY='V'; M=-183,-197,-210,-206,-177,-212,-211, 69,-202,-161,-164,-203,-202,-202,-204,-195,-179, 69,-206,-185; D=-22; /I: I=-22; MD=-57; /M: SY='M'; M=-203,-209,-210,-199, 28,-215,-200,-185, 45, 24, 46,-203,-211,-195,-186,-205,-199,-189,-202,-185; D=-22; /I: I=-22; MI=-57; MD=-57; IM=-57; DM=-57; /M: SY='K'; M= -6,-210,-197,-188,-197,-200,-192,-209, 59,-208,-200,-190,-204,-184,-177, 21,-190,-204,-199, 42; D=-22; /I: I=-22; DM=-57; /M: SY='H'; M=-189,-208,-179, 21,-211, -3, 47,-212, 6,-208,-197, 32,-197, 44,-180, 5,-188,-209,-213,-195; D=-22; /I: I=-22; DM=-57; /M: SY='T'; M=-172,-182,-176,-178,-187,-187,-184,-179,-170,-183,-178,-166,-179,-177, 24,-156, 111,-171,-205,-183; D=-22; /I: I=-22; DM=-57; /M: SY='C'; M=-170, 114, 58, 8,-177, -2,-167,-187, 6,-182,-177, 33,-183,-165, 26,-165,-167,-181,-189, 33; /M: SY='G'; M=-161,-184, 28,-168,-188, 90,-172,-192, 29,-189,-180,-156,-175,-166, 28,-158, 12,-186,-184,-180; /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='N'; M=-172,-181,-156, 30, 28,-174, 59,-176, 59, 3,-167, 82,-177,-155, 12,-164,-165,-177,-184,-163; /M: SY='G'; M= 19,-181,-165,-174,-188, 89,-169,-191,-165,-189,-179, 64,-177,-167, 27,-156,-168,-185,-185,-182; /I: I=-7; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='C'; M= 39, 96,-187,-181,-167,-181,-187,-143,-180, -1,-156,-180,-187,-182,-183,-168,-161, 84,-194,-174; /M: SY='H'; M= -6,-188, 79,-149,-186,-175, 112,-190,-156,-181,-171,-151,-176, 64, 35,-162,-169,-187,-198,-162; /M: SY='L'; M=-176,-177,-193,-185, 55,-193,-176,-142,-186, 94,-139,-190,-192,-181,-183,-184,-171,-149,-172,-153; /M: SY='V'; M= 9, 59,-189,-183, 29,-185,-183, 21,-180,-148, 75,-181,-185,-181,-182,-172,-162, 82,-185,-163; /M: SY='M'; M=-166,-175,-187,-181,-158,-188,-177, 17,-178, 35, 98,-179,-182,-176,-179,-171, 42, 64,-187,-164; /M: SY='A'; M= 96, 62,-175,-170,-183, 9,-177,-176,-172,-177,-171,-167,-176,-168,-176, 8,-160,-164,-185,-180; /M: SY='D'; M=-175,-189, 129,-138,-196,-172,-161,-194,-162,-192,-191,-143,-174,-162,-171,-163,-165,-191,-211,-178; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='G'; M=-155,-182,-171,-181,-189, 106,-177,-196,-175,-193,-182,-157,-175,-172,-182, 29,-170,-189,-182,-184; /M: SY='F'; M=-176,-179,-192,-188, 112,-191,-180, 47,-184,-147,-154,-181,-188,-190,-184,-177, 12, 23,-159,-138; /M: SY='D'; M= -5, 47, 93,-155, 33, 9,-166,-184,-167,-182,-180, 33,-178,-166,-174, 36,-161,-180,-191,-170; /M: SY='V'; M=-161,-173,-186,-182, 31,-189,-188,-133,-179,-150,-153,-179,-183,-183,-182,-168, 47, 102,-188,-163; /I: I=-28; MD=-71; /M: SY='D'; M=-175,-189, 77, 10,-181, 9,-166,-188,-168,-189,-183, 45, 44,-168,-176,-165, 26,-186,-189, 45; D=-28; /I: I=-28; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; /M: SY='G'; M=-161,-186,-175,-186,-193, 101,-183,-197,-180,-194,-185,-162,-179,-179,-188,-159, 35,-190,-187,-188; D=-28; /I: I=-28; DM=-71; /M: SY='K'; M=-171,-186, 51, 50,-189,-176,-161,-189, 77,-186,-177, 35,-172, 31, 36,-163,-165,-185,-188,-175; /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='E'; M=-168,-186,-145, 108,-181,-181,-164,-176,-154,-178,-175, 37,-168,-148,-163,-165,-166, 22, 71,-174; /M: SY='N'; M= 9,-174,-146,-164,-184,-157,-153,-182,-157,-189,-177, 127,-179,-158,-165, 17,-153,-181,-200,-179; /M: SY='F'; M= -5, 62, 29, 31, 65,-183, 58, 36,-168, -2,-160,-169,-182,-168, 11,-171,-169,-161,-178,-156; /M: SY='Q'; M=-167,-192,-162,-141,-197,-175,-155,-183,-147,-178,-165,-157,-174, 143,-147,-156,-169,-185,-180,-168; /M: SY='E'; M=-167,-189,-138, 122,-191,-184,-161,-192,-149,-184,-180,-164,-163,-141,-159,-164,-168,-184,-188,-181; /M: SY='I'; M=-171,-181,-176, 20, 17,-188,-173, 59,-165, 47,-150,-174,-180, 28, 36,-170, 35,-150,-179,-162; /M: SY='I'; M=-170,-180,-185,-181,-156,-187, 56, 70,-180, 63, 55,-177,-183,-173,-179, 19,-166,-143,-183,-161; /M: SY='S'; M= 9,-174,-167,-169,-170,-167, 44,-165,-168, 28, 58, 45,-176,-162,-171, 76, 12,-164,-189,-168; /M: SY='K'; M=-171, 69,-170,-157, 41,-180,-167,-174, 89, 2,-165,-163,-178, 70,-147,-167,-168,-174,-176,-163; /M: SY='Q'; M=-172,-192, 38,-149,-190,-178,-159,-187,-142,-183,-171,-160, 36, 99, 90,-163,-170,-185,-185,-172; /M: SY='L'; M=-174,-178,-192,-185,-149,-195,-179, 48,-186, 93,-137,-190,-190,-179,-184,-184,-170,-142,-179,-161; /M: SY='Y'; M=-171,-181,-188,-186,-146,-192,-173, 69,-182, 30,-146,-185,-187,-178,-181,-178,-166, 56,-166, 85; /M: SY='L'; M= 9,-177,-188,-181,-148,-186,-169,-145,-181, 84, 67,-185,-188,-174,-179,-178,-169,-151,-171, 53; /M: SY='C'; M=-167, 151,-183,-182,-181, 19,-184,-187, 21,-179,-177,-170,-192,-183,-179,-169,-169,-176,-201,-187; /M: SY='Q'; M=-168,-189,-156, 68,-187,-179,-158,-178,-150, 3,-164,-162,-172, 122,-153,-160,-169,-179,-182,-171; /M: SY='C'; M=-171, 100,-189,-186, 54,-187,-187, 47,-181, -12,-158,-179,-187,-184,-185,-173, 36, 16, 94,-156; /M: SY='L'; M=-171,-180,-179, 22,-157,-190,-173, 5,-174, 81,-143,-181,-184, 52,-174,-177,-169, 14,-181,-164; /M: SY='T'; M=-162,-173,-175,-175,-164,-180,-178, 20,-173, 37,-154,-166,-176,-172,-177, 28, 89, 31,-189,-169; /M: SY='M'; M= 73,-175,-180,-175,-171, 9,-176, 54,-174,-157, 86,-171,-176,-169,-177, 6,-162,-150,-183,-171; /M: SY='L'; M=-171,-176,-192,-185, 29,-193,-179,-137,-185, 86,-140,-189,-191,-181,-183,-182,-168, 49,-178,-158; /M: SY='C'; M= 11, 76, 29, 19,-175,-179,-173, 28, 29,-165, 46,-165,-177,-164, 12,-164, 26, 12,-190,-173; /M: SY='C'; M=-166, 112,-187,-185,-164,-189,-188, 36,-182, 10,-155,-179,-188,-184,-186,-171, 23, 67,-194,-173; /M: SY='L'; M=-172,-178,-192,-186,-151,-194,-181, 48,-185, 84,-139,-189,-189,-180,-184,-182,-168, 31,-181,-163; /M: SY='R'; M=-170,-189,-170,-161,-185, 38,-163,-191, 21,-185,-174,-162,-180,-151, 113,-166,-173,-185,-183,-173; /M: SY='P'; M=-171,-192,-169, 8,-187,-179,-171,-174, 7,-181,-172,-172, 107, 27, 54,-169,-167, 14,-186,-180; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='G'; M=-157,-184,-172,-184,-190, 112,-179,-198,-177,-194,-183,-158,-176,-175,-185,-157,-176,-192,-181,-185; /M: SY='N'; M=-167, 69,-154,-166,-180,-166, 83,-182,-162,-182,-172, 105,-179,-161,-167, 6, 48,-179,-203,-171; /M: SY='F'; M= 11, 70,-188,-184, 116,-181,-176,-163,-182,-155,-163,-177,-189,-187,-182, 20,-168,-164,-158,-137; /M: SY='V'; M=-164,-176,-192,-186, 18,-193,-190, 49,-184, -12,-148,-186,-186,-185,-185,-176,-161, 97,-186,-163; /M: SY='C'; M=-170, 131,-188,-185,-162,-187,-182,-158,-183, 66,-153,-179,-193,-184,-186,-174, 15,-159,-192,-174; /M: SY='K'; M=-170,-184,-162,-149,-186,-177,-166,-187, 121,-186,-173,-155,-170,-147,-131,-164,-165,-182,-180,-173; /M: SY='V'; M=-169,-177,-190,-185, 54,-192,-184, 48,-183, 44,-146,-183,-186,-183,-184,-176, 12, 64,-177,-156; /M: SY='F'; M=-183,-179,-196,-191, 132,-190,-175,-156,-186,-148,-158,-184,-194,-197,-183,-182,-175,-162,-148,-126; /M: SY='D'; M=-175,-189, 129,-138,-196,-172,-161,-194,-162,-192,-191,-143,-174,-162,-171,-163,-165,-191,-211,-178; /M: SY='C'; M= 18, 69,-181,-178,-163,-182,-181, 19,-177, 45,-153,-173,-181,-177,-181,-163, 68, 30,-189,-170; /M: SY='F'; M=-182,-180,-192,-188, 119,-190,-168,-156,-184, 2,-155,-184,-193,-189,-181,-181,-174,-161,-147, 69; /M: SY='T'; M= 10,-173,-161, 31,-180,-169,-170,-173,-161,-176,-171,-156,-168, 27,-168, 54, 97,-165,-191,-174; /M: SY='P'; M=-170,-191, 44, 22,-189,-175, 68,-186,-160,-187,-177,-163, 101,-161, 27, 21,-165,-186,-192,-176; /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; /M: SY='F'; M=-175,-178,-179,-178, 116,-180,-170,-163, 30,-157,-163, 36,-186,-178,-169, 19,-167,-167,-157,-137; /M: SY='T'; M=-155,-170,-164,-166,-178,-167,-171,-172,-165,-176,-171,-153,-168,-163,-171, 81, 104,-164,-193,-173; /M: SY='I'; M= 38,-179,-186,-180, 32,-183,-183, 75,-171,-151,-153,-179,-182,-175, 35,-170,-164, 53,-180,-162; /M: SY='G'; M= 18,-182,-166, 37,-187, 84,-173,-178,-167,-181,-174,-162,-174, 52,-173,-158,-170, 14,-183,-180; /M: SY='L'; M=-172,-177,-192,-185,-151,-193,-177, 28,-184, 84, 67,-188,-188,-177,-182,-182,-168, 15,-181,-161; /M: SY='L'; M=-168, 47,-191,-185,-155,-193,-183, 5,-184, 71,-143,-187,-190,-182,-184,-179,-165, 71,-186,-166; /M: SY='Y'; M=-177,-187,-170, 22, 40,-181,-153,-169,-169,-165,-163, 45,-186,-167,-170,-171,-172,-173, 86, 121; /M: SY='L'; M=-171,-180,-186,-180,-156,-188,-176, 62,-172, 73,-144,-180,-185,-172, 36, 20,-166,-145,-181,-164; /M: SY='M'; M=-171,-176,-188,-182, 67,-187,-172,-145,-179, 45, 107,-179,-183,-176,-178,-174, 35, 11,-173,-151; /M: SY='Y'; M= -5,-177,-174,-175,-150,-178,-164, 20,-171,-161,-159,-168,-178,-170,-174, 18, 73, 23,-163, 98; /M: SY='Q'; M= -4,-183,-163,-155,-182,-172, 67,-180, 22, -14,-166, 45,-177, 84, 50, 20,-164,-178,-187,-167; /M: SY='C'; M=-169, 95,-173,-175,-166,-179, 92,-161,-174, 51,-156, 36,-186,-170,-175, 21,-165, -1,-195,-164; /M: SY='F'; M=-182,-182,-190,-188, 117,-189,-164,-158,-182,-151,-158,-183,-193,-187,-179,-179,-174,-164,-144, 92; /M: SY='E'; M=-165,-186, 29, 88,-190, 13,-161,-190,-152,-186,-179, 22,-170, 39, 24, 20,-165,-184,-189,-178; /M: SY='K'; M=-165,-183,-154, 65,-186,-173,-162,-187, 68,-185,-176, 24,-171,-148, 49, 52,-160,-181,-186,-175; /M: SY='W'; M=-170,-180,-191,-186, 74,-190,-188, 58,-182,-150,-154,-183,-185,-185,-184,-175, 24, 61, 95,-149; /M: SY='C'; M=-160, 114,-174,-171,-170,-173,-170,-169,-170,-172,-169,-165,-183, 51,-173, 72,-158, 23,-184, 45; /M: SY='I'; M=-170,-181,-193,-189,-155,-196,-189, 95,-185, 35,-143,-186,-185,-182,-187,-180,-165, 48,-183,-164; /M: SY='V'; M=-168,-178,-182,-181, 56,-188, 45, 41,-178,-152,-154,-174,-183,-178,-179,-168, 49, 64,-171, 54; /M: SY='K'; M=-170,-184,-162,-149,-186,-177,-166,-187, 121,-186,-173,-155,-170,-147,-131,-164,-165,-182,-180,-173; /M: SY='P'; M=-174,-199,-174,-163,-194,-176,-177,-181,-170,-192,-178,-181, 136,-174,-183,-171,-166,-187,-187,-191; /M: SY='F'; M= 11,-182,-177,-173, 59,-180, 45, 4,-167, 1,-159, 24, 45,-171, 35,-170,-167, 14,-172, 31; /M: SY='S'; M=-156,-173,-163,-163,-179,-166, 67,-177,-163,-178,-171,-153,-170, 27,-167, 89, 78,-170,-193,-168; /M: SY='S'; M=-148,-171,-163,-164,-182,-157,-166,-181,-164,-185,-178,-152,-171,-156,-169, 120,-143,-174,-190,-174; /M: SY='R'; M=-175,-191,-171,-159,-183,-185,-160,-190,-131,-182,-171,-164,-183,-147, 127,-169,-173,-184,-183,-170; /M: SY='P'; M=-172,-195,-176,-165,-188,-177,-179,-170,-172,-183,-174,-181, 130,-175,-183,-171,-165, 22,-188,-188; /M: SY='A'; M= 99,-170,-178,-170,-176,-162,-178,-160,-173, -2,-162,-173,-177,-169,-176,-153,-160, 22,-184,-176; /M: SY='N'; M=-170,-175,-143,-164,-184,-158,-150,-184,-155,-191,-177, 136,-181,-157,-164,-152,-154,-186,-204,-180; /M: SY='S'; M= 39,-171,-165,-165,-182,-157,-168,-180,-165,-183,-176,-155,-172,-158,-170, 111,-146,-170,-189,-175; /M: SY='E'; M=-167,-189,-138, 122,-191,-184,-161,-192,-149,-184,-180,-164,-163,-141,-159,-164,-168,-184,-188,-181; /M: SY='R'; M=-175,-191,-171,-159,-183,-185,-160,-190,-131,-182,-171,-164,-183,-147, 127,-169,-173,-184,-183,-170; /M: SY='Y'; M=-179,-189,-179,-182, 18,-186,-146,-163,-174,-160,-157,-180,-191,-170,-171,-174,-173,-169,-135, 143; /M: SY='L'; M=-173,-179,-193,-187,-152,-195,-182, 74,-186, 78,-139,-188,-188,-180,-185,-183,-168, 1,-180,-162; /M: SY='V'; M=-164,-177,-192,-187,-160,-194,-193, 75,-184,-144,-147,-185,-185,-184,-186,-176,-161, 95,-190,-167; /M: SY='C'; M=-168, 158,-187,-188,-180, -3,-188,-187,-184,-177,-177,-173,-197,-191,-190,-170,-169,-174,-206,-189; /M: SY='K'; M=-172,-184,-169, 20, 41,-184,-169, 27, 73, 25,-158,-167,-177, 44, 12,-170,-168,-162,-175,-161; /M: SY='N'; M=-164,-181, 27,-167,-188, 74,-162,-191,-161,-192,-180, 98,-178,-163, 15,-156,-164,-189,-192,-181; /M: SY='F'; M=-176,-182,-180,-169, 80,-187,-169,-162, 50, 40,-157,-173,-185,-164, 70,-175,-171,-165,-168,-150; /M: SY='L'; M=-170,-180,-180,-170,-161,-188,-173, 28, 9, 63,-148,-175,-183, 40, 42,-172, 11, 14,-182,-165; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RrmJ-type SAM-dependent 2'-O-MTase |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
CMTR1_AILME (D2HRF1), CMTR1_BOVIN (A2VE39), CMTR1_DANRE (Q803R5), CMTR1_DROME (Q9W4N2), CMTR1_HUMAN (Q8N1G2), CMTR1_MOUSE (Q9DBC3), CMTR1_PONAB (Q5R981), CMTR1_RAT (Q5U2Z5), CMTR1_XENLA (Q6GQ76), CMTR_NPVAC (P41469), MTR1A_CAEBR (A8XYX2), MTR1B_CAEBR (A8XYX3), MTR1_CAEEL (Q9NAA5), MTR1_DICDI (Q54WR1), MTR1_LEIBR (A4HQI9), MTR1_LEIMA (Q4Q089), MTR1_TRYB2 (Q38AH0), MTR1_TRYCC (Q4E123)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
4N48; 4N49; 4N4A; 8P4E; 8P4F |